EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-29057 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:896257-897287 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr5:896282-896297AATTAATAATTACCA+6
RFX1MA0509.2chr5:896342-896358TGTTGCTATAGCAACT+6.16
RFX1MA0509.2chr5:896342-896358TGTTGCTATAGCAACT-6.16
RFX2MA0600.2chr5:896342-896358TGTTGCTATAGCAACT+6.59
RFX2MA0600.2chr5:896342-896358TGTTGCTATAGCAACT-6.59
RFX3MA0798.1chr5:896342-896358TGTTGCTATAGCAACT+6.17
RFX3MA0798.1chr5:896342-896358TGTTGCTATAGCAACT-6.41
RFX4MA0799.1chr5:896342-896358TGTTGCTATAGCAACT-6.03
RFX4MA0799.1chr5:896342-896358TGTTGCTATAGCAACT+6.04
RFX5MA0510.2chr5:896342-896358TGTTGCTATAGCAACT-6.93
RFX5MA0510.2chr5:896342-896358TGTTGCTATAGCAACT+6.98
Enhancer Sequence
TAGCAACTGT AGAATTACAT CAACTAATTA ATAATTACCA AAGTTGTTGC ATTACCATCG 60
CAACAATACA TAATTACTAT AGTTGTGTTG CTATAGCAAC TATAGAATTA CACACGCAGA 120
TTAAATTCTA AAGTTGTCGT ATTACCATAA CAACAACAGA TTACCACCGT AGCAACTAGA 180
GAATTAATAA AACAGTTCAG CTCTCCTTTA CAATAGTGTG CTTCAAAAAC AAACAGCTCC 240
AGTGTTTATA GCATTAAGTT ACTCGAGGCT ACTATTTATT CATGCGGCGC TTGTTTATTA 300
AAAGTGCTCC GAATGAAACC GCAGGACGCC GGAGCATGCA TCTCTGTCAG CGGGACTGAT 360
CTCTGGGAAT TTCTCGCAGG ATGATGTTCG CTCTCCAGCG TTTAGTCTCT TTTATTCTCT 420
CCATTGAGGC CCGTTTAACG CGGTGAAAGG TGCGCGTTCG GCGTGTAACC GCGTCCGACT 480
GAATGAAGCG GCTTTAAATT CATTTGGTTA ACTTTGTGCT TGACCTGAGA GAGCCGGAGA 540
AAAGATGCCC GTCCCGGGAG CTTTATCCGC GCATTGACGG GCTCTCCTCG GCCTCCGTAA 600
CGCACCGTGA ACGGCTCTTT CTGTCCTCAT TCACGGCGTG TCAAGCAGCT AATCGCCTTT 660
CCATCTTTTT GTTGGGCGAA TTCCTGCGTG TTTTTAAACA AGCCGTCGCT TCATTCACTC 720
GCGCTTATTG CTACAAACGC GCTGAAGGGA TAATGAATGT GGAATGAGTC AGTGGAGGAT 780
AATGAGTGTC AGTATTCAGC TTCTTTGATT TTGACGTTAA ATGCGAGTGT CTTTCTTTCG 840
CGCGTTCAAT GCGCTTTTAC AGTCCCCCTC CCCGACATTT AACGCGTTTA ATCCGGTTAA 900
ATAGAGGTCA TATTTCGTGA CCGAAATAAT AATAAAGGCG ATTGGTTTCA TTCATTTGGT 960
GTCGACAATG ATGAGCTGCG TGCTTTTAGT TTGCGCACTG GAAACTTCTA AATCGCATCT 1020
CTGACTGACG 1030