EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28385 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:62304898-62306363 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr4:62305412-62305422GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr4:62305443-62305453GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr4:62305412-62305422GTCACGTGAC-6.02
BHLHE41MA0636.1chr4:62305443-62305453GTCACGTGAC-6.02
CDX1MA0878.2chr4:62306037-62306048GGTCATAAAAC+6.02
CDX4MA1473.1chr4:62306037-62306048GGTCATAAAAC+6.02
Foxq1MA0040.1chr4:62304936-62304947AATAAACAATT-6.02
Gfi1bMA0483.1chr4:62305596-62305607AAATCTCAGCA+6.32
MITFMA0620.2chr4:62305408-62305426TTTAGTCACGTGACTAGG+6.5
MITFMA0620.2chr4:62305408-62305426TTTAGTCACGTGACTAGG-6.5
MITFMA0620.2chr4:62305439-62305457TTTAGTCACGTGACTTGG+6.84
MITFMA0620.2chr4:62305439-62305457TTTAGTCACGTGACTTGG-6.84
USF2MA0526.2chr4:62305441-62305457TAGTCACGTGACTTGG-6.01
USF2MA0526.2chr4:62305410-62305426TAGTCACGTGACTAGG-6
ZNF143MA0088.2chr4:62306144-62306160CAGTGCATGCTGGGAA-6.53
Enhancer Sequence
CTTGTATCGT TTTTGTTTCA ACATTGGTCT GATATCCGAA TAAACAATTT GTGAATAAAT 60
ATGTCTTGTT TTTGTCTTAA AACAGGGTTG TTGCTAGATC AAAAACGGTG GCCTGAAGTT 120
ATCAAGAATT ATTTATATTA TTCATTAAAT TTCCCATTTA TTGTATTTTA TTAATGTCCA 180
CCCAAACCCT AAACCCAACC ATACTGTAAA AATATTTATT ATTGTTTTAC AGTGTTACAA 240
AAATGATGCT AAATTGATGG CGTAACTGCA GCTGTATCCT ATTTAGGCTA CACAAAACAG 300
AAACATGATT AAAATACATA AAACCATGAT TTCAGAGTAT TTGTACAAGT CGGGATTCGA 360
ACCCAAAACA TCATACAAAG TATAGAATCA ATAAGCAAAC ACACAGTGCT CTAAGCCATA 420
TGAGACAGAG ATTATTTAAT GACCTTGGCA GTCAAATGAG CATTCGCCAG GTCTCGAAAC 480
GTTTCTAAGC TGATCGATGC TTTGAATCGC TTTAGTCACG TGACTAGGTG TTTCGAAACA 540
CTTTAGTCAC GTGACTTGGG TGCTTCGGAT CATGCTTCGG TGCAGTGTTT CGAAACACTT 600
GCGCTTCAGG ATCTCGACAC TGTGTCGAAA CATCAGTTTC ACGTCAGCCA TCCCTACCGT 660
ATATAAAATA AACTAAATAA AACACATCAA ATTTTTCAAA ATCTCAGCAG AGCATCATTA 720
AGCAACTCCA CAAACAGCAG CTTTACTTAT TAACAACCTG TTTGGCCTTA TTTCTGCCAC 780
ACTCTACAAA ATTACATATA GATAATATTA ATAGTTAACT AAGTCATTTT TTATAACAGC 840
AATAAAAAAA TAAATAAAAA CACTTTTTGT GTTTAAGCTG TCACCATTGA GGAGAACAGT 900
AGCTGCTTTA CTTGGACTCT GACTCGTTTG TTAATGTTAG CTTCTCTTTG CTTGCCAAAC 960
AGTGTATTAT GGCAAACATT GTATAAAGAG AGCAGTTGTG CTCTGGATAA TTGACTCTAT 1020
GGTGGTTTAG TCACTAGTCA AATCAGTAAA ATTGGTTTTG ACCTAATAAG TTTAAATAAT 1080
GTTGTATCAC AAAATGAGCA CTGTATTAAG AAAACAGAGC TCACCAGTAC TTTTCTTCAG 1140
GTCATAAAAC ACATTGAACA TCTGACACAC TTAAAACACA CAGACATAAA GAATCAGAGT 1200
ATGCTTCTCA ACTATGGTGA ATTTTTTATT TATTTTTTCT CCTCTACAGT GCATGCTGGG 1260
AACTATGGAT GAATGTTGTA TGATTGTCTT ACCATGCACC GCAGCCAAAA ATAAATAAAA 1320
CTCTAACCAC TGTTGAGATA GATACGCTGA TTATTGATGT CTGTGTCTCT GAATTGATTC 1380
AGATGCTCAA TGTGTTTCAA TAAATATAAA ACCACAGCTG AGGTCCATTC TCCTGATAAA 1440
CACTGAATTT AGTTTCTTAT GTATT 1465