EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-29232 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:8599354-8601459 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr5:8599966-8599983TGACCTTTTTATGAACT-6.99
Rarb(var.2)MA0858.1chr5:8599966-8599983TGACCTTTTTATGAACT-7
TBX19MA0804.1chr5:8600213-8600233TTTAACAAATAGATGCGAAC-6.3
TBX19MA0804.1chr5:8600213-8600233TTTAACAAATAGATGCGAAC+6.41
Enhancer Sequence
CTAAGAACAT ATTAAAATAA ATCTGTCTTT AATCACATCA TGATTCCTGT AATGAATATT 60
CAGAAACAAT TCTGAACAAT ACAATAATCT GCTCTCTACA TACTTGTGGT ACTTGAAGGT 120
TTGTTCTTCT CTCAGTCGCA TCACATTCTC CGTGTATATC TCCTCTGCAT CCTATTAAAC 180
CAAGAACAGC CGTGTTTAAT ATTATAATGA TTTACAGACA CTCAGACAAG TGCAGATAGA 240
CACTAGTGGT CCTGCTCAAG TTCAAGTTCA TTTATTTATA AAGCACATTT AAAAGCAGTC 300
ACAAGAAGAC TGACCAAAGT GCTGTACATA AGACAGGGTA AAAAATAAAA AGACAGAATC 360
TAAAACATAG AAATAAAAAA GAGAAATATC TGTGAAAATG AAGCAGTAAA AAGGACTATT 420
AAATTAATCT TAAAAAGCCA AGCTAAAAAG GAAAGTTTTA AGAAGTGATT TAACAATAGA 480
TAATGATGGA GCCATTCTAA TCTCAAGGGG CAAGGTGTTC CACAACCAAA GGACCCGCCA 540
CAGAGAGAGC TCTGTCCCCT CTACGTTTTC AGCCAACATT TTACCCCTGT CTTACTAGAT 600
AAGTGTCTTT TATGACCTTT TTATGAACTC TCATTACATA CATTTTCAAT ATTTTTTAAG 660
TGTATTTTGA GAACATTTTT AAGTGTCATG TCTCAAAATC CAACATGAGA AAGTGATGCT 720
CCAGGACACT GACCGAATCC AGGACACTGA CCGAAACCAT ACAGATATAA AGTTACATAA 780
TTCAAACACT TCAAACAATA CAAACAATAA TTAATTGCTA TTCTTATAAT AGTGTTAATA 840
AATACAATTA TAATCATTCT TTAACAAATA GATGCGAACA TAAGAGTGCC TATATTCAAT 900
TTTGAACATT AATTAAGATA AATCATATAT ATTTCTTCTC CTTGTTGTCA AATAACAGAA 960
CAAATTCTAA TGAACAGGTA ATTTATAAAG CCAAACAGGA GTCAGTAAGA CACGCCGCCA 1020
TTTTATGAAT CTCAGCATCA CATTACTTCT GTATTTGGAG TGTAAATGGA GTTTGATAAG 1080
GCAGATCTGC TGCTTTTAAT GGATATACAC TAATATATAT CGTGTTTCAT GTTTAAACAA 1140
GCGCTTATAC AGTGCTAATA ACTTACATTT GAGGTACAAA ATAAATACTA AGACAAATCT 1200
TACCTGTAAA CGTATTTAAA TCGACTCTGA TTAAAAAAAC AAATCTCTGG TTCACCAAAA 1260
CACCTGTAAT GCTTCATCAA ACAGGAAATA TTAACGAGTC AAACAAAGAT TTCCTGAAAA 1320
ATCCGTTTTA TTTCGCTTCT AACACAGCCG TGAAGGAAAT AAACAACGGC TAACGTTAAC 1380
TAGCGTATTT TTCAACTCGG AGAAGCTCCG CCCACCGCGC AAAACTGACC AATAACCTAA 1440
CAGCTGACTG TAGAATGTTG GAACGCGTTC GAATTTATGA CGGAGTAGGA GACACATAGC 1500
CTTTTACAAA CCAAATTCCG CCATTGCTCT TATTTGACAA GTAACTAGTG AGTTGCACAA 1560
AGTTTGCTTT AAATAATTTG CTTTTCTTAC ATTGTCAATT GATAGCGTAC GGTTTATTGA 1620
GGCTTACTCT GATAAACTAG CCTTACTTAC AGTAAATTTC AGTGTTTATT GTAGGTGTAT 1680
TTAACATTTC TCATATTTAA GTGTACGGAA ACTAATCCTA ATGTTATTTA CCGTACTCGG 1740
AGCTATTGCT CTCTTCCTGA GAGAAAGAAA CATCAGTACC ACCGTCTCAG GTCAAGATGA 1800
AACACTGGAC CATCAAGAAG AAGGACTGGT CACGGTACCA CCACCTGTGA CCAACACTGA 1860
TGGTAAATAA TGTTGTGTGT TTAAAGAACA TGTACCTCAT TTTGTACACT AGAGTCTGTG 1920
TAGGGCTCTA CACCTGTTTT ACCCTACTGT AAATATTATT TACTAAAAAA CAAAGTGAAT 1980
ATTAACACAG GCCTAATGAA AACCGCTCTA CACAGGGTGT CAAACGTCTC ACAAATGTGT 2040
CTAATATGGT GCCAACAATG ATATAAAATA ATAGTTTTGT CTTGTTTCTA GCCCAGATAT 2100
CTCAA 2105