EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30064 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:41901925-41903761 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr5:41902532-41902547TATTAATTATTAATT-6.17
LMX1BMA0703.2chr5:41902344-41902355AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr5:41902343-41902354TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr5:41902532-41902546TATTAATTATTAAT-6.15
POU4F1MA0790.1chr5:41902539-41902553TATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr5:41902533-41902549ATTAATTATTAATTAT+6.14
POU4F3MA0791.1chr5:41902530-41902546ATTATTAATTATTAAT-6.2
POU4F3MA0791.1chr5:41902537-41902553ATTATTAATTATTTAT-6.2
PROP1MA0715.1chr5:41902343-41902354TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr5:41902343-41902354TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr5:41902343-41902354TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr5:41902610-41902626GGTTGCTATAGCAACG+6.82
RFX1MA0509.2chr5:41902610-41902626GGTTGCTATAGCAACG-6.82
RFX2MA0600.2chr5:41902610-41902626GGTTGCTATAGCAACG-7.37
RFX2MA0600.2chr5:41902610-41902626GGTTGCTATAGCAACG+7.4
RFX3MA0798.1chr5:41902610-41902626GGTTGCTATAGCAACG-7.17
RFX3MA0798.1chr5:41902610-41902626GGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX4MA0799.1chr5:41902610-41902626GGTTGCTATAGCAACG-6.65
RFX4MA0799.1chr5:41902610-41902626GGTTGCTATAGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr5:41902610-41902626GGTTGCTATAGCAACG+7.59
RFX5MA0510.2chr5:41902610-41902626GGTTGCTATAGCAACG-7.71
Enhancer Sequence
ATTCGGCAGG TGAACTTTTG TGCTTTCTAG CCCTTGAGTG AACACAAAGT CCCTTAAAAA 60
GCCTTCACAT ACATCCAAAA TAACGAAAAC ATTAATAAAA CTTAATAATA TTGAATCTGA 120
AAACAAGAGC AAATGAAAAG TACATAAATA TGACTGAACC ATGTAGCCTA CCAGATGATG 180
ATACAAACGG CCATGTGATC TGAAATCGTG CGTAGACCAT AGACTGTAAA ATATAGGCAT 240
AGACATAGAA ATTGTGAACG ATTTAATTTA CTTTCTATTA TTTACAATAA TAAACTTTTT 300
TTAAAACTTA TATTCCTAAT ATCTACGTGA GCAGTTAGCA CTGTACGTGT AATTAACCAG 360
CATGCACTTA CATTGCTTGG GCCACTAATA GAAAATATAT GAGTTAATTT TATTATTTTA 420
ATTTAATTAA TTCCTAAATA GCTGTACATT TTACAAAGTC AAACCTTGTC AAACCAATCT 480
TGCTCATTTA GCATTATTAT TACAGTTTCG TGAATTATAA ATTAATTGAT TTAAACTTCA 540
TTATTATTAT TATTATTATT ACTATTATTA TTATTATTAT TATTATAATA ACTATGTTAT 600
TTATTATTAT TAATTATTAA TTATTTATAT GTTGAGATGA GATGAATCGT TTACTCACGT 660
GATTCAGATT GGCGATTCAA ATTGTGGTTG CTATAGCAAC GCGTGTTATG ATTTGACTCC 720
ATATATAAAC ACCGAGACTC GCCGCTATCT GTTGATTGAG GAGAGGCGAA TTTCTGAGAC 780
ATTTGCTGAG GATTACTGTG CTGATACTGC GATTCTTCAA GGAGACCAGA GAATTTCTGA 840
CAGAAGACTT TTATTTTACA AGGAGATCGA CGCTCAGAGC TGAAATTATT CCTTTTGACA 900
CGTTTTGTTG CTCTTTTGTT GTGTTTATTT TGATTTTGAT CTTGTTTTTA TTGACATTTT 960
TATTGATATT TGATCTTTGT TCTTGTTTTC AGGTTTGCTG GAGTTTGGAG GAGTTTGTCA 1020
GATGGGTGAA AACCGCAGTG AGTGTTTTAG TTTTTATTTG TTTATGATCA ATCATGACAT 1080
GATGTTGTGT AATGTTTGGG GAAATGTGAT GTAAATAAAC TGGTACAAAT GAACCCATTT 1140
CAACACAACT GTTCCCCGAT ATAAGTGATC AGATGTCTTT TATTCTCTGT AGATGCAGCT 1200
ACTAAAGTTA ATTGTTGATT AATTCTTATA ATCTTATAAT AAACGTGATA TGTTGTTGTT 1260
GTTGTTGTCG TTGTCTCAGG CCGCTCCAGA TCCAGGAGTT CTGCTTTCAT CCAGGCAGCT 1320
GTTCAGGACG TCAGGACACA TGATGGTGAT GGTGAAACCC AGACCGTGAG CCAAGAGCTT 1380
GATGGATTTC TCGCACCTCT GCCTTCCCTG TTGGCCAAAT CTGTGTCCAC AGATCAGGGT 1440
AACAGGAAGA GGAAGCGGCA GAGCGGCAGC CAGCAAACAC CAGAAGATGA ACGTCCGTCC 1500
ACCTCATCTA GAAGAGCTCT CAAACGCTCT CGCAGAGGTC AGAATGGCTT TTTGAAGAAG 1560
TGATGATGAT GTTTCAGTAA TGCTCTTTTA CAGTTTTCTC TACTGCTGCA TGTTTTCTTT 1620
GAACACACAT TTCTACTGCT CCTCTGTGTT GCAGACGCGT ATGCAAAGGG CCCACTGCTG 1680
GGAGACGGTG GATTTGGCTC TGTGTTTGCT GGGATGCGCA GGTCTGATGG ACTGCCAGTA 1740
AGTCGTTTTC TCCGCTCTTC ATTCAAACAG CCTTTAGAAA TCCTGATCTC AGTAAATGTG 1800
ATGTGTGAGG ATCAGGCAGG TGTGATTTAT TATGCT 1836