EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-29113 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:2429093-2430327 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NRF1MA0506.1chr5:2429423-2429434TGCGCATGCGC+6.32
RFX3MA0798.1chr5:2430092-2430108CATTACCATAGCAACA-6.09
RFX5MA0510.2chr5:2430092-2430108CATTACCATAGCAACA-6.23
RFX5MA0510.2chr5:2430092-2430108CATTACCATAGCAACA+6.2
Enhancer Sequence
TGGTTTCTTG AACATGACGA TGAGTTCACT GCACTCAAAT GGCCTCCACA GTCACCAGAG 60
CTCAATCCAA TAGAGCAGCT TTGGGATGTG GTGGAACGGG AGATTGGCAT CATGGATGTG 120
CAGCCGACAA ATCTGCAGCA ACTGTGTGAT GCTATCATGA CAATATGGAG CAAAATCTCT 180
GAGGAATATT TCCAGCAGCT TGTTGAATCT CTGCCACCAA GGATTAAGGT GGTTCTGAAT 240
GCAAAAGGTG TCCAACCGGG TACTAGTAAC TTTTGCCTAA TAAAGTGGCC GGTGAGTGTA 300
TGTTGGACTG AGCTACAGCT GGACTGCTTC TGCGCATGCG CCGCTTTATG TTTGTCTCCT 360
CCGGGTCTCC GTAGCGCGCA TGACACATGC AGTCAGTGTG GATTCAGAAC ACAACTGAGC 420
GGGTTTGTGT TTGTGTTTTT ATAACTTAAG TTCCAACTTT GAAGAAAACT ACCCTCGCGA 480
AAGGTACGTG TGTCATTAAA CAGTCATACA CGCTCGGTGT GTGTTAAATG TGTTGTTTAA 540
CGAATGGATA AGACTCTCAC TGTCAAGGAC AACATCTATT TTATGATTGA TTAAAGGCAT 600
TTCGCCACAT AGATTAACGC CTAAGTTATA TTTCATTATG CTACTAGTTT TAATTACACA 660
TCACTTTATT AATTTTCCGC TAAATGTTTT GAATTTCAGC TGTCACAACC TGATCAAAAA 720
CATGTTAAAT TTCTCTTCGG TGTCTGTCAG ATTAGCTAAT GTTAGAGCAA TAGATTATTA 780
CCCTCGTGGA AATTATACTG TAATTAAATG ATAACTTTCT TAATGAATGC TGTATCATAC 840
TTTTGTATTA TCTATAGTCA ACTGATAAGT TATAATCAAT ACTGTAGCTA TAATAAAAAT 900
GTTTGCATTA CAGTAAACTG TGATGTATCG TGTAGTATAA TATACACTCA GTAGAAAACT 960
ACAGAATTGG GACATTTGTT TATATTCCTG TATTTATTGC ATTACCATAG CAACAATAAA 1020
ATCACCACAA GCGATTAATT CACGTAATTT ACTATGGTAT AGCCTGTAAA TGCCAGAGTA 1080
TTACTTTAAA TGACCATACT ATAGTATTTT TTTCATGAAG TCACAGCAAG AAGGTTGCTG 1140
GTTCGATCCT CGGCTCAGTT GGCGTTTCTG TGTGGAGTTT GCATGTTCTC CCTGCGTTCG 1200
CGTGGGTTTC CTCCGGGTGC TCCGGTTTCC CCCA 1234