EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30035 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:41792617-41795179 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr5:41793585-41793600TATTAATTATTAATT-6.17
LMX1BMA0703.2chr5:41793406-41793417AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr5:41793405-41793416TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr5:41793585-41793599TATTAATTATTAAT-6.15
POU4F1MA0790.1chr5:41793592-41793606TATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr5:41793586-41793602ATTAATTATTAATTAT+6.14
POU4F3MA0791.1chr5:41793583-41793599ATTATTAATTATTAAT-6.2
POU4F3MA0791.1chr5:41793590-41793606ATTATTAATTATTTAT-6.2
PROP1MA0715.1chr5:41793405-41793416TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr5:41793405-41793416TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr5:41793405-41793416TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr5:41793663-41793679GGTTGCTATAGCAACG+6.82
RFX1MA0509.2chr5:41793663-41793679GGTTGCTATAGCAACG-6.82
RFX2MA0600.2chr5:41793663-41793679GGTTGCTATAGCAACG-7.37
RFX2MA0600.2chr5:41793663-41793679GGTTGCTATAGCAACG+7.4
RFX3MA0798.1chr5:41793663-41793679GGTTGCTATAGCAACG-7.17
RFX3MA0798.1chr5:41793663-41793679GGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX4MA0799.1chr5:41793663-41793679GGTTGCTATAGCAACG-6.65
RFX4MA0799.1chr5:41793663-41793679GGTTGCTATAGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr5:41793663-41793679GGTTGCTATAGCAACG+7.59
RFX5MA0510.2chr5:41793663-41793679GGTTGCTATAGCAACG-7.71
Enhancer Sequence
ATTTTTACTA CTGTAAACTG GTGTAAAAAA TCAGGCCGCT TCAATGCAGA CTTTGCACCC 60
TTAACAGAAG TTCAGAAGCT CAAATCACAT CAAATCATCA AACGTAATGA CAAACGAGAG 120
ATGTTTTTCT GAATTTAATA CAATCTTTTT TTGTTTTAAT ATAAATGAAC AAGGCTAGAT 180
CGGTTAGGAA AATTCTAGCA AATGTACAAG CTAATTGTCA TTACAGACCT TGTGATAGTA 240
ATTTAGCTTA TTGAAAGCTG TATATTAGTG ATGAAAACAG CTATTTAGAT TCATACAAAC 300
AGAAATATTG TATTTATAAA CTTGCACCTT TCTGCTGTGG ACGCCATCTT GTGGTCAGAC 360
GCGGGAACTC ATTCGGCAGG TGAACTTTTG TGCTTTCTAG CCGTTGAGTG AACACAAAGT 420
CCCTTAAAAA GCCTTCACAT ACATCCAAAA TAACGAAAAC ATTAATAAAA CTTAATAATA 480
TTAAATCTGA AAACAAGAGC AAATGAAAAG TACATAAATA TGACTGAACC ATGTAGCCTA 540
CCAGATGATG ATACAAACGG CCATGTGATC TGAAATCGTG CGTAGACCAT AGACTGTAAA 600
ATATAGGCAT AGACATAGAA ATTGTGAACG ATTTAATTTA CTTTCTATTA TTTACAATAA 660
TAAACTTTTT TTAAAACTTA TATTCCTAAT ATCTACGTGA GCAGTTAGCA CTGTACGTGT 720
AATTAACCAG CATGCACTTA CATTGCTTGG GCCACTAATA GAAAATATAT GAGTTAATTT 780
TATTATTTTA ATTTAATTAA TTCCTAAATA GCTGTACATT TTACAAAGTC AAACCTTGTC 840
AAACCAATCT TGCTCATTTA GCATTATTAT TACAGTTTCG TGAATTATAA ATTAATTGAT 900
TTAAACTTCA TTATTATTAT TATTATTATT ATTACTATTA TTATTATAAT AACTATGTTA 960
TTTATTATTA TTAATTATTA ATTATTTATA TGTTGAGATG AGATGAATCG TTTACTCACG 1020
TGATTCAGAT TGGCGATTCA AATTGTGGTT GCTATAGCAA CGCGTGTTAT GATTTGACTC 1080
CATATATAAA CACCTAGACT CGCCGCTATC TGTTGATTGA GGAGAGGCGA ATTTCTGAGA 1140
CATTTGCTGA GGATTACTGT GCTGATACTG CGATTCTTCA AGGAGACCAG AGAAATTCTG 1200
ACAGAAGACT TTTATTTTAC AAGGAGATCG ACGCTCAGAG CTGAAATTAT TCCTTTTGAC 1260
ACGTTTTGTT GCTCTTTTGT TGTGTTTATT TTGATTTTGA TCTTGTTTTT ATTGACATTT 1320
TTATTGATAT TTGATCTTTG TTCTTGTTTT CAGGTTTGCT GGAGTTTGGA GGAGTTTGTC 1380
AGATGGGTGA AAACCGCAGT GAGTGTTTTA GTTTTTATTT GTTTATGATC AATCATGACA 1440
TGATGTTGTG TAATGTTTGG GGAAATGTGA TGTAAATAAA CTGGTACAAA TGAACCCATT 1500
TCAACACAAC TGTTCCCCGA TATAAGTGAT CAGATGTCTT TTATTCTCTG TAGATGCAGC 1560
TACTAAAGTT AATTGTTGAT TAATTCTTAT AATCTTATAA TAAACGTGAT ATGTTGTTGT 1620
TGTTGTTGTC GTTGTCTCAG GCCGCTCCAG ATCCAGGAGT TCTGCTTTCA TCCAGGCAGC 1680
TGTTCAGGAC GTCAGGACAC ATGATGGTGA TGGTGAAACC CAGACCGTGA GCCAAGAGCT 1740
TGATGGATTT CTCGCACCTC TGCCTTCCCT GTTGGCCAAA TCTGTGTCCA CAGATCAGGG 1800
TAACAGGAAG AGGAAGCGGC AGAGCGGCAG CCAGCAAACA CCAGAAGATG AACGTCCGTC 1860
CACCTCATCT AGAAGAGCTC TCAAACGCTC TCGCAGAGGT CAGAATGGCT TTTTGAAGAA 1920
GTGATGATGA TGTTTCAGTA ATGCTCTTTT ACAGTTTTCT CTACTGCTGC ATGTTTTCTT 1980
TGAACACACA TTTCTACTGC TCCTCTGTGT TGCAGACGCG TATGCAAAGG GCCCACTGCT 2040
GGGAGACGGT GGATTTGGCT CTGTGTTTGC TGGGATGCGC AGGTCTGATG GACTGCCAGT 2100
AAGTCGTTTT CTCCGCTCTT CATTCAAACA GCCTTTAGAA ATCCTGATCT CAGTAAATGT 2160
GATGTGTGAG GATCAGGCAG GTGTGATTTA TTATGCTTTA TCTGTCTACA GGTCGCCATC 2220
AAGTATGTGT CTAAAGAGCG GACACAGAGG AGACTGAGAG TTGTGAGTTC AGTGTGAACC 2280
TGTTGTTGTG TTTGATGTTT CATTGGGTTC TGAATCCAAT CGTTTGTCCT GCAGGAAGGT 2340
CAGGGTCGGC TGCCGCTGGA GGTGGCACTG ATGACCCGCG TCAATTCAGC TCCTGCCTGC 2400
CCCAACGTCC TGCAGCTGCT AGACTGGTTT GACCGTCCCA GACGCTACAT CCTGATCCTG 2460
GAGCGTCCGG ATCCCTGCCA AGACCTCCAG AGCTTCTGTG AGGAGAACGA CTGTCTGGAT 2520
GAGGGTCTGG CCAAGAAAGT GCTGGTGCAG CTGATCGCGG CT 2562