EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28062 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:57150634-57152234 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr4:57150654-57150671ACAAATTAATTAATTGG-6.07
JUNMA0488.1chr4:57151989-57152002ATTACATCATCCC-6.11
Lhx3MA0135.1chr4:57150656-57150669AAATTAATTAATT+6.92
NR2C2MA0504.1chr4:57151516-57151531TGAACTCTGACCTGT-6.35
POU6F1MA0628.1chr4:57150658-57150668ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:57150658-57150668ATTAATTAAT-6.02
SCRT1MA0743.1chr4:57151276-57151291GAGCAACAGGTGTAA+6.61
SCRT2MA0744.1chr4:57151276-57151289GAGCAACAGGTGT+6.67
TFECMA0871.2chr4:57150697-57150708GGTCACGTGGT-6.14
USF1MA0093.2chr4:57150697-57150708GGTCACGTGGT-6.32
Enhancer Sequence
TACTCTGTAT CGGCAAGGAC ACAAATTAAT TAATTGGTGC ATCCCTACCT TCAGCATCAG 60
TGTGGTCACG TGGTATTGTT GTCACTGATT CCTTGTTGTT TAGCACCACT CAGCTGACTC 120
ATCAGCACGC TACAGCTGCT GACAATCATT ACTATACTTA TATCTAGTCA GCGTTTCACA 180
TTGTCAGTTT GCTGTTGTTC AAATTTGTGT CTCATCAGGC TGTCCTTGCT GAGTTCCGTT 240
AGTAGCAAGC TCGCTTTCTG AAGCTGATTT TCTTCTCTGT ATTGGACTTT CCTTGCATCC 300
ACCTGTTGAC AGCTATTTCA GTTTCACAAA CTATTTGTGA CTGCTAATGT TTCAGGCTCT 360
TGAGAATGAA TAAACTCCCT GTTCACTTGC TATTGAGTTC AGTCCAGTCC AGTTCAGATT 420
TGTGACACAT CCCTACAGCT TCCCACACAG AGAGAAGGAT CACAATAACA ATTATAAAGC 480
TTTTCTGAAA CATTACAATA AGCTGTAAGC TCTAAGTTTC ACACAGAGGC GATCTCTGGT 540
ACTTTCAGCA ACACTGCAGA GAGGCAGGAC AGAGCTTCAT CTCTCTGACA TCAGGCTCAG 600
GATGGCAGAC ATGCTGCTCG GCTTTTGAGC TGGTAGAGTA ACGAGCAACA GGTGTAAATG 660
ATCATCTGAC TCTCAGAAAC AGCAAAATCC TCTGAGTAAC ATTTCCTCAG CTCAGAGTCT 720
GTTTGGTTTT ACTCTAAATT GAGTTAAAGT AACTCAGCAG CAGAGTTAAG CCGCGGTCAT 780
ACTGCACTGT TCTCCATTTA TATGCACTCG AATGGACAGG CTGGAAACAC AAGCTCATGC 840
GACAAGTTTT GCAGTTTGCT GCATTGCAAA GTTTAAGCTT GGTGAACTCT GACCTGTAAA 900
ATCGCATGAT GTGACTGTAA GAGACCAATC AAAGATCAAA ACATGGGCTG TTTCTCGATT 960
CCAACAACAC AGAGAACAGA CTTGGAGTCT TGTGAAGACC GGTCTTGCCT GGTCACTTCG 1020
GAAGAACAAA CTCGGGAGAC CGGGAGCATT GTGAACGCAT TGGACCAAGT CTAGCTTCCA 1080
TATAACAGCC AAACATGGAC CATATCTGGG CCTAGTCTCA GTCAAGTTAT TTACCTATAA 1140
CTTGTCCTGA ACTGGGCAAG CTATGGCACA ATGTTTGGCC ATCGTCTAAA AGCCAGATTT 1200
GGTGTGTCAT GACTGAAATT TAGAAACCCA TGAGGCATTG CACTTTAGGC ACATTAATAA 1260
TGGTAATGCT TAGAAATGGT TAATAATTGT CACCAACTCG GTCCCAGTCA TTCCCCTCGC 1320
TGGCCAGCAG AGGTCATCAT CACTGGACTA TTGACATTAC ATCATCCCCA CTCACTCAGA 1380
CACTAATTGC TACACACTTG TTACACATTA CCTGATCACA CTCACACACA TATAAGCAGC 1440
TCACACACAC ACTCCAGAGC GATGTCTTGT TCTGCCATTG CTGACATTTC TGAGCATTAC 1500
TTATCCTTGT CTGATCTCCC GTTGCTAACC CGGACTGTTC CTCGTCCTTG CTTTGCCTGC 1560
CACCAGTCTA GAACCTTGCT TTGTATTACC GACATTGATC 1600