EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28198 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:59750447-59752797 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BATF3MA0835.1chr4:59750864-59750878TGATGACGTCAGTA-6.11
BATF3MA0835.1chr4:59750864-59750878TGATGACGTCAGTA+6.17
CTCFMA0139.1chr4:59752610-59752629ACGCCAGCAGGTGGCGGTA+7.11
DMRTA2MA1478.1chr4:59751016-59751028AAATGATACATT+6.11
DMRTC2MA1479.1chr4:59751016-59751028AAATGATACATT+6.22
FOXE1MA1487.1chr4:59750837-59750852TGTTAAACAAACAGA+6.03
FOXP2MA0593.1chr4:59751221-59751232AAGTAAACAAA+6.62
Foxj3MA0851.1chr4:59751218-59751235CGCAAGTAAACAAAACC+6.85
POU1F1MA0784.1chr4:59750877-59750891AATATGCAAATTAA+7.47
POU2F1MA0785.1chr4:59750877-59750889AATATGCAAATT+7.22
POU2F2MA0507.1chr4:59750878-59750891ATATGCAAATTAA-7.34
POU3F1MA0786.1chr4:59750878-59750890ATATGCAAATTA+6.74
POU3F2MA0787.1chr4:59750878-59750890ATATGCAAATTA+6.74
POU3F3MA0788.1chr4:59750877-59750890AATATGCAAATTA+6.92
POU5F1MA1115.1chr4:59750878-59750889ATATGCAAATT+6.62
Pou2f3MA0627.1chr4:59750876-59750892TAATATGCAAATTAAC+6.89
Enhancer Sequence
CGCCGGCCCC TCCCCCGCCT CAAGGCACTG ACAGGTGGCC CAGTCCTCGT ACAGCAGTCT 60
TTCCCACCTG CAGCCCAAGA GCAGATCACC CCTCTGCGTA ACGATGGCAA ATGATTTAGC 120
ACCGGCAGCG TGAAGGTATT CCCTTTGTAC ATTGAAACCG ATCTGCTTCT CCTTTATTTT 180
AACAGTTTAA TTTAGCCGTT TATTCTTTTC ATGTTCACAA TTACAAATGT TTTAAGTAAG 240
AGTTTCAGAA CTTGTCTAAG TTTATTACGT CTGAGAGATT ACTGCAAATT CACTACACAT 300
TTATAATGAT ATACTGTATT CAAACAGCAA TACATTTAGT TAAATTGACA TGCTTACACA 360
AAGCGTAGTG CAAATATAAA TACCATAGGC TGTTAAACAA ACAGAAATGG TAGAACGTGA 420
TGACGTCAGT AATATGCAAA TTAACGTATG GTGTAATCTA GCGACTTTTC GGGAAGAGCT 480
TATCGCCTTT TCGTTGAAAT TAGTTGGCAA CAGGGATTTA GGGTGCTTCC ACATCTATAA 540
TTCGGTTCAT TTGGTCCGGA CTAAGGGCAA AATGATACAT TGATGCATTT TCTGCCATCT 600
TTGGGTCGTT TTTACACCAC ACTAGCTTTG GTCTGAGCCA GTTGAAAAGA ACCAAGATGC 660
AGTCACCTGA CAAAATCAAC ATCTCTCATT GGCCATATGT TGTTGAACAT ATTTCCTAAA 720
CTGCTTATTG ATAAGTCAGA ATACACATGC GGGAAAATGC CAATAAACTC CCGCAAGTAA 780
ACAAAACCGA CAGACACAAA ATGTTGCTTT TTTACTATGG AGGGGTGACT GCGCTGACTG 840
AATATATCCC TGCTTTAGAC AAACTATACA TTGATAATGA AGTGTGGCCA CGGCTGGTAA 900
ACAATGTTTT AATTGAAATG TTAATAGAAA TTTTAAAGAG TGTGACATGG CAGGGAAATA 960
AACAGCACCT CAAGTCAGAA ACCATGGTGC TTGACTACAA AACAGTGGCC ATCTCAGGGC 1020
GTACTTACAC TATGTACAGT TGCCTCGAAC CGGGCCAAAG CACGCTTGTC CCCCCTCCCC 1080
TCTCCCCCGA CGGTCCGCAC TCACATTACA ATACGCAATA CACATTACAA GTAATGCAAA 1140
TCTGGAGTCT TGGGATCAAC ACAGTGTATT ACACAGTGTA TTAATATTGT AAAACCCAAT 1200
ACCTGTCGCT CTGCCTAAAT CATACAATAT TCATCAATTT TGTATTCTAC TCAAAAAAAG 1260
TAAATGTAGT AAACTACAAA GAATCTTGAA CCTAAAAGTA AAGAAACTAC TAATAAAAGC 1320
TGCAACATAG GACAATTAAA TGGGGTTTCT AAACTTGAGG CAATACGGCA AACTAACCCT 1380
TCACCTTCTT TGATGTGCAG TGTCTTCTAA GTGATTTGTT TCTTATTCAG GTAGTCAGAC 1440
AGAGAACATG CAAAACACTA GCTACATAAA TACACTGGAG AGTAGAGAAC AGATATATCC 1500
GGACCTGTAC AATCACTTGC AAAGAAACTA AGATGCAGAG ATACTGTTTG CCAGATGTTT 1560
ATGAAACTGT TCTTTTCTCA GCCGCCATTA TTGTGTTTAC GTTAAAACGC GAGAAGCACA 1620
ACACATTTAC AACCCCACCT ACTGCAGTGT AGGAGTGTTG GAAAACAGTA TAGCGTCACT 1680
CAGCCTTTTC AAACATTATT TAGACATGAA ACATCCTGTG CACATGAGAA AATGTTTTGC 1740
TGCATTCATG TCATGTGTGC AACTTTTTGT CTATGTGTTT CTTAATATGT GCTGAATTAA 1800
CGAAACTTTG TAGACACTGA TCAGATCTGC ACGGTTTCTC TCCAGTGTGA ATCCTCTTCA 1860
GTTTTTAAAT GTGTTAACTG ATTAAACCTC TTGTCACAGT GTGAATCGTC TGGTGCAGTT 1920
TCAATTTTGG AAATGTAATA AAAGGTCTTC TCACACTCAA AGCACATATA CTCTCTCACA 1980
GCAGTGTGGA TCTTCATGTG TTCAATAAGG TTTGCTGATC GTTTGAAACT CTTCCCACAC 2040
TGAGTGTGTA ACGCAACGAG TAAATATATT GCATTACAAA GAAAATGTAA ATCAGAAGAA 2100
TTTAGCACCA GATTGCTTCT GACACTGGCT AGATATCGTG ATAAAAGAGT GCAGTTTTAG 2160
ATTACGCCAG CAGGTGGCGG TAGAGTAATG TGGTGAGGTG CAATACGGAA CTCACTAAAT 2220
CTCGAGAGAA TTAGAGAGTG AGAGTCGATG CATGCAAAAC ACAAGTGCCA CTACTAAATC 2280
AAATAATTCA TGTTTTTCAG GTAAGCTGGT GAGAAATATG AGAGAATAAG TGTGTTAATG 2340
TTTTGTATGG 2350