EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30054 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:41873016-41875035 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr5:41873541-41873552AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr5:41873540-41873551TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr5:41873729-41873743TATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr5:41873727-41873743ATTATTAATTATTTAT-6.2
PROP1MA0715.1chr5:41873540-41873551TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr5:41873540-41873551TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr5:41873540-41873551TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr5:41873807-41873823GGTTGCTATAGCAACG+6.82
RFX1MA0509.2chr5:41873807-41873823GGTTGCTATAGCAACG-6.82
RFX2MA0600.2chr5:41873807-41873823GGTTGCTATAGCAACG-7.37
RFX2MA0600.2chr5:41873807-41873823GGTTGCTATAGCAACG+7.4
RFX3MA0798.1chr5:41873807-41873823GGTTGCTATAGCAACG-7.17
RFX3MA0798.1chr5:41873807-41873823GGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX4MA0799.1chr5:41873807-41873823GGTTGCTATAGCAACG-6.65
RFX4MA0799.1chr5:41873807-41873823GGTTGCTATAGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr5:41873807-41873823GGTTGCTATAGCAACG+7.59
RFX5MA0510.2chr5:41873807-41873823GGTTGCTATAGCAACG-7.71
Enhancer Sequence
TTAGTGATGA AAACAGCTAT TTAGATTCAT ACAAACAGAA ATAATGTATT TATAAACTTG 60
CACCTTTCTG CTGTGGACGC CATCTTGTGG TCAGACGCGG GAACTCATTC GGCAGGTGAA 120
CTTTTGTGCT TTCTAGCCCT TGAGTGAACA CAAAGTCCCT TAAAAAGCCT TCACATACAT 180
CCAAAATAAC GAAAACATTA ATAAAACTTA ATAATATTGA ATCTGAAAAC AAGAGCAAAT 240
GAAAAGTACA TAAATATGAC TGAACCATGT AGCCTACCAG ATGATGATAC AAACGGCCAT 300
GTGATCTGAA ATCGTGCGTA GACCATAGAC TGTAAAATAT AGGCATAGAC ATAGAAATTG 360
TGAACGATTT AATTTACTTT CTATTATTTA CAATAATAAA CTTTTTTTAA AACTTATATT 420
CCTAATATCT ACGTGAGCAG TTAGCACTGT ACGTGTAATT AACCAGCATG CACTTACATT 480
GCTTGGGCCA CTAATAGAAA ATATATGAGT TAATTTTATT ATTTTAATTT AATTAATTCC 540
TAAATAGCTG TACATTTTAC AAAGTCAAAC CTTGTCAAAC CAATCTTGCT CATTTAGCAT 600
TATTATTACA GTTTCGTGAA TTATAAATTA ATTGATTTAA ACTTCATTAT TATTATTATT 660
ATTATTACTA TTATTATTAT TATTATTATT ATTATAACTA TGTTATTTAT TATTATTAAT 720
TATTTATTAT TTATATGTTG AGATGAGATG AATCGTTTAC TCACGTGATT CAGATTGGCG 780
ATTCAAATTG TGGTTGCTAT AGCAACGCGT GTTATGATTT GACTCCATAT ATAAACACCG 840
AGACTCGCCG CTATCTGTTG ATTGAGGAGA GGCGAATTTC TGAGACATTT GCTGAGGATT 900
ACTGTGCTGA TACTGCGATT CTTCAAGGAG ACCAGAGAAT TTCTGACAGA AGACTTTTAT 960
TTTACAAGGA GATCGACGCT CAGAGCTGAA ATTATTCCTT TTGACACGTT TTGTTGCTCT 1020
TTTGTTGTGT TTATTTTGAT TTTGATCTTG TTTTTATTGA CATTTTTATT GATATTTGAT 1080
CTTTGTTCTT GTTTTCAGGT TTGCTGGAGT TTGGAGGAGT TTGTCAGATG GGTGAAAACC 1140
GCAGTGAGTG TTTTAGTTTT TATTTGTTTA TGATCAATCA TGACATGATG TTGTGTAATG 1200
TTTGGGGAAA TGTGATGTAA ATAAACTGGT ACAAATGAAC CCATTTCAAC ACAACTGTTC 1260
CCCGATATAA GTGATCAGAT GTCTTTTATT CTCTGTAGAT GCAGCTACTA AAGTTAATTG 1320
TTGATTAATT CTTATAATCT TATAATAAAC GTGATATGTT GTTGTTGTTG TTGTCGTTGT 1380
CTCAGGCCGC TCCAGATCCA GGAGTTCTGC TTTCATCCAG GCAGCTGTTC AGGACGTCAG 1440
GACACATGAT GGTGATGGTG AAACCCAGAC CGTGAGCCAA GAGCTTGATG GATTTCTCGC 1500
ACCTCTGCCT TCCCTGTTGG CCAAATCTGT GTCCACAGAT CAGGGTAACA GGAAGAGGAA 1560
GCGGCAGAGC GGCAGCCAGC AAACACCAGA AGATGAACGT CCGTCCACCT CATCTAGAAG 1620
AGCTCTCAAA CGCTCTCGCA GAGGTCAGAA TGGCTTTTTG AAGAAGTGAT GATGATGTTT 1680
CAGTAATGCT CTTTTACAGT TTTCTCTACT GCTGCATGTT TTCTTTGAAC ACACATTTCT 1740
ACTGCTCCTC TGTGTTGCAG ACGCGTATGC AAAGGGCCCA CTGCTGGGAG ACGGTGGATT 1800
TGGCTCTGTG TTTGCTGGGA TGCGCAGGTC TGATGGACTG CCAGTAAGTC GTTTTCTCCG 1860
CTCTTCATTC AAACAGCCTT TAGAAATCCT GATCTCAGTA AATGTGATGT GTGAGGATCA 1920
GGCAGGTGTG ATTTATTATG CTTTATCTGT CTACAGGTCG CCATCAAGTA TGTGTCTAAA 1980
GAGCGGACAC AGAGGAGACT GAGAGTTGTG AGTTCAGTG 2019