EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30056 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:41880616-41881876 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr5:41880744-41880755AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr5:41880743-41880754TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr5:41880932-41880946TATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr5:41880930-41880946ATTATTAATTATTTAT-6.2
PROP1MA0715.1chr5:41880743-41880754TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr5:41880743-41880754TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr5:41880743-41880754TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr5:41881010-41881026GGTTGCTATAGCAACG+6.82
RFX1MA0509.2chr5:41881010-41881026GGTTGCTATAGCAACG-6.82
RFX2MA0600.2chr5:41881010-41881026GGTTGCTATAGCAACG-7.37
RFX2MA0600.2chr5:41881010-41881026GGTTGCTATAGCAACG+7.4
RFX3MA0798.1chr5:41881010-41881026GGTTGCTATAGCAACG-7.17
RFX3MA0798.1chr5:41881010-41881026GGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX4MA0799.1chr5:41881010-41881026GGTTGCTATAGCAACG-6.65
RFX4MA0799.1chr5:41881010-41881026GGTTGCTATAGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr5:41881010-41881026GGTTGCTATAGCAACG+7.59
RFX5MA0510.2chr5:41881010-41881026GGTTGCTATAGCAACG-7.71
Enhancer Sequence
AAACTTTTTT TAAAACTTAT ATTCCTAATA TCTACGTGAG CAGTTAGCAC TGTACGTGTA 60
ATTAACCAGC ATGCACTTAC ATTGCTTGGG CCACTAATAG AAAATATATG AGTTAATTTT 120
ATTATTTTAA TTTAATTAAT TCCTAAATAG CTGTACATTT TACAAAGTCA AACCTTGTCA 180
AACCAATCTT GCTCATTTAG CATTATTATT ACAGTTTCGT GAATTATAAA TTAATTGATT 240
TAAACTTCAT TATTATTATT ATTATTATTA CTATTATTAT TATTATTATT ATTATTATAA 300
CTATGTTATT TATTATTATT AATTATTTAT TATTTATATG TTGAGATGAG ATGAATCGTT 360
TACTCACGTG ATTCAGATTG GCGATTCAAA TTGTGGTTGC TATAGCAACG CGTGTTATGA 420
TTTGACTCCA TATATAAACA CCGAGACTCG CCGCTATCTG TTGATTGAGG AGAGGCGAAT 480
TTCTGAGACA TTTGCTGAGG ATTACTGTGC TGATACTGCG ATTCTTCAAG GAGACCAGAG 540
AATTTCTGAC AGAAGACTTT TATTTTACAA GGAGATCGAC GCTCAGAGCT GAAATTATTC 600
CTTTTGACAC GTTTTGTTGC TCTTTTGTTG TGTTTATTTT GATTTTGATC TTGTTTTTAT 660
TGACATTTTT ATTGATATTT GATCTTTGTT CTTGTTTTCA GGTTTGCTGG AGTTTGGAGG 720
AGTTTGTCAG ATGGGTGAAA ACCGCAGTGA GTGTTTTAGT TTTTATTTGT TTATGATCAA 780
TCATGATATG ATGTTGTGTA ATGTTTGGGG AAATGTGATG TAAATAAACT GGTACAAATG 840
AACCCATTTC AACACAACTG TTCCCCGATA TAAGTGATCA GATGTCTTTT ATTCTCTGTA 900
GATGCAGCTA CTAAAGTTAA TTGTTGATTA ATTCTTATAA TCTTATAATA AACGTGATAT 960
GTTGTTGTTG TTGTTGTCGT TGTCTCAGGC CGCTCCAGAT CCAGGAGTTC TGCTTTCATC 1020
CAGGCAGCTG TTCAGGACGT CAGGACACAT GATGGTGATG GTGAAACCCA GACCGTGAGC 1080
CAAGAGCTTG ATGGATTTCT CGCACCTCTG CCTTCCCTGT TGGCCAAATC TGTGTCCACA 1140
GATCAGGGTA ACAGGAAGAG GAAGCGGCAG AGCGGCAGCC AGCAAACACC AGAAGATGAA 1200
CGTCCGTCCA CCTCATCTAG AAGAGCTCTC AAACGCTCTC GCAGAGGTCA GAATGGCTTT 1260