EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28938 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:74811475-74812462 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr4:74811952-74811962GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr4:74811952-74811962GTCACGTGAC-6.02
CDX1MA0878.2chr4:74811481-74811492GGTCATAAAAC+6.02
CDX4MA1473.1chr4:74811481-74811492GGTCATAAAAC+6.02
IRF1MA0050.2chr4:74812169-74812190CAATGGAAAGTGAAAGTTAGA-7.14
IRF2MA0051.1chr4:74812173-74812191GGAAAGTGAAAGTTAGAG+6.24
LMX1BMA0703.2chr4:74811552-74811563TTAATTAAATT-6.32
MITFMA0620.2chr4:74811948-74811966TTTAGTCACGTGACCTGG+7.35
MITFMA0620.2chr4:74811948-74811966TTTAGTCACGTGACCTGG-7.35
USF1MA0093.2chr4:74811952-74811963GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr4:74811950-74811966TAGTCACGTGACCTGG-6.91
Enhancer Sequence
TGTTGTGGTC ATAAAACAGG GTTGTCGCTA GATCAGACAC AGTTGTGACC AGAAGTTAAC 60
AGGAATTATT TACATTATTA ATTAAATTTC CCATTGTATT TTATTAACGT CTACCTAAAA 120
CCTAAACCCA ACCATCTTAG TACTGTAAAA ATATTCATTA TTGTTTTACA GTGTTACAAA 180
AATGATGCTA AATTGATGGC GCATCCGCAG CTGTATCCTA TCTAGACTAC ACCATAAAAC 240
AACACGATTA AAATACATAT AATCAGGATT TCGAAGTATT TGTATAAGTC GGTATTCGAA 300
CACAGAAGTC AGTTGAAGCA CAGTAGCAAC ATGCACACAC ACGGTCCACT ATACTAGACA 360
GAATATTCTA TAGACCCTGT TAGTCGAATG CAGATACTCC AGGTCTCGAA ACGCTTCTGA 420
AATGATCGAC ACTTTGAATC GCCTTACTCA CGTGACCAGA TGTTTCGAAA CACTTTAGTC 480
ACGTGACCTG GGTGTTCCGG ATCATGCTTC AGTGCAGGGT TTCGAAACAC TTGTGCTTCA 540
GGATCTAAAC ACTGTGTCGA AACGTCAGTT TCACGTCAGC CATCCCTACT GAAAAGTGAA 600
ACAAGCTGAA TTTAAACAAA CAAAATAAGT CGAACATTAC TAAATATCAT TTGATCTCTC 660
GATTCTCAAA GGATACCGAA TGTGTGCATC TGCCCAATGG AAAGTGAAAG TTAGAGCGTG 720
TTGTGGCAAG TTTAATGTAT AGGACAAGTG CTTTTTAAAT TAGAAGTGCA TTGCAAACTG 780
TCCAAATGAA ATGAAATACC ACAGGCATAT CACTAAACAG CAAAGTCTCC TGTGAAGGGG 840
ACGATCACCC AGTGCGATCA GTAAACATGA GTGATGGTAT TGCACAGTTT CAGAAGTGCG 900
TTTCAGATTT ATTCAAACAT GTTCTCAGCT TTACTTCTCC CACACATTGA TCTTTTAATG 960
AGAAAAACTA TTGCTGTATT TGTGATT 987