EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-29698 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:30047758-30048590 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr5:30048024-30048041TGATTTAATTAATCAGT+6.36
CTCFMA0139.1chr5:30048090-30048109CTGCCACCAGGTGACGCTT+6.06
LMX1BMA0703.2chr5:30048025-30048036GATTTAATTAA+6.02
Enhancer Sequence
AAGCTAAATT AAATAATATT GTTTTTAAAC ATAATATAAT TTGAAGAAAA AACCCCTACT 60
ATTTATCATT GCAGTATTTA AGTTTGACAC CCAGTGGTTG AACTAGGTAT TGCATACCTG 120
GTTCAAAACA TACTCCAGCA GAGCCGGACC AAGGCATAAG CGAACTAAGC GGCTGCTTAG 180
GGCCCCGTGG CCACCATTTA TTTTGTTATT TCTGACCGCG ATACATACTC TGGCGCCAAG 240
ATATTTACCT AAATTTACAA AAGATCTGAT TTAATTAATC AGTTTTCCAC ACTGACTGCA 300
GCAGATAACC GCTTTAGCTA CAGTACACCC AGCTGCCACC AGGTGACGCT TCCCGTAATG 360
GCGGATCATC GGACATAAAC CAGCGTCATG TAAACAACTG ACAGACAGAT GAGCCATTGC 420
ATTGGTGAAA ATCCCAGGCA TACAGACACT TTCTTTTGTC CAAGCTGGGC CAATGTATTT 480
GTGTGTTTCA GACATCCAGC TCCCCCGAAT TTGCCACTAT AGTTTATTTC TAACAGACAC 540
GCTTTCACTT CGCTATATTG CTCGCGCCTG CCCGCGGCCA AGGCAACTTT TTATGTGCTC 600
AAACTTTTTA ACTCCGCCAA AATATATAAA GATATCAATA GGACATGAAC ATTTAATTTG 660
AAGGGCCCTG CGTTTATTTG ACTCTTACAG AACTTGTCAA AGTCTTGTAG ATGGTATTTT 720
GGCAAAAAAT ATTAGGGGAA TTAAAAAACT TAAATATTTG AGTAAATAAC TAATGTTCTC 780
CACTGCTGAA AACATACGTG CTCAGAGGAG TCTGTGCTTA CCAGAGCATT CT 832