EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28235 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:60973303-60974480 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:60973355-60973376TCCTTGTTTCATTTTCATTTT+7.38
IRF3MA1418.1chr4:60973358-60973379TTGTTTCATTTTCATTTTTAC-6.02
ONECUT1MA0679.1chr4:60973401-60973415CATATCGATTTTCT-6.1
ONECUT2MA0756.1chr4:60973401-60973415CATATCGATTTTCT-6
Enhancer Sequence
ATTTCCCCTC ATTTATTTAA AAAAATATCT TTATCTTCCT CCCACACTAA ATTCCTTGTT 60
TCATTTTCAT TTTTACCAAC CCTTATACCT AAAATTTTCA TATCGATTTT CTCCTCTTTA 120
AATTAGATTT TTTCTGGTAA AACATTTATT TTTCCCATTC TCATGTATTT AGGATTCGAT 180
ATGAGCAACA GGACCTTTGA TGCCAGCATA CTGTGTAGAT AAGCATTGAT CAAGTCACGC 240
TTCTAAGGCA TGGAAGGAAT CTTTTCAATT GTTAAGTCTC CATTCATTGC CACAACTACA 300
GATAGACCTT CTGCTGTTGT CATCGATCTA TTTAATGTCT CCTACATGAC ATGGAGTCCA 360
AACTATTGTG TTGTACTGAT GTCTACACCT ACAACAACCA TTAACCAAAA CCTCACAGTA 420
AACTGTTGTG TTTTAGCAAC ATCTACACCA ACCATAAACC TAAACCCCAC CTCACGGTAA 480
ACTTTTGTGT GCCGTAAAGG TCTGCGCCGA CCACAACCCT ACACTTTGCC TGCTTGTAAA 540
GCCAAGCCAT GGAGCCTGGA TAGCTCAGTC GGTAGAGCAT CACACTTTTA ATGTGAGGGT 600
CCAGGGTTCA AGTCCCTGTT TGGGCGTGTA AGGCTCTTTT TGTGGAGCCA CAGCTTATGC 660
CGTTGAGCTG TCGCTTGCCG AAAGATTTAT CTACATGCAC AACAAGTGTA CTAGACAAGA 720
GGACATGGCA GGCCAAGCAG TCTTGTAGTC GTGGCCGAGT GGTTAAGGTG ATGGACTCGA 780
AATCCATTGG GGTCTCCCCG CGCAGGTTCG AACCCTGCCG ACTACGTCCA GGCAGTGCGC 840
AGGATTTAGT TTGCGACATT CCATGATTGT TTGTAACTCC ATTCTTTCTT GGGAAAAGGG 900
TTGTGCTGGA AGGGAAAAGC ACCAAAGATA AAATGGCAGC GCATGCTAAC TGACTGCTCT 960
GGGGGCCTTC CATTTTTAAA GACATATGAC AGAGAGTGAA GGGCCAGTGG CTTTCCCGTA 1020
GCTCGTCGTG ATCGTATAGT GGTTAGTACT CTGCGTTGTG GCCGCAGCAA CTCCGGGACA 1080
CGTCAGGTTT TTCAAGGTGA CATTGGCATT GCACTCTGTG TTGCCATCCG TAATCTCCAA 1140
CCTCCTTTTA GTGCAGGCTG TGCTAATGGC ACGTCCT 1177