EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30033 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:41785576-41787528 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr5:41786215-41786226AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr5:41786214-41786225TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr5:41786394-41786408TATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr5:41786392-41786408ATTATTAATTATTTAT-6.2
PROP1MA0715.1chr5:41786214-41786225TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr5:41786214-41786225TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr5:41786214-41786225TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr5:41786472-41786488GGTTGCTATAGCAACG+6.82
RFX1MA0509.2chr5:41786472-41786488GGTTGCTATAGCAACG-6.82
RFX2MA0600.2chr5:41786472-41786488GGTTGCTATAGCAACG-7.37
RFX2MA0600.2chr5:41786472-41786488GGTTGCTATAGCAACG+7.4
RFX3MA0798.1chr5:41786472-41786488GGTTGCTATAGCAACG-7.17
RFX3MA0798.1chr5:41786472-41786488GGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX4MA0799.1chr5:41786472-41786488GGTTGCTATAGCAACG-6.65
RFX4MA0799.1chr5:41786472-41786488GGTTGCTATAGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr5:41786472-41786488GGTTGCTATAGCAACG+7.59
RFX5MA0510.2chr5:41786472-41786488GGTTGCTATAGCAACG-7.71
Enhancer Sequence
TTGTTTTAAT ATAAATGAAC AAGGCTAGAT AGGTTAGGAA AATTCTAGCA AACGTATAAG 60
CTAATTGTCA TTACAGACCT TGTGACAGTA ATTTAGCTTA TTGAAAGCTG TATATTAGTG 120
ATGAAAACAG CTATTTAGAT TCATACAAAC AGAAATAATG TATTTATAAA CTTGCACCTT 180
TCTGCTGTGG ACGCCATCTT GTGGTCAGAC GCGGGAACTC ATTCGGCAGG TGAACTTTTG 240
TGCTTTCTAG CCCTTGAGTG AACACAAAGT CCCTTAAAAA GCCTTCACAT ACATCCAAAA 300
TAACGAAAAC ATTAATAAAA CTTAATAATA TTAAATCTGA AAACAAGAGC AAATGAAAAG 360
TACATAAATA TGACTGAACC ATGTAGCCTA CCAGATGATG ATACAAACGG CCATGTGATC 420
TGAAATCGTG CGTAGACCAT AGACTGTAAA ATATAGGCAT AGACATAGAA ATTGTGAACG 480
ATTTAATTTA CTTTCTATTA TTTACAATAA TAAACTTTTT TTAAAACTTA TATTCCTAAT 540
ATCTACGTGA GCAGTTAGCA CTGTACGTGT AATTAACCAG CATGCACTTA CATTGCTTGG 600
GCCACTAATA GAAAATATAT GAGTTAATTT TATTATTTTA ATTTAATTAA TTCCTAAATA 660
GCTGTACATT TTACAAAGTC AAACCTTGTC AAACCAATCT TGCTCATTTA GCATTATTAT 720
TACAGTTTCG TGAATTATAA ATTAATTGAT TTAAACTTCA TTATTATTAT TATTATTATT 780
ATTACTATTA TTATTATAAT AACTATGTTA TTTATTATTA TTAATTATTT ATTATTTATA 840
TGTTGAGATG AGATGAATCG TTTACTCACG TGATTCAGAT TGGCGATTCA AATTGTGGTT 900
GCTATAGCAA CGCGTGTTAT GATTTGACTC CATATATAAA CACCTAGACT CGCCGCTATC 960
TGTTGATTGA GGAGAGGCGA ATTTCTGAGA CATTTGCTGA GGATTACTGT GCTGATACTG 1020
CGATTCTTCA AGGAGACCAG AGAATTTCTG ACAGAAGACT TTTATTTTAC AAGGAGATCG 1080
ACGCTCAGAG CTGAAATTAT TCCTTTTGAC ACGTTTTGTT GCTCTTTTGT TGTGTTTATT 1140
TTGATTTTGA TCTTGTTTTT ATTGACATTT TTATTGATAT TTGATCTTTG TTCTTGTTTT 1200
CAGGTTTGCT GGAGTTTGGA GGAGTTTGTC AGATGGGTGA AAACCGCAGT GAGTGTTTTA 1260
GTTTTTATTT GTTTATGATC AATCATGACA TGATGTTGTG TAATGTTTGG GGAAATGTGA 1320
TGTAAATAAA CTGGTACAAA TGAACCCATT TCAACACAAC TGTTCCCCGA TATAAGTGAT 1380
CAGATGTCTT TTATTCTCTG TAGATGCAGC TACTAAAGTT AATTGTTGAT TAATTCTTAT 1440
AATCTTATAA TAAACGTGAT ATGTTGTTGT TGTTGTTGTC GTTGTCTCAG GCCGCTCCAG 1500
ATCCAGGAGT TCTGCTTTCA TCCAGGCAGC TGTTCAGGAC GTCAGGACAC ATGATGGTGA 1560
TGGTGAAACC CAGACCGTGA GCCAAGAGCT TGATGGATTT CTCGCACCTC TGCCTTCCCT 1620
GTTGGCCAAA TCTGTGTCCA CAGATCAGGG TAACAGGAAG AGGAAGCGGC AGAGCGGCAG 1680
CCAGCAAACA CCAGAAGATG AACGTCCGTC CACCTCATCT AGAAGAGCTC TCAAACGCTC 1740
TCGCAGAGGT CAGAATGGCT TTTTGAAGAA GTGATGATGA TGTTTCAGTA ATGCTCTTTT 1800
ACAGTTTTCT CTACTGCTGC ATGTTTTCTT TGAACACACA TTTCTACTGC TCCTCTGTGT 1860
TGCAGACGCG TATGCAAAGG GCCCACTGCT GGGAGACGGT GGATTTGGCT CTGTGTTTGC 1920
TGGGATGCGC AGGTCTGATG GACTGCCAGT AA 1952