EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-29686 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:29823033-29824287 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NEUROD1MA1109.1chr5:29824199-29824212AGACAGATGGCAT+6.34
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr5:29823603-29823614AGCCACTCAAG+6.62
RREB1MA0073.1chr5:29823730-29823750TGTGTGCGGGTGGGTGGGTG-6.55
Enhancer Sequence
CACCAGAGTT CAATTCAATA GAGCACCTAT GGATGTGTTT GAACGGAAGA TTGGCATCAT 60
GGATGTGCAG ATGGCAAATC TGCAGGAACT GTGATGCTAT CATGTCAATA TGGACCAAAA 120
TCTCTGAGAA ATATTTCCAG TGCCTTGTTA AATCTATGCC GTCAATGATT AAAGCAGTTC 180
TAAAGACAAA AGGGTGGTTA CTAGTAAGGT GTACCTAAAA AAGTGGGCGG TATGTCTAAG 240
ATGAGCTCTA AAAGGTGTAC TTTAGATTAT CAGTTAGGGG CCTTCACCTA TTGTTTAGAT 300
CCTCTGATCT ACTTTAGGCT CAGCAAAATG ACTTTTAATT ATTTCATTGC CCACTGAAGC 360
ACGTAATGTG GGAAATTGGA TAACCTTTCA ACAGGTTTCA AGGGGTTTGG CGACCCCCTC 420
CCCCAAACAT GTCCTTTTTA GAAAAAACAA ACTGGCAAGA TATAGGTGTC TAATAACCCA 480
TGTTGCATAG CATGAACTAA CCGCAGTCAT TCCACCGAGT GCTCCTTCGG GAGCGCCGGG 540
CTGCTGTGTT TGAGCTGCGT CTCAAACACG AGCCACTCAA GGACAAACTC AAGGAGGGGT 600
TTTGTGTGTT TTCCCTCTCA TGTATTCTTA ATTTTTTTTG AATGGTTACT ATTTACGACT 660
GAGTGGTTTG CGTTTGTAAA CACAAAGCTC AAGTGTGTGT GTGCGGGTGG GTGGGTGCGG 720
GAGCTCGCGG AGCTCGTGTT GTGAAGGGCC GCTGGTTCTC ATGGCTGGAT TAGGTCGGCT 780
GATCACGGCT TCAAAGTGAA GGGCTCTTGA TTCCCGAGTG GCTCCCCTCA AATATCTCAA 840
CAGTTGATCA TGTCAGCTCA GTCCCCGGTG ATTTCACGCC GTAAACCTCC CCTTCTTACT 900
TTGATACGCG AGACTTCTGC TGCTCTTTGA AACCCAAAAC ATCTTATAAG TTTAATTAGC 960
GTCTCTTCTG GTTGTTTACA CATCACATTT TTGAACTAAA AGCGACATCC TTGTTTAGTT 1020
TTTGTAGTTG TTGTTCACAA TTAGCATTTA TTTTCTTCCT TAGGTTAGTT CCTTAGGTTA 1080
GTTCCTATTG CTTTTATGTT GCTTAATTTT AAAGTGAGAT GAATTAAGAT CAAGTGATGA 1140
ATTAATTGGT GAGCTTCTGC TGGTGTAGAC AGATGGCATC ATTATAACGC TGATGACATT 1200
TGTGGTTGCA TTTAACTGTT ATGGTAATGA CTGGGTGCGA GACAGAGAAG AAAA 1254