EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28850 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:72292042-72293067 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr4:72292670-72292681ATATTAATTAC+6.02
FOXB1MA0845.1chr4:72292662-72292673TTATTTACATA-6.02
GATA6MA1104.1chr4:72292378-72292391TTTCTTATCTCAG-6.07
LHX2MA0700.1chr4:72292414-72292424GTTAATTAGT-6.02
mix-aMA0621.1chr4:72292413-72292424AGTTAATTAGT+6.14
Enhancer Sequence
CCCCCTCACA GTTGTCATGA AGGGTAATAT TAGCTGTATT AACCAAAATC TTTTTTTGTA 60
CCAGGCTGTA AACACCTTTT TTTCTGCTGT AAAGTTGGCC ATTCTAACAG TGGGCTCAAT 120
TAAAATTTGC TCTATTATGG AGCCAGGAGC GGCCAGGACT AGCGGAATTT CGGATGAATT 180
GCAGTTTTAG TTACTTCCGT ATTGGCTTCC TGAGGGAGAG CGGGAGGTTG CCGCTTGGTA 240
TGTGTGTGTG TGTTTGTGTG TGTGTGTGTG TTCCCGACCT GTCAGCTGTT AGCTCAGCGG 300
CTCTTCAATG CACACAATAC TTTACTGACT CGCAGCTTTC TTATCTCAGT CCTCAACTTC 360
TGTTCTCTGT CAGTTAATTA GTCAGATCAC CTGCAGTAGC TTTAAATACA TTTGATTTTA 420
TTATTATAAC ACGTGATGAG TATTATTTAA AACAGACCCG ATTATAAATA TTTAAAAATG 480
CGCATAAATC TTTATGCGCG CGACCAGGAC TTTTATTTTG GTCAGGCGTT ATGATGCCAT 540
AAATCTGCGT CGCGCATGTT TGTTATGATT CGACTGGTGA GTGCTTCTGT TAATGCGGTT 600
TACTTTTAAA GAGTGTTGTT TTATTTACAT ATTAATTACA AATGAATTAT GATTTCCTGT 660
GATAATGTAA AGCTTTGTTT ACTGGTAAAG TGCTTACCGG AAAAGTGTAT TGTATAATCT 720
CAGTCAGTTT ATTCCTGGTT ACACACGTTT TGTCCCTGGC AAGTAGTGAT GAGAGAAAAC 780
GAGCGTTTAG AAACTTAATT GAATCGGATT GGAGCTTTCA TAAGTGCATC AGATCAGTGC 840
ATCAGATTTT ATTTCAATGT TAAATGCTTC CGTGAAACTC GTGTAACATG TACTGATTAG 900
TTTAACCCCT TTAAGGGGTA GTTCACCTAA AAATGAAGAT ACTGTTATTA ATTAGTCTTC 960
CTTGTGTCAT TATAAACCCC TGAGTTTTTC CATTCATGTC AAAACACCAA GATATTTTAG 1020
ATGAA 1025