EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28106 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:57970049-57970708 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr4:57970611-57970624AAATTAATTAGCT+6.15
SIX2MA1119.1chr4:57970465-57970481TTATCAAGTTTCAGCA-6.04
ZNF24MA1124.1chr4:57970317-57970330GAATGAATGAATC-6.74
Enhancer Sequence
TTGTGAGATA TTTGTCGTCA GGTAATGTTT TTATTTGTTA GAAAAGCCCC TGTTTTGAAT 60
AGTGATAAAA CTGTAACTTA TATGTGGATA ATATGGCTAA AAACGGCTAA GAATGATGGC 120
CGCCGTCAGT TCAGTAATCT GTTAAGTTGA TTGTGCTCGG GGTTTTAACA AATTCATTTA 180
AGTTACAATT GTCCTTTTAC GCTCGTCATT CCCAATTAAA TGATTAATAA GACGTGTTAT 240
ATGAAGAACA GCGTCGAAAC GGGAGCTTGA ATGAATGAAT CATATGCTGT CCGTTTTATA 300
CAGTTGTAAT AGGTGCCGAG TTCTGCTTTT GTACTGGTTT TAGTTCAAAC ACTGAACGAA 360
CAGTCTCTTT TTGGTAACGT TAATCCTAAT GATCTTGATT TGCTTGTTAA TGTGTTTTAT 420
CAAGTTTCAG CAAAAGTTTG CAGAGTTATG TGGTTCATGC TGGCCACTGT TGAGACTGGT 480
CTGCATTAAA AAAAATTTAA AGCCAAAACG TTTGAAAAAA AATCCACAGT TGAAACATGA 540
TGTGTTAAAT GACTTATGAA GGAAATTAAT TAGCTAAAAA AGAAGGCTAA GTGTGTTATG 600
AAATATTAAA CCTTGTTAAA AAATAAAATC AATTGTGTTA AATAAGCTTA AAATCCATA 659