EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30062 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:41895070-41896172 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr5:41895147-41895158AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr5:41895146-41895157TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr5:41895335-41895349TATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr5:41895333-41895349ATTATTAATTATTTAT-6.2
PROP1MA0715.1chr5:41895146-41895157TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr5:41895146-41895157TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr5:41895146-41895157TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr5:41895413-41895429GGTTGCTATAGCAACG+6.82
RFX1MA0509.2chr5:41895413-41895429GGTTGCTATAGCAACG-6.82
RFX2MA0600.2chr5:41895413-41895429GGTTGCTATAGCAACG-7.37
RFX2MA0600.2chr5:41895413-41895429GGTTGCTATAGCAACG+7.4
RFX3MA0798.1chr5:41895413-41895429GGTTGCTATAGCAACG-7.17
RFX3MA0798.1chr5:41895413-41895429GGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX4MA0799.1chr5:41895413-41895429GGTTGCTATAGCAACG-6.65
RFX4MA0799.1chr5:41895413-41895429GGTTGCTATAGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr5:41895413-41895429GGTTGCTATAGCAACG+7.59
RFX5MA0510.2chr5:41895413-41895429GGTTGCTATAGCAACG-7.71
Enhancer Sequence
GTACGTGTAA TTAACCAGCA TGCACTTACA TTGCTTGGGC CACTAATAGA AAATATATGA 60
GTTAATTTTA TTATTTTAAT TTAATTAATT CCTAAATAGC TGTACATTTT ACAAAGTCAA 120
ACCTTGTCAA ACCAATCTTG CTCATTTAGC ATTATTATTA CAGTTTCGTG AATTATAAAT 180
TAATTGATTT AAACTTCATT ATTATTATTA TTATTATTAC TATTATTATT ATTATTATTA 240
TTATTATAAC TATGTTATTT ATTATTATTA ATTATTTATT ATTTATATGT TGAGATGAGA 300
TGAATCGTTT ACTCACGTGA TTCAGATTGG CGATTCAAAT TGTGGTTGCT ATAGCAACGC 360
GTGTTATGAT TTGACTCCAT ATATAAACAC CGAGACTCGC CGCTATCTGT TGATTGAGGA 420
GAGGCGAATT TCTGAGACAT TTGCTGAGGA TTACTGTGCT GATACTGCGA TTCTTCAAGG 480
AGACCAGAGA ATTTCTGACA GAAGACTTTT ATTTTACAAG GAGATCGACG CTCAGAGCTG 540
AAATTATTCC TTTTGACACG TTTTGTTGCT CTTTTGTTGT GTTTATTTTG ATTTTGATCT 600
TGTTTTTATT GACATTTTTA TTGATATTTG ATCTTTGTTC TTGTTTTCAG GTTTGCTGGA 660
GTTTGGAGGA GTTTGTCAGA TGGGTGAAAA CCGCAGTGAG TGTTTTAGTT TTTATTTGTT 720
TATGATCAAT CATGATATGA TGTTGTGTAA TGTTTGGGGA AATGTGATGT AAATAAACTG 780
GTACAAATGA ACCCATTTCA ACACAACTGT TCCCCGATAT AAGTGATCAG ATGTCTTTTA 840
TTCTCTGTAG ATGCAGCTAC TAAAGTTAAT TGTTGATTAA TTCTTATAAT CTTATAATAA 900
ACGTGATATG TTGTTGTTGT TGTTGTCGTT GTCTCAGGCC GCTCCAGATC CAGGAGTTCT 960
GCTTTCATCC AGGCAGCTGT TCAGGACGTC AGGACACATG ATGGTGATGG TGAAACCCAG 1020
ACCGTGAGCC AAGAGCTTGA TGGATTTCTC GCACCTCTGC CTTCCCTGTT GGCCAAATCT 1080
GTGTCCACAG ATCAGGGTAA CA 1102