EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28254 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:61303691-61304977 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr4:61304644-61304655ATTTTAATTAA+6.62
POU2F1MA0785.1chr4:61303692-61303704CATTTGCATAAT-6.62
POU3F1MA0786.1chr4:61303691-61303703ACATTTGCATAA-6.14
POU3F3MA0788.1chr4:61303691-61303704ACATTTGCATAAT-6.25
POU4F1MA0790.1chr4:61304910-61304924AATTAATTATGCAC-6.93
POU4F2MA0683.1chr4:61304908-61304924CTAATTAATTATGCAC-8.67
POU4F3MA0791.1chr4:61304908-61304924CTAATTAATTATGCAC-7.92
RUNX1MA0002.2chr4:61303845-61303856AAACCACAGAA-6.32
SOX10MA0442.2chr4:61304222-61304233TGCTTTGTTTT-6.02
Enhancer Sequence
ACATTTGCAT AATGATGTGC AATGGAAATT CATATGAATT AATCCTCTGC TTAAAGTTAC 60
TTGTCTTTCC TGCATCTCTG TGATCAGCTC CCTTCAGAAA TTTAGGAATC TTGTGTTATA 120
TTTTCTGTAG CAGGGGGTTA TTCTCTCACT CCTGAAACCA CAGAACACTT TTTTTACTTA 180
ACATTTGTTT AAGATACCAT GAAATATCAA AACACGATTG AACTTTTGAT TCACGGTCCT 240
TTTCAGTACA ATGCGTATTT TACACTACAT ATGGAGTGCA TTCAATAAAA CATTGACAAA 300
ACCTCTCATC TACACATAAA GAATAAATAA AAGCCAAAAC TTTAACAAAC AAGTTTAACA 360
AGAGCTAACA TTAAGTAAGT TAACGTAATA TTACCCCGAC GCTAACGTTA CCAGTGCTAA 420
TATGCTAACG GACTTTTACG AAGACTTACC ACGCTTATAT AACATATTAT TCAACTGAAT 480
ATTCATCAAT TGCCAATAAT AAAAGTGTGA GGAACAGTTT TATGTAGTAT TTGCTTTGTT 540
TTAGGGACTA AACTTACCTG AAAACTGTCA AAACGGCAGC TTGAGAGAAG TCGTGTTGTG 600
TCTTTCAGGT GTGGTGTCGT GTCGTGTTGT AGCTTCGTTT CCCATAGCAA CATCCTCTCC 660
GCTCCAGTGT TGGAAGCAAG ACGCGCGCGC GCACATCAAA GTCATGCAGT ATTACATTTA 720
TAAGCATGAC CACTCCATAG ACAATTTAAA TAATAACCTT GTATTTTATA TCTTGAATTT 780
AAAATGTATT TAGCAGTTTT ATATACGCTA TTATCTTTAA GACGAGCTTT ATTGCCTACT 840
AACTGTTACA AAACAAACAC TTTATTTGTG CAACAGATTC ACTGTCAAAA TAACCAATAA 900
ATATAAATGC AAGTATATAT AAAACAAAGA TGTCACTCTG TAAAAAGGGG TTTATTTTAA 960
TTAAACAGCC GAAATGCAGA ACATACTTGA TTTTTACACT GGGAAAAATT TAATAGAAAA 1020
AGCCACGATG AAAAAAGCAA ACAGCAAAAA CCAGACAAAA ACAACGTTTT CTTTATTAAA 1080
GCATAACAAT AAAGCTTTTA TATTTTAATG AATTGAAATC ATGTATTGTA GGCATTTTGG 1140
TCAGTTTTAC TGCATTAATG TAGGCTATTC AAAGCTGGAC CGACCGACGC AGTAGACATG 1200
ATGCATGGCG CGTTTGTCTA ATTAATTATG CACGCAAAAA CTTACTTGTA AACAAATATG 1260
TTGCCGGATT CTTTCATGGG CATGAG 1286