EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-29520 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:22676093-22677168 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr5:22676193-22676203AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr5:22676193-22676203AACAGCTGTT-6.02
Foxq1MA0040.1chr5:22676988-22676999TATTGTTTATA+6.32
MSCMA0665.1chr5:22676193-22676203AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr5:22676193-22676203AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr5:22676193-22676203AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr5:22676193-22676203AACAGCTGTT-6.02
RFX1MA0509.2chr5:22676739-22676755CGTTGTCATGGAAACG+7.24
RFX1MA0509.2chr5:22676739-22676755CGTTGTCATGGAAACG-7.25
RFX2MA0600.2chr5:22676739-22676755CGTTGTCATGGAAACG+6.93
RFX2MA0600.2chr5:22676739-22676755CGTTGTCATGGAAACG-7.03
RFX3MA0798.1chr5:22676739-22676755CGTTGTCATGGAAACG+6.74
RFX3MA0798.1chr5:22676739-22676755CGTTGTCATGGAAACG-7.01
RFX4MA0799.1chr5:22676739-22676755CGTTGTCATGGAAACG+6.51
RFX4MA0799.1chr5:22676739-22676755CGTTGTCATGGAAACG-7.14
RFX5MA0510.2chr5:22676739-22676755CGTTGTCATGGAAACG+6.23
RFX5MA0510.2chr5:22676739-22676755CGTTGTCATGGAAACG-6.44
Tcf21MA0832.1chr5:22676191-22676205GCAACAGCTGTTCT-6.66
Tcf21MA0832.1chr5:22676191-22676205GCAACAGCTGTTCT+6.96
Enhancer Sequence
TTGAGGGATG TAAACAATAA TGGTCCAAAC ATATTTCCAG TTTTACATTC TTTTATTTAT 60
TCCGAGAATC CTGAAAGGTC TACATATTGA TAAATAATGC AACAGCTGTT CTAACCCAGC 120
AAACAATGAG TTGGCGGACC GTCGGCGTTT TTTGGTCGGC ACAAATTCAG CGGCTTGATA 180
TGGGCGGACC GCCGTCGGCT TACCAGCGGC AAGCCGCCCA TTCTAAAAGT TATGTCGGCC 240
CACCGGCGTT TTTTGGGTGG CACGCCACCA GCGGATTACC GTGGGTGGAC CGCCGTCTGG 300
ACACCAGTGG CTAACCGATG GCCCACCCGG TGATGTTTTT AATGTTGTTG GCTGTTCTGT 360
ACCTGATATA AGTACTTTTG TTTAACACTT TTTACATTTT AAACGAATGA GGCACTAAAT 420
AAAAATATAG TTATTAATAA AAGCAAAGTT TAGTAAATAA AACTACAAGA GGTTTTTAAT 480
ATAACAGGTT ATTATTAAAA ACAAAACAAC ATTAAGTTTA AAAATCAAGA TTTAATATTA 540
AATGTCATTA TTTAATATGT TTATGAATTG TTTAAATGTT TATGTAAATG CTGCGTGACT 600
TTAAAGTGTC CATTACCGAG CCCCATTCAA GCATTGCAGC AGAGAGCGTT GTCATGGAAA 660
CGGAGCAACG ACACGACACC TGACCGTCAA CAGTACTTCT CTCATGCGGC AGTTTTCACT 720
AATTTCAGGT AAGTTTAGTC GCTAAAATTA CGCAAATGTT ACATATAACT GTTTCTGACA 780
CTTTTCTTAC TGGTAATTGA CATATTTCTG TTGAACATGT TTTTATAGCG ACTGTTGTGT 840
CTTTGGAAAA AGTCCGTTAG AGTTTTAGCA GAGGTAACGT TAGCATTAGG CTAGCTATTG 900
TTTATAAAAG TGTTGGCTTT TAATTACATT TTATGTGAAG ATGAGAGGTT TGACAATGTT 960
TTATTGGAGG TAGTCTACTT TATTAAGTCT AAAATAAGCA CTGTACTGTC AACAAGAGCG 1020
AATTAAAATG TTAAAGTTAG TACATATGTG TTACTTTGAT ATATTTTACA GTAAT 1075