EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-29215 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:7589455-7591857 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr5:7590141-7590152GTTTTATGACC-6.02
CDX4MA1473.1chr5:7590141-7590152GTTTTATGACC-6.02
Foxd3MA0041.1chr5:7589884-7589896AAACAAACAATC-6.92
Foxj3MA0851.1chr5:7589877-7589894AAAGTGTAAACAAACAA+6.22
KLF9MA1107.1chr5:7589635-7589648GGACACACCCACT+6.23
Enhancer Sequence
CTTCCTAAAT AGATTAACAT AACTTTTACA GTCATTTATT AACAGACACT ATGCTTCCTG 60
GCAGAATCCA CTCAGACTCA CTGTCTGTAA CAGGTGTATT GATTTCTATG TACACTAGCT 120
GCCACGTAGA GAAGCATTAT AAGAGACAGA TAGCATCTAC AACAGTGCAG ACAGCCTGAT 180
GGACACACCC ACTGGACAGA CAGAAGATGA ACTGTGGACA CACCCCTCTC TGTTAGATAT 240
GCAAGCACAA CCCTGTCTCC CTCAGGGGAC CAATGACAGC TGGGAGATGG ACAGCGCATT 300
GTAAGCACAA AAGATGAGAT GCAAAAAAAT CAACTATTTT ACCCATACAC AAAACAACAT 360
TCCACATAAG CGCTCAGAAA TCAAGACGTG TGTGTTTGTG ATTAATAACA AATGCAAATT 420
TAAAAGTGTA AACAAACAAT CTGTTTTCAA GAGAGGATGC TGAGGGTATC CAACAAACGC 480
ATTTCCGCAT ACGGGCTATT TAGGATTCAT TAATATTCAT GAACAATTTG CATGTGTGAA 540
ACCGAATTCG GAAGGTAAAC AGTCCAGTGC TGGTGTTTGA CGGGCAGATT ACGATGCAAA 600
AGGAGGATTT TGTGTGTACT GGCCCTTTAA ATGCCAATAC TTCACTTGTT TATATTCATG 660
AATCCATTCC GATCACTTAC ACGCAGGTTT TATGACCACA ATCGGCGGTG AAACCAACAA 720
AATGCATTAT TTTATGTTAA AAATAAGTCA TCTGAAACTA AAACTGAACA TTTACGTTAG 780
GAATGATTTC CACATCTAAC GCAATTAAAT CTGTATTTGT CTTTTAACAA ACAACACAGA 840
CGACTTTCAG TTTGGATAAA GTTCTAATAG CATTTATATG CCCTATAAAT ATCATTATAA 900
CCTAAATCGC TAATAAACAT AATATTAAAT GACCGAGCAA GTCCTACAAC AGAACGAAAC 960
ATCACATCTC TACAAACAGG CTGGCACAAA ATGCCCCAAA ACACAGTGTT GACAAGTCGA 1020
TCACCAGAGA GAGGAACCAT TCATCCTCAA AGCGTTTCGC TGACGTTTAT TCAACCATAA 1080
TGACTCAAAA CATGACGAAG ATAGCCAAGT TACGAACACC AGAGATTGTA AATATTTACC 1140
ATAACAAACG TTCAAGCCGT TCGTAAGGTT ATCCTGAGAT GCTTAGAGAT GATTTCGACT 1200
ATTAGCAAAG CGTTAGCTCG GGACTTAATA GATTCCTTGC AGAAGCTCGC TAGTTAGCAT 1260
TGCTCTGATC TGATAGGCGA ATTCGTACAG AAACCCGAGC CGCTTGTGTT CTTGTTTTTT 1320
CAAATAGCAA ATTGAGTTTT GATATAAATA ACAGTCTGAG AGCACTTTAG TCGTTTAGTC 1380
AAAACAAATG ATAGCCGCTG CTAAGCTAAG CTAGTTCGGC TACGCACATC TTTCTATCTC 1440
CCCTCGCGAA CAATAAAAAC ACTTTTCGCT TTCCTCCATT CTTCCCCCAC TTTGTACATC 1500
ACTCAAAGAA ACGTTTTCGT GTTGTTACAA AACACGTTAG ATATTACAAA ACAACCCGTC 1560
AGAGTTTCCA CACAAAAACA GTCGCCCGTG TTTGTGTCGC GAGGCCTTCT GAAGCCTCGG 1620
ACTTGACGCA CGAGCGCGAC GCCGGGTCAC GCGCTTCCCG CCACGGGGGC GCGCCGGAGG 1680
AGAACCACTA GCCGAGCCGT TGCGACGTTC GTCTCCGTTC CGTCGAGAAA AAACAAAACG 1740
TAAATGTGTC GAAAACGTGG TAAGAGAGCG CGAGGATTGC CTTAGGAGAA TTTATGACAG 1800
GCTTTCATAT TTACCTTAGC TTGGGGTAAC TTCAAAGAAG AAAAAATAAG GGGACTGTTG 1860
TTGGGATGAG AGGCTGGTAG TCGGTCTGCT GTAAGTCTCT GGCTCCCCCT CTCTGCTATA 1920
AAAAGATCAG CGCGGGCTAG CGGGGTTTGT TTAGCCGAGC CAGCTAACAA CAAGCCAACT 1980
CTATCTTTAT CTGGGGTGGG GGAGGTCAGG CTTTCTCTCA TCGCACTTTT AAAAACATGT 2040
AACGGGATGG AGCACACTTT TAATTCGGCC GCGTCTTAGC TCGTCGCCTG GATGCTCGGG 2100
AAACACTTTA GCGTTGCGCC TTTGTTTGCC AACAAAAGCC CCACCACTGA TGCTTTGTGG 2160
CTAGTCAGAG GGAATTGTAG GTTGACCGGA AATACAAATA TTAATAACGT GATTGCACAG 2220
ATGTGCTGCG GACGATTTCC AGTCTGTTCC TCCGTCGGCT GCGAAAATTA ATTTAATACT 2280
TCTTTTTCAA TTGTGTATTT TTGTAATCCA CATCAGAATA CATGTAATAA TGACAATATA 2340
TCTAATAAAC ACACTGTAAA TGCTGGGTTC CACACAATTC CTTCATGTTG TCCCAACACA 2400
AA 2402