EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28719 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:68873859-68874926 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FERD3LMA1485.1chr4:68874309-68874323GCGGCAGCTGTGAC+6.51
Klf12MA0742.1chr4:68874361-68874376TCTGTGGGCGTGGCC-6.17
SP1MA0079.4chr4:68874363-68874378TGTGGGCGTGGCCAG-7.01
SP3MA0746.2chr4:68874363-68874376TGTGGGCGTGGCC-6.64
SP4MA0685.1chr4:68874361-68874378TCTGTGGGCGTGGCCAG-6.57
SP8MA0747.1chr4:68874363-68874375TGTGGGCGTGGC-6.22
Enhancer Sequence
ACAGTTGTGA ATCTGTGAAT GTGTAAATGA GTGATTCCAG CAAGTCTCAA ATTACATCGA 60
CAGAACCTAA AGGGGCTTTA GCTGATGTGT ACTGTATGCT TGTGACAAGA GCTATTGCCT 120
ATTTCTGCAT TGTATGTACC ATATAGTTAG AGGTATAGTA GCTTTGCTAC CTGTATTAAA 180
TCAGTCTGGC CTCCAACCAT TTATTGGAAT CTCCTCAATT TTTGTCTGCT TTGAGTTACT 240
GTGCGTTTTG GTTCTGTTGA TGTAATTTGC AGATGATCCC TAAAACTGCG TGCGCGAATA 300
TCAAACCTTA AGTTAAGTTT ACTGAGCTAG GAGGTGATTG GTTTTCTAAA GTATTTCCCA 360
GTTCACGCTC GAGGGCTCGT GAAGCTTCAC GAAGCCGCTG AGGAACAGAC TTCGCCATGT 420
TTATGCTGCC AAATGTCCCA AATAGTCCTC GCGGCAGCTG TGACGACATA ACCTAAAACC 480
TGCCTTGCAG CAACGGTGGC CGTCTGTGGG CGTGGCCAGG CCAGAATGCA TTTTCAATTT 540
CAAATCGGCT TTCATTCGTC GCGATGTGTT AAATGAAAAT GGATTATGTT TTTTTCATTT 600
TCATTCTGCA GCAAACATTG CACATATGTC TTGGAAAATG CTAACTGAAA TACAGAAATA 660
CACTGCCTTT TACATATTGC ATTATCGTTT TGCATATTAC ATTTCAAAAT TAATTTTGCT 720
ACACACATCC CATGCTGTTA TGCTGAAAAT GTAATCCTGC GTTTCCTAGA CGCGAGTGTA 780
AATGCATTTA GGACAAATAA CATTTAAATG ATCATTTTGC TACAGTTTCT GCTTGTACTT 840
TATTCACATC AAATTCAGTT TGTGTATAGC ATTTTCAATT TAATTTTGCT ACTTATAAAG 900
CTTTAAAATG TGGATACAAT TTACATGTTA AAACAGTGTT TGAAATGAGA AATGCAAACA 960
ATGTAATTTA ATTTACATTT TCATTCTGCA CCAAACATTG CTCATATGTC TTGGAAAATG 1020
CTAATTCAAA TACAGAAATA CATTGCCATT TAACATATTG CATTGCC 1067