EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28671 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:68414500-68416246 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr4:68414573-68414590AGGAACTAATTAAGGCG-6.08
Alx4MA0853.1chr4:68414573-68414590AGGAACTAATTAAGGCG-6.2
Foxd3MA0041.1chr4:68414729-68414741GTATGTTTGTTT+6.37
Enhancer Sequence
CTTCACTAAC AAGTGCTCAC AACATGGATG TAGCAGATGT CATGTGTGTT TAAGATCTTA 60
TGCCAGTTCA CCTAGGAACT AATTAAGGCG GAGCTAATTT CAGGGGGAAC TATAAAAATG 120
ATGCACCACT GTGAGTAGAG AGACAAATGC ATTCACTTCC AAGCATTCAA CAAGCTAAGG 180
AATGCTTATG CTTTTCTTGA GTTTCTCCCT TCCGTAACCA GCCAATGAGG TATGTTTGTT 240
TTGTATGATT TGTTGGTTTT GTTTGATTTG AAGTGTGGTG TTGTTGTTGC TGTTTGTTTG 300
GTGTGTGCAT TTAACTGTTT GTTTATGAGC GGTGCTATTT ATAAAGTTAA ATTGTATTAG 360
TTAAGATTAT GTGATCCAGT GTTATGTGTG ACCTTAATGT GGTGATTTGG ATTAATTTGA 420
TATGGAATTG CACTGTTGTA ATTCATTGTT GTATGTTTTT TAGTTCTTAC GTCTGGTACA 480
CCCCTGATGT CTTGTGGTTT GCTCTATGTT GAGAACTGAA GACTTGCTAT GAAAATAAAC 540
CAGTCAGTAG AAACCAAAGA CTCTTGCTCG TTTGTTGCTG GAGGGAGCTA CAGTAAGAAC 600
TCAAGGCTCA TTGCGAGTAT GAAAGAAGAA GCAGGACAAT TTAACCAATG AACTCAGTCA 660
AGTATTCTGT TGTGCAAAGC AACGAAGTGA AATTATACAT GGTTCAGCAA TATCAGAAGG 720
AAAGGACATT GCCGGTGTAA TATGGAGACG CAAGCATAAC TTGAAGAGCA GCACAAGTCA 780
AGACCAACAG TAAGAGTGGT GCAGTTAAGT GTGATTAAAG GTACCTAACT GTGGTTAATG 840
GCTGCAAAGA CTTTAAGTAT TGTTTAGTGT TTAATATTGT CATGTTCCTT TCAAAATGTT 900
GGTGGTTTAT TATTGACTTG TATGTAAATT AAGTACTGTT TAACTGCCTG TTTCTATTGC 960
TGTGAAATAA GGGTAAATTT CACTTTCAGT GTTTAATCAG ATTAAGGCAT GATTTATGGT 1020
CTTAACTTTA AATTAAGGAA TAAATAATAA AGAAAAGGAT TTTAGAAGTG ATAAAGGAGA 1080
AATTTAAACA ATGTCAGATT TAGGTGAGCG GCCCATGGAT GATAGAGTGA ATCAGCAACT 1140
TGCAACTCAG CCCTCAGTGA GAAGTAAGGT GGCAACGGAA ACTTCTGATG CTGTGGAGAC 1200
TGAGCTACGA AGAGGAAAGA GGACTCGTAA GCTGACTGAA AAGGGTCAGA AGTTGCAAGA 1260
AGAGAAGTTG GAAAGGTATG AACAGAGATT CAAGGTCCGT TATGATAAAT GGAAATCTCT 1320
TGTCAAAGAA GTAAAGTGGT TATTATCTGA GTCTTCCTCA ATTGAATCAT TACAAGATGT 1380
TATGGTAAGA ATGACAAAGG CTTCTGCAGT TGTAGGCACT GGGTATGAAG ATCTACGCCA 1440
TTTGAGTATT CCTGACCATG ATACACGCCG CCGAGTAGAC CATTGTGAAG CAGTCACAAA 1500
GAAAATGGAG GTTTTGGTGA AGCATTATTT CGAAGGGAAT AAGGAAATGG AGTCTGGATG 1560
GAGTGACATT GAGTTATCTG AAGAGGTCAG TGTGGGCACA AGGATTTCTA GAACATCTAC 1620
ATCGTCTCAA AGTAAGTCAA GATCTTCTAA GTTTTCAAGT TTATCTGCTG CCAAAAAACA 1680
AGAAGCTGCT GCTGAGGTTG CTGCTAATGA AGCCACTTTA GAAGTCTTAA AGGAACAGGA 1740
TCGTCA 1746