EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-29117 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:2539685-2540928 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr5:2540588-2540599GGCAATAAAAC+6.32
CDX4MA1473.1chr5:2540588-2540599GGCAATAAAAC+6.62
HNF4GMA0484.1chr5:2539806-2539821TGGCCTTTGCTCTCT-6.5
HOXD9MA0913.2chr5:2540589-2540599GCAATAAAAC+6.02
POU1F1MA0784.1chr5:2540497-2540511CAAATTAGCATAAT-6.42
POU2F1MA0785.1chr5:2540499-2540511AATTAGCATAAT-6.44
POU3F1MA0786.1chr5:2540498-2540510AAATTAGCATAA-6.37
POU3F2MA0787.1chr5:2540498-2540510AAATTAGCATAA-6.22
POU3F3MA0788.1chr5:2540498-2540511AAATTAGCATAAT-7.82
RREB1MA0073.1chr5:2539946-2539966ACACAAACCACACAAAAACC+6.06
SPIBMA0081.2chr5:2540126-2540138TACTTCCGCATT-6.62
SPICMA0687.1chr5:2540126-2540140TACTTCCGCATTCA-6.12
Enhancer Sequence
CACACACACA GCCTGATGAA TGATAGTAAA AGTGCATGTA GGCTGATAGA ATCACTATAT 60
AAATACAGTT TATCAACACA CACTCGTCAT ATGTGGATTT ACAACACTTC ACCACAGCTT 120
GTGGCCTTTG CTCTCTCTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 180
GTGTGTGTGT GTGTGTTTAG TATGGGTGGA GGGTTTAACA GCCTGAGAAA GCTCAATGCT 240
TCCACATAAG ACACATGGTG GACACAAACC ACACAAAAAC CCCGCTAAAT CGTGCGCACT 300
TAGTTCACAC AGCAGCCTGG CGAATATAAT AGCGAACACA AGCGCGAAAA GATCAAGTTA 360
AATCAAGAGA AACTGTAAAT ATGATCAGGA TACTCACTGT GAAAGAATCA GCTGACACAA 420
CGGTGACTCA GTAGAGCGCA CTACTTCCGC ATTCACTGGC GATGACCTAT GCGTCAGCCA 480
ATCACGAGGC GCTATGCCTA TGCGCTCGAC TAATCAGGAG GCGGGATTCG GAGAGTACTC 540
GAGTACTAGC AGCCAATGGG GAATTACGGT GGGTGAGCGG CTCAAACAAC AGGCCGCCTG 600
AATCCACAAA CACACCCACA GACGGGCTAA TCAGAGCGAG GGTGAAGTAA GGGGGCGGGT 660
GAAGCGTGAG CCAATAGAAA ATCACAGCGC GGCACTAGGG GACCACGTGG TGCTCATGCA 720
CGACTTGTGT TAAAGCGACG GAGACGCAAA CAAAACAGTT GAAGGAAAAC TGAGCGGAGA 780
TCAGTTAAAG AGGGAGAAAA TAGTCAATAA AACAAATTAG CATAATTACT ATGTTAATAC 840
CGAGCAAAAC CAGAGCACAC ATGTTAAAAA CTGAGCGGAG ATCATTTATA GAGGTAGAAA 900
ATAGGCAATA AAACAAATTA GCATACGTAT TATGTTAATA TCAAGCAAAA CCAGAGCAGA 960
CGTGTTCAAA ACTGAGCGGA GATCAGTTAT AAAGGTAGTA TAGTTAATAA AACAGCATAT 1020
TTATTATATT TATCGCAAAC AAAACCATAG CACATTTGTT CAGAGCATAA CATTACACCG 1080
TATACGGTGT TATTGTATAT CGATGGTTTG TTCTGTAGAC TATCAAAAAA TATTGCTTAA 1140
AGGGGCTAAT CATTTTGACC TTAAAATGGC TTTTTAAAAA ATTAAAAACT GCTTTTATTC 1200
TAGCCTAAAT AAAACAAATA AGACTTTCCC CAGAAGAAAA AAA 1243