EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28388 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:62571290-62573448 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata4MA0482.1chr4:62572642-62572653TCTTATCTCTC+6.32
HOXA13MA0650.2chr4:62572671-62572682CCCAATAAAAC+6.62
HOXB13MA0901.2chr4:62572671-62572682CCCAATAAAAC+6.62
HOXD13MA0909.2chr4:62572671-62572682CCCAATAAAAC+6.62
IRF1MA0050.2chr4:62571838-62571859CTTTTGTTTCTTTTTCTTTTT+6.81
LMX1BMA0703.2chr4:62571465-62571476TTAATTAAAAC-6.14
NRLMA0842.2chr4:62572980-62572993AAAAGTGCTGACA+6.64
SOX10MA0442.2chr4:62572307-62572318TGCTTTGTTTT-6.02
SPI1MA0080.4chr4:62573198-62573212TCCTTCCTCTTTTT-6.06
SPICMA0687.1chr4:62573198-62573212TCCTTCCTCTTTTT-6.38
TCF7L2MA0523.1chr4:62571667-62571681TTCCTTTCATGTTT-6.07
ZNF263MA0528.1chr4:62571942-62571963TATTCCTCTTTCGCCTCCTCC-6.41
ZNF263MA0528.1chr4:62573199-62573220CCTTCCTCTTTTTTCTCCTTC-7.15
Enhancer Sequence
TACATCCATC ACCATTTTCT CTTTTTTTGC CACAATTCTC CTTTCCCACA TTGCATTTTT 60
CATCAGCATT ATACATAGGT TTACTATTTT CTTATTTTCA TTGTTCTTAT TCCATCCCAA 120
CATCACTACT CTGTTCCATT CTGTTTCATT TTCATCCCAG TCTCCAAGTA GTCCTTTAAT 180
TAAAACTTTA CAATCTTTTA AAAAACCTTC CAATTCTTGA CAATATAAAA ACATGTGTAA 240
AAAACCCTCT TCTTCTTTTT GACATACTTT ACACATTCCA CTTTGTTCCA TCCCTATCTT 300
GTTTAAAATG ACATCAGAAA AGATTGCTTT GTGCCTTATT AAAAATTCTA GACATTCGAC 360
TTTTGTTTCT ACATACCTTC CTTTCATGTT TCCCCATATT TCATTTGCTT TTACATTTTT 420
GTATTTCTCT ATCCAGTATT TGTTTGCTGT TGGTTCTTTA AAAACATTCT CTCTAAAAAA 480
ACAATAAATA TTTTTCACAG TACATTCATT AAAATTGCAT ATTTTTTCAC CTGTTTTCAC 540
ATACACTTCT TTTGTTTCTT TTTCTTTTTC AAAATTTTCT ATGCTTTTTA TCCATTCTTT 600
TGGAATCGCC TGTTTAATTA TGTCAAGATT TTTCTCAATT TCCTTTCTGT TGTATTCCTC 660
TTTCGCCTCC TCCATTGTGT CTATAACATA TTGTTCAGTT AAAAAGCCTT CTTTAAATTC 720
ATATAAAATG TCCCGCACTT TTAAAATCCC AACTTCTATC CATTTCTTAT AGTATAAAAC 780
CTTCCCTTGA CTTAAAATAT TATTGTTCAA GAAAAGAGGT TGGTTTAAAA TGTTTTCCCT 840
TCCATGTGGA CTATATTCCA CTTGTTTTAA AAAATTCCCC CACGCACTTA AAATTTCTCT 900
ATAAAATTCA GGTAAGTTTT CTGTCATCCA AGCTTTTGTT TTCATCCATA AAATCCCATC 960
TCCCATGTTA AAATTACCAC ATTTGTTTAA AAAATATTTC ATTGTTTTTT TCCACTCTGC 1020
TTTGTTTTCT TTTTCTAGAT ACTTCTTTAT TCTTTTCACT CTTAAACTAT TTTTTCTTTG 1080
TTCTACATCT ATTAAACCCA GACCACCCTT GTCTATTTCC CCTACGACTG TATTAAAAGC 1140
AATCCTTGGT GGCTTACCTC CCCATAAAAA ATCAGTAAAA CATTTTTTCA ACCTCTTTTC 1200
TATCCACATT GGCATTTCTA AAACATATAA AACATGCCAC AATTTAGACT CCATTAAAAC 1260
ATTTAAAATC AAAACTTTTC CTTTTAATGT TAGTGTTCTT AGTTTCCAGT AATTTAACCT 1320
CCTTTCTATA TCTGTTAAAA AACCTTCCCA CATCTTATCT CTCGCTTTTC TGGCATCTTT 1380
CCCCAATAAA ACCCCTAAAA TCTTGATTTC TTCTACTTCT TTGAAATTGG TGCATTCTGC 1440
TAAATCTGTT TCCTTTCCAA ACTTCATATA AACCGTTTTG TCTTCATTTA CTTTACTCCC 1500
CGATCCTTTA CAAAATTGTT GTACTATTTT CATGGCTTCT TTCACACTCT CTTTTCCTTT 1560
TACTATTAAT GTAGTGTCAT CTGCATATTG AAACATTTTT TTATTTACTT TATTTTCTTC 1620
AATCTCAATT CCTTTTATTT TTTCTTCTTC GTTGATAGCT AAGCCCAGGG GTTCTGCCAC 1680
AAGTGAATAT AAAAGTGCTG ACAGAGGACA TCCTTGCCTT ATCGATCTTG TTATTTTAAA 1740
ACATTCTGTT AAAAAGCCAT TACATTTAAC TTTTGTTAAA ATACCCTTAT ACAAAATCTT 1800
TATCCATTTT CTAAAAACTT CTCCAAAACC AAACTTTTTG AGTACTTTGA ATAAAAACTG 1860
GTGTTCAACT CTATCAAAAG CTTTTTCAAA ATCCAGACTT ATTATATATC CTTCCTCTTT 1920
TTTCTCCTTC ATATATTCTA TGATGTCTTT TATGCTCATT GTTATGTCTG CTATGTCTCT 1980
TCCTTTTATC GCATAGGCCT GTGTTGTTTT AATTATTTTT GGCATCACTT CTTTTAATCT 2040
ATTTGCTAAA ATTTTTGTTA AAATCTTCAA ATCTGTGTTT AACATTGTGA TTGGTCTGTA 2100
ATTTTTTAAC AATGTCTTTT CTCCTTTTTT GTGTATTAAT TTCATTAATC CCATTCCC 2158