EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30037 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:41799596-41801782 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr5:41800287-41800298AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr5:41800286-41800297TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr5:41800466-41800480TATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr5:41800464-41800480ATTATTAATTATTTAT-6.2
PROP1MA0715.1chr5:41800286-41800297TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr5:41800286-41800297TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr5:41800286-41800297TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr5:41800544-41800560GGTTGCTATAGCAACG+6.82
RFX1MA0509.2chr5:41800544-41800560GGTTGCTATAGCAACG-6.82
RFX2MA0600.2chr5:41800544-41800560GGTTGCTATAGCAACG-7.37
RFX2MA0600.2chr5:41800544-41800560GGTTGCTATAGCAACG+7.4
RFX3MA0798.1chr5:41800544-41800560GGTTGCTATAGCAACG-7.17
RFX3MA0798.1chr5:41800544-41800560GGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX4MA0799.1chr5:41800544-41800560GGTTGCTATAGCAACG-6.65
RFX4MA0799.1chr5:41800544-41800560GGTTGCTATAGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr5:41800544-41800560GGTTGCTATAGCAACG+7.59
RFX5MA0510.2chr5:41800544-41800560GGTTGCTATAGCAACG-7.71
Enhancer Sequence
CAAACGTAAT GACAAACGAG AGATGTTTTT CTGAATTTAA TAAAATCTTT TTTTGTTTTA 60
ATATAAATGA ACAAGGCTAG ATAGGTTAGG AAAATTCTAG CAAACGTATA AGCTAATTGT 120
CATTACAGAC CTTGTGACAG TAATTTAGCT TATTGAAAGC TGTATATTAG TGATGAAAAC 180
AGCTATTTAG ATTCATACAA ACAGAAATAA TGTATTTATA AACTTGCACC TTTCTGCTGT 240
GGACGCCATC TTGTGGTCAG ACGCGGGAAC TCATTCGGCA GGTGAACTTT TGTGCTTTCT 300
AGCCCTTGAG TGAACACAAA GTCCCTTAAA AAGCCTTCAC ATACATCCAA AATAACGAAA 360
ACATTAATAA AACTTAATAA TATTAAATCT GAAAACAAGA GCAAATGAAA AGTACATAAA 420
TATGACTGAA CCATGTAGCC TACCAGATGA TGATACAAAC GGCCATGTGA TCTGAAATCG 480
TGCGTAGACC ATAGACTGTA AAATATAGGC ATAGACATAG AAATTGTGAA CGATTTAATT 540
TACTTTCTAT TATTTACAAT AATAAACTTT TTTTAAAACT TATATTCCTA ATATCTACGT 600
GAGCAGTTAG CACTGTACGT GTAATTAACC AGCATGCACT TACATTGCTT GGGCCACTAA 660
TAGAAAATAT ATGAGTTAAT TTTATTATTT TAATTTAATT AATTCCTAAA TAGCTGTACA 720
TTTTACAAAG TCAAACCTTG TCAAACCAAT CTTGCTCATT TAGCATTATT ATTACAGTTT 780
CGTGAATTAT AAATTAATTG ATTTAAACTT CATTATTATT ATTATTATTA TTATTACTAT 840
TATTATTATA ATAACTATGT TATTTATTAT TATTAATTAT TTATTATTTA TATGTTGAGA 900
TGAGATGAAT CGTTTACTCA CGTGATTCAG ATTGGCGATT CAAATTGTGG TTGCTATAGC 960
AACGCGTGTT ATGATTTGAC TCCATATATA AACACCTAGA CTCGCCGCTA TCTGTTGATT 1020
GAGGAGAGGC GAATTTCTGA GACATTTGCT GAGGATTACT GTGCTGATAC TGCGATTCTT 1080
CAAGGAGACC AGAGAAATTC TGACAGAAGA CTTTTATTTT ACAAGGAGAT CGACGCTCAG 1140
AGCTGAAATT ATTCCTTTTG ACACGTTTTG TTGCTCTTTT GTTGTGTTTA TTTTGATTTT 1200
GATCTTGTTT TTATTGACAT TTTTATTGAT ATTTGATCTT TGTTCTTGTT TTCAGGTTTG 1260
CTGGAGTTTG GAGGAGTTTG TCAGATGGGT GAAAACCGCA GTGAGTGTTT TAGTTTTTAT 1320
TTGTTTATGA TCAATCATGA CATGATGTTG TGTAATGTTT GGGGAAATGT AATGTAAATA 1380
AACTGGTACA AATGAACCCA TTTCAACACA ACTGTTCCCC GATATAAGTG ATCAGATGTC 1440
TTTTATTCTC TGTAGATGCA GCTACTAAAG TTAATTGTTG ATTAATTCTT ATAATCTTAT 1500
AATAAACGTG ATATGTTGTT GTTGTTGTTG TCGTTGTCTC AGGCCGCTCC AGATCCAGGA 1560
GTTCTGCTTT CATCCAGGCA GCTGTTCAGG ACGTCAGGAC ACATGATGGT GATGGTGAAA 1620
CCCAGACCGT GAGCCAAGAG CTTGATGGAT TTCTCGCACC TCTGCCTTCC CTGTTGGCCA 1680
AATCTGTGTC CACAGATCAG GGTAACAGGA AGAGGAAGCG GCAGAGCGGC AGCCAGCAAA 1740
CACCAGAAGA TGAACGTCCG TCCACCTCAT CTAGAAGAGC TCTCAAACGC TCTCGCAGAG 1800
GTCAGAATGG CTTTTTGAAG AAGTGATGAT GATGTTTCAG TAATGCTCTT TTACAGTTTT 1860
CTCTACTGCT GCATGTTTTC TTTGAACACA CATTTCTACT GCTCCTCTGT GTTGCAGACG 1920
CGTATGCAAA GGGCCCACTG CTGGGAGACG GTGGATTTGG CTCTGTGTTT GCTGGGATGC 1980
GCAGGTCTGA TGGACTGCCA GTAAGTCGTT TTCTCCGCTC TTCATTCAAA CAGCCTTTAG 2040
AAATCCTGAT CTCAGTAAAT GTGATGTGTG AGGATCAGGC AGGTGTGATT TATTATGCTT 2100
TATCTGTCTA CAGGTCGCCA TCAAGTATGT GTCTAAAGAG CGGACACAGA GGAGACTGAG 2160
AGTTGTGAGT TCAGTGTGAA CCTGTT 2186