EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30039 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:41807008-41808995 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr5:41807472-41807483AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr5:41807471-41807482TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr5:41807651-41807665TATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr5:41807649-41807665ATTATTAATTATTTAT-6.2
PROP1MA0715.1chr5:41807471-41807482TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr5:41807471-41807482TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr5:41807471-41807482TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr5:41807729-41807745GGTTGCTATAGCAACG+6.82
RFX1MA0509.2chr5:41807729-41807745GGTTGCTATAGCAACG-6.82
RFX2MA0600.2chr5:41807729-41807745GGTTGCTATAGCAACG-7.37
RFX2MA0600.2chr5:41807729-41807745GGTTGCTATAGCAACG+7.4
RFX3MA0798.1chr5:41807729-41807745GGTTGCTATAGCAACG-7.17
RFX3MA0798.1chr5:41807729-41807745GGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX4MA0799.1chr5:41807729-41807745GGTTGCTATAGCAACG-6.65
RFX4MA0799.1chr5:41807729-41807745GGTTGCTATAGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr5:41807729-41807745GGTTGCTATAGCAACG+7.59
RFX5MA0510.2chr5:41807729-41807745GGTTGCTATAGCAACG-7.71
Enhancer Sequence
ACCTTTCTGC TGTGGACGCC ATCTTGTGGT CAGACGCGGG AACTCATTCG GCAGGTGAAC 60
TTTTGTGCTT TCTAGCCCTT GAGTGAACAC AAAGTCCCTT AAAAAGCCTT CACATACATC 120
CAAAATAACG AAAACATTAA TAAAACTTAA TAATATTAAA TCTGAAAACA AGAGCAAATG 180
AAAAGTACAT AAATATGACT GAACCATGTA GCCTACCAGA TGATGATACA AACGGCCATG 240
TGATCTGAAA TCGTGCGTAG ACCATAGACT GTAAAATATA GGCATAGACA TAGAAATTGT 300
GAACGATTTA ATTTACTTTC TATTATTTAC AATAATAAAC TTTTTTTAAA ACTTATATTC 360
CTAATATCTA CGTGAGCAGT TAGCACTGTA CGTGTAATTA ACCAGCATGC ACTTACATTG 420
CTTGGGCCAC TAATAGAAAA TATATGAGTT AATTTTATTA TTTTAATTTA ATTAATTCCT 480
AAATAGCTGT ACATTTTACA AAGTCAAACC TTGTCAAACC AATCTTGCTC ATTTAGCATT 540
ATTATTACAG TTTCGTGAAT TATAAATTAA TTGATTTAAA CTTCATTATT ATTATTATTA 600
TTATTATTAC TATTATTATT ATAATAACTA TGTTATTTAT TATTATTAAT TATTTATTAT 660
TTATATGTTG AGATGAGATG AATCGTTTAC TCACGTGATT CAGATTGGCG ATTCAAATTG 720
TGGTTGCTAT AGCAACGCGT GTTATGATTT GACTCCATAT ATAAACACCT AGACTCGCCG 780
CTATCTGTTG ATTGAGGAGA GGCGAATTTC TGAGACATTT GCTGAGGATT ACTGTGCTGA 840
TACTGCGATT CTTCAAGGAG ACCAGAGAAT TTCTGACAGA AGACTTTTAT TTTACAAGGA 900
GATCGACGCT CAGAGCTGAA ATTATTCCTT TTGACACGTT TTGTTGCTCT TTTGTTGTGT 960
TTATTTTGAT TTTGATCTTG TTTTTATTGA CATTTTTATT GATATTTGAT CTTTGTTCTT 1020
GTTTTCAGGT TTGCTGGAGT TTGGAGGAGT TTGTCAGATG GGTGAAAACC GCAGTGAGTG 1080
TTTTAGTTTT TATTTGTTTA TGATCAATCA TGACATGATG TTGTGTAATG TTTGGGGAAA 1140
TGTGATGTAA ATAAACTGGT ACAAATGAAC CCATTTCAAC ACAACTGTTC CCCGATATAA 1200
GTGATCAGAT GTCTTTTATT CTCTGTAGAT GCAGCTACTA AAGTTAATTG TTGATTAATT 1260
CTTATAATCT TATAATAAAC GTGATATGTT GTTGTTGTTG TTGTCGTTGT CTCAGGCCGC 1320
TCCAGATCCA GGAGTTCTGC TTTCATCCAG GCAGCTGTTC AGGACGTCAG GACACATGAT 1380
GGTGATGGTG AAACCCAGAC CGTGAGCCAA GAGCTTGATG GATTTCTCGC ACCTCTGCCT 1440
TCCCTGTTGG CCAAATCTGT GTCCACAGAT CAGGGTAACA GGAAGAGGAA GCGGCAGAGC 1500
GGCAGCCAGC AAACACCAGA AGATGAACGT CCGTCCACCT CATCTAGAAG AGCTCTCAAA 1560
CGCTCTCGCA GAGGTCAGAA TGGCTTTTTG AAGAAGTGAT GATGATGTTT CAGTAATGCT 1620
CTTTTACAGT TTTCTCTACT GCTGCATGTT TTCTTTGAAC ACACATTTCT ACTGCTCCTC 1680
TGTGTTGCAG ACGCGTATGC AAAGGGCCCA CTGCTGGGAG ACGGTGGATT TGGCTCTGTG 1740
TTTGCTGGGA TGCGCAGGTC TGATGGACTG CCAGTAAGTC GTTTTCTCCG CTCTTCATTC 1800
AAACAGCCTT TAGAAATCCT GATCTCAGTA AATGTGATGT GTGAGGATCA GGCAGGTGTG 1860
ATTTATTATG CTTTATCTGT CTACAGGTCG CCATCAAGTA TGTGTCTAAA GAGCGGACAC 1920
AGAGGAGACT GAGAGTTGTG AGTTCAGTGT GAACCTGTTG TTGTGTTTGA TGTTTCATTG 1980
GGTTCTG 1987