EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-29753 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:32178007-32179178 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr5:32178602-32178618CATTGTTTACATAAAC-6.07
FOXC2MA0846.1chr5:32178603-32178615ATTGTTTACATA-6.52
RAXMA0718.1chr5:32178619-32178629GCCAATTAAC+6.02
Enhancer Sequence
TTTTCCTGCT GGCCGTTTGA GCATGCCATT ATTGGCAGAG CTGATTTGAT GCTCGCATTT 60
GCAGGGGAAA TTGTTAGTTC TAATATTTCA CTCACACACA GCGGTCTAAG CACTTCAAGG 120
AGAAATGGGC CCTCTGCAGG AGAGCATTAG TAGGCGAACC TCGAAATCAA CGCAAAGTGT 180
CACCACAGCC ATTGGATTCG TGACGCACAC GAGCTGAAGG ATAAAAATAG GGCACAAGCT 240
GCACTCTTGA GAATGCCCGT GCTGCTAACA CTTCCACGGG CCGCTCGGAT ATCTCTGGAA 300
AAGGACCTAT GCGAATTACA TTTTTGTTAG AAATAAACAT TTGCAGCGAT TTCGCTCATT 360
CTCATGCCTC TGAAGTAGTG CGTGCTGCAA GCGCAACCTC TGTCTTCCGC TGTCACCCTG 420
CAGCGCGCAC ACGTGGGCGA GCTCGCGCAC GCTCTGTTGA GCTGGAGGGA GGAGTAGGCA 480
CGCAAGTAAA ACATGCATCC TGGCAAGTGG AACATTCACT TGCGTGACTA TACCGCATTA 540
TAGAGTTTAT TTTATTTAGT ACGATCTGTG CCATTTAAAA ATGCTGGTTC GATTGCATTG 600
TTTACATAAA CAGCCAATTA ACTGTTAAAT GTTACTCTTA AAAATTAATA GGTTAAATGT 660
TGAAGCATTC TAAATACGTA TAGAACATAA TTATGTATAT TAATATTATT AATAATAATG 720
TTTTGTTTGC CTATATACTT TATTTCGTTA TTCTTCCCAC AGCTATGTGC CACGCGAGTG 780
CGCAATGGTT TACCTATAGC GCGTGCACGC GTCCGTGCGC ACGCTCCTCA TATGTCCACA 840
TCCACCTAGA AGCCATCAAA AATGCACCCC CCTTCGACTG AAGAGGGTAG TGAGGAGAAT 900
AATTTCTGGC AGTGTGAGTC CAGGCACAAA ACTACAGCCC TGTTTAAAAT AATCTCATTT 960
TAAATAAAAC CAGATGATAT TCTACCTACA GCAAAAATTA TACAAAGTCT GTGTGTATTT 1020
GTAAAATCCT TGGGGTCATT ATTTGTACTT TGGTTTGAAC CAAGGCTGTC ATTCATGTTG 1080
AAATCAATGA AATTGATTAC CAGATCAAGG ACAGAGCCAA AGAAAAGGGG GGAAATTCTA 1140
GGCATTAAGA TTGGTAAGGC AGCTTTTGTG G 1171