EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-29096 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:2012605-2013297 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr5:2012743-2012754AAATCACAGCT+6.14
Lhx3MA0135.1chr5:2012827-2012840TAATTAATTATCA+6.08
Enhancer Sequence
ACGAGACAAA ACAATCCTAC TCATGATCTT TGAAATTTGC ACTTTGCTCA TTTTACAAAT 60
ATCACACACA ATAATTGCGT TAACATTACA AAACAAAATT AACAATTTTT TTTAGTTTAT 120
AGAATTTTAG TGACCTAAAA ATCACAGCTT TTGTTGTTCA TTTACAATAC CATACGATCA 180
AAAACAACTA TTTAGATTGC CAGTGTAAGA GTAATCATAA TGTAATTAAT TATCAAATGT 240
GACGCTCACC TAACAACAAC AACAACAACA ACAAAAATAC TACGAGTGAT CTTTTAAAAT 300
TAGCGCTTTG ATCATTTTTA CAAGTATCAC ACTCAATAAA ATAGCCTTTA AAGAACTTCA 360
GTGACCTTTG GCTTACTGTG CAAGCATTCG CGCGGCAGAT GATGGACCTC AGCAGATCAC 420
GCGCTTACAG CCTGTCTACA GAAATACTCC TAAACCAGCG AAGCCTCCTC GGAAACGCTC 480
CGTTTCTGGC AGGTGCAGCT CATGAGTGAT GCGGACATCA GAGCTCCACA CGACGGCGTC 540
ATTTTTTGGA GCTCGTCCTA CATTAGAAAG CGGAGCAGAA AGCCGGTGTC CTTGATGCTC 600
CTTCCAGAAA AAATAACCAG GCTTTCCTCA GGATTTATGA TTTTCCCTTA CGGACTTCAG 660
ATGACAGGGA AGGTTCTTCT AAATTTATAA GA 692