EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-29295 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:11779326-11780038 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTC2MA1479.1chr5:11779460-11779472AGTGTATCAATT-6.02
Foxd3MA0041.1chr5:11779657-11779669AAATGTTTGTTT+6.27
SP2MA0516.2chr5:11779961-11779978ATCACCCCCGCCCATTT+6.14
Enhancer Sequence
GAGGAGCACA CAGGTGCTTC TTGATGCTCT GTTTGTTCTC AGCGTTTCAT CTGAGGGTTC 60
AGTCAAACCA AGTCTTTGTA TGTATTTAAT GTATTTTTTT AATTTTGTAT TTAAATACAC 120
ATTAAGGTAA CATCAGTGTA TCAATTATAC TGACTATAGT GGGTCAACTA TTTTTTCGGT 180
AACGTTAGGC TAATGTTAGT GGTGCTATGC TTAAGTGAAA CAAACTCAAA CTTAACTTCC 240
ACGTGAAAAA GTGCCTGTTA AAATACAAAT TATACGGCTG TTTTACTTTA ATTTTAGTCT 300
GTTTGGGGGA AACAAACACT TATTTTACAA GAAATGTTTG TTTTTTTTAA CACTTACTGT 360
GTCTTTCGGT ACTCTGCCGG TTTCCACACG CTGTCGCTGA CTAACGTTGT GTTGCCGCAT 420
ATATGCTTCA AGCCAAGGCG CGAGCTTGCC TTGACAATGG TACCAACCGT TATAGGGGAG 480
GTCAAATGTA TGTTTTCACT ATCTATTACT TTTTATTGTT ATTATTACTT AAGTAACAGA 540
TGAGATGAAA CTTTTAATGT ATAATAAAAA GGCAGACCCC CCACACATCT TATTTGGAAT 600
CCTTCAGCAG AGATCATCAT GCGTTAATTA GGTGGATCAC CCCCGCCCAT TTAATTTGCC 660
CTCTTTGTTT AAATCATCAC TATTAAAAAA TCTGTTTTCA TTCATCTATT TT 712