EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30031 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:41778714-41779814 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr5:41779048-41779059AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr5:41779047-41779058TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr5:41779206-41779220TATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr5:41779204-41779220ATTATTAATTATTTAT-6.2
PROP1MA0715.1chr5:41779047-41779058TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr5:41779047-41779058TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr5:41779047-41779058TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr5:41779284-41779300GGTTGCTATAGCAACG+6.82
RFX1MA0509.2chr5:41779284-41779300GGTTGCTATAGCAACG-6.82
RFX2MA0600.2chr5:41779284-41779300GGTTGCTATAGCAACG-7.37
RFX2MA0600.2chr5:41779284-41779300GGTTGCTATAGCAACG+7.4
RFX3MA0798.1chr5:41779284-41779300GGTTGCTATAGCAACG-7.17
RFX3MA0798.1chr5:41779284-41779300GGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX4MA0799.1chr5:41779284-41779300GGTTGCTATAGCAACG-6.65
RFX4MA0799.1chr5:41779284-41779300GGTTGCTATAGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr5:41779284-41779300GGTTGCTATAGCAACG+7.59
RFX5MA0510.2chr5:41779284-41779300GGTTGCTATAGCAACG-7.71
Enhancer Sequence
CGAAAACATT AATAAAACTT GATAATATTA AATCTGAAAA CAAGAGCAAA TGAAAAGTAC 60
ATAAATATGA CTGAACCATG TAGCCTACCA GATGATGATA CAAACGGCCA TGTGATCTGA 120
AATCGTGCGT AGACCATAGA CTGTAAAATA TAGGCATAGA CATAGAAATT GTGAACGATT 180
TAATTTACTT TCTATTATTT ACAATAATAA ACTTTTTTTA ACTTATATTC CTAATATCTA 240
CGTGAGCAGT TAGCACTGTA CGTGTAATTA AACAGCATGC ACTTACATTG CTTGGGCCAC 300
TAATAGAAAA TATATGAGTT AATTTTATTA TTTTAATTTA ATTAATTCCT AAATAGCTGT 360
ACATTTTACA AAGTCAAACC TTGTCAAACC AATCTTGCTT ATTTAGCATT ATTATTACAG 420
TTTCGTGAAT TATAAATTAA TTGATTTAAA CTTCATTATT ATTATTATTA TTTTAACTAT 480
GTTTATTATT ATTATTAATT ATTTATTATT TATATGTTGA GATGAGATGA ATCGTTTACT 540
CACGTGATTC AGATTGGCGA TTCAAATTGT GGTTGCTATA GCAACGCGTG TTATGATTTG 600
ACTCCATATA TAAACACCGA GACTCGCCGC TATCTGTTGA TTGAGGAGAG GCGAATTTCT 660
GAAACATTTG CTGAGGATTA CTGTGCTGAT ACTGCGATTC TTCAAGGAGA CCAGAGAATT 720
TCTGACAGAA GACTTTTATT TTACAAGGAG ATCGACGCTC AGAGCTGAAA TTATTCCTTT 780
TGACACGTTT TGTTGCTCTT TTGTTGTGTT TATTTTGATT TTGATCTTGT TTTTATTGAC 840
ATTTTTATTG ATATTTGATC TTTGTTCTTG TTTTCAGGTT TGCTGGAGTT TGGAGGAGTT 900
TGTCAGATGG GTGAAAACCG CAGTGAGTGT TTTAGTTTTT ATTTGTTTAT GATCAATCAT 960
GATATGATGT TGTGTAATGT TTGGGGAAAT GTGATGTAAA TAAACTGGTA CAAATGAACC 1020
CATTTCAACA CAACTGTTCC CCGATATAAG TGATCAGATG TCTTTTATTC TCTGTAGATG 1080
CAGCTACTAA AGTTAATTGT 1100