EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28758 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:69666483-69667639 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr4:69666766-69666778TTTGTTTACTTT-6.62
FOXP2MA0593.1chr4:69666766-69666777TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr4:69666763-69666780TTATTTGTTTACTTTTT-7.28
TFAP2AMA0003.3chr4:69667405-69667416CGCCTCAGGCT+6.14
TFECMA0871.2chr4:69667221-69667232TGTCACGTGGG-6.02
Enhancer Sequence
CAATAAACCT TTGGAAACAC TTGATGTTCT TTAATATTGA AACAATTACG AATACATTTG 60
TATTATTAGA GTTGCATCTT GCATATTATA TATAGATTTT GCACGAATTC TATTGTGGAA 120
AACAACAATC TGGTTACACT GTTCCTTATC TTAAAATGTA TATATTGTTC TAATGCATGA 180
CCAACGTTAT ATGTGAGAAA AATATGTTTT TAATAAATGA ACTTGATGTA ATTAGATAAC 240
GTCGCTAGTT TACAGTACAT GCTTTATCAA CAAATCGTCT TTATTTGTTT ACTTTTTACT 300
TACCTTGTGG AAAACCGCAG TGAACCTTGG GATCGCAATG AACCTTGGGA TAGCGAGCAT 360
AGACTGTAAA AAAATAGATC GCCACATACA ATGACCCCAA CTTTAATAAA TAATTTAAAA 420
TGAAAAATAT CAGCCGAAAA CATTTTTAAA CTTAGTACTT GAAATTTAAT ATTTTTTAAA 480
GTAAAAAAAA TAAAAATAAT ATGAATGAAT CAAAGTTTTA TTAGGCATAG TTACCCTAAA 540
CTGGACAACC GAATATATTT TCACTCATTA AATATAAAGT AAATGATAAT ATATTTATAA 600
ACACCAACTA ATCTCCAATA AAAATATATT ATGCAGCATT AACGTAATAT TTAATGTTGA 660
CAGTTGAACT CATTTGAGAG CTCACCGCTG ATGCAGTTTG ACCAATAGCA GAGCGGCGTT 720
AAACTCACCG TGAAGTGATG TCACGTGGGC CGAAGTTTAT TCATACAGTA GTTTCGACCC 780
CGTTTACAGA CGCTTTTCAT AAACAAAATA AAAATTACAT ATTTTTAAAA TGAGAAAACT 840
GTGATAATAG GCGTAAATCA GGTTTTTAAA AGTTTGTTGA CATCTATTGG TAATTATACG 900
AGCCTCCAGC GTCTCCCTAT GACGCCTCAG GCTCAGGCAC AGATTCTATA GGGAATCCCT 960
GCACGTCTAA ATATGACGCT AAAGGGGTAC CCTGTGCGTC AATAACTGAC GCCGAGGGTT 1020
CCTGACCAAG CGTCAGTATA TGACGAGTTG GGAGTGAGAA CGTGTTGGGT GAACATCAGT 1080
TAATGCACTG AGAGTCAACA AGAACTAACA GAGAACAACT TTACTGTCAT CAACTAACAT 1140
GAACAGATCA ATAAAT 1156