EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28473 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:64696544-64697614 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr4:64697552-64697569GGCTATTAATTAGTTCA-6.07
IRF1MA0050.2chr4:64697267-64697288AATAGGTTTCGTTTTCTTTTT+6.19
IRF9MA0653.1chr4:64697271-64697286GGTTTCGTTTTCTTT-6.02
ZNF384MA1125.1chr4:64697180-64697192TTAAAAAAAAAA+6.44
Enhancer Sequence
AACTAACAGG TTTGGCAAAG CCTGTTTCTT TACAGAAAGT TTGCTTATAA CAAAGGCTTG 60
TTGATGCCTT TGTGTGATAT TGAGCAAACA AAGGGATGTT TCTGTGCTTG GTTGTACGAG 120
TTATACCACT TCATCATAAA CGTTATCCAT CACACATATT CAGTCGCGTC TGGTCAGATT 180
TATTTGTCAT TACAGCAATA CAAAACACTC AATAACGTAA CGGTAACACT GGAATAAACC 240
TTCAAAACGG CATAAAGAAA AGACAAATAC CACATAAAAC AAATAAATGA GTTAATTAAA 300
TATCTCTCGC ATTTTCATAA GTTTAACTTT AAGTTTCATA GGGATTGTTA GCATAAGCAC 360
ACTTTAGCAT CATGTGTAAA TATGTATCTG CCTCATACAG TGACACGAAT CGTAATCGCA 420
TCGAAATCCT AAATTACCTA CGACACTCAC GGGTCCATTT TGAGCTGAAA CTGCTTTATA 480
ATGTTCTAAA AGCCTCGGCG GGTTAAAACT GCTGCTGCCC CGGCGATCAT GGAGAAAAAA 540
ACGACTGGTC TGGTCATGAG CCGCTCGCTG ACGCCGGACC GAATCACAGC TGATCTCCTC 600
ACCTGCTTCC TGCAGGTGAT CTCATAAAAG TAAATCTTAA AAAAAAAACA CGCATATTTT 660
CGTCACAACA AGCGCCACTA AAGTTCAGCG ATAACTAACG TTACTGTATT TGTAATGCGG 720
ATAAATAGGT TTCGTTTTCT TTTTTAAAAA TGTAGACCTA CAGCTATGTG TTAACTTTAC 780
ATCTATTTGA ACGGATCATT GCGCGCGCTC TTGCTCTCTC AGTGCATCAT TTAAAATGGC 840
GCGGCCCGCT CTTTTAGAGC ATAACGCCCA CTTTACAAAT TACTACTAAC TTTACAAATT 900
ATTAATAGTT ATTAAAAAGG ACTAAGCAGC TAAACATAGC TTATCTAGTG AAGTAGACAG 960
TATTGCAAAT AACAGGCAGT GGTCAAAACG TTTAGTCACA ACATCATGGG CTATTAATTA 1020
GTTCACAAAA CAGCAAACAA TTTCACAAAG TGCAGGAAAT AAACAGATTA 1070