EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28009 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:56188275-56189542 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr4:56189229-56189239GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr4:56189229-56189239GTCACGTGAC-6.02
LMX1BMA0703.2chr4:56188792-56188803AATTTAATTAA+6.32
Lhx3MA0135.1chr4:56188793-56188806ATTTAATTAATTT-6.07
MITFMA0620.2chr4:56189225-56189243GTATGTCACGTGACCTTC+7.31
MITFMA0620.2chr4:56189225-56189243GTATGTCACGTGACCTTC-7.31
PHOX2AMA0713.1chr4:56188791-56188802TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr4:56188791-56188802TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr4:56188791-56188802TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr4:56188791-56188802TAATTTAATTA+6.62
USF1MA0093.2chr4:56189229-56189240GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr4:56189227-56189243ATGTCACGTGACCTTC-6.02
Enhancer Sequence
TGTTAAAGCA TTTGTAAATT TGACTGTAAA ATTACATTGT TTTGGTTTTG GTTGAATTTG 60
TGTTTAAAAG AATTTCAAGC ATTTTAAATT GGTGTTAACT GGATGCATTT TGTGTCAAAG 120
CTACAAGAAA TGTGTTAATT GTATAGCCCA CGAAGACAGA TGTTGTGCTA ACCGTGTTAA 180
GAGTTTAGGA AACTTGTTAA ATGTATTGAA AAAAGTGTCA TAGCCATTGC AAAAAACTGT 240
AATAAATGCG TCTTGATGAT GCTTTGATGT AGGCCTGGAC GAGAGTGTGA AGCTGCATTG 300
AGTTTGTGCT GGGCATCCTC CAAGATAAGC TGCTCAGCAT CTGTCTGTTG CTCTGTCCTG 360
CCTTGGTGTT TTGGTCATTC AGAGGAGTTC ACCAGTGTTT CTTTCTTCTC CAGTTATTCC 420
TCTTCAGAGA TCGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTTACAAACC 480
CCTGATGTTA ATCTAGGGGA TGGTGGGGTT TGACATTAAT TTAATTAATT TATATTTATA 540
CAAACAGTGA ATGAGTGCAA AGGACAACCA AAGCAATGCC AAAAATATGT GCTTTTATTT 600
ACAATTCCCA AAAGTGAACA ACACATTGAA TTAATCAAAA TAAAGAAAAA GTAAGTAAGG 660
CAAAAATATA CTATTTACAA TATGAGACAA ATAAAGACGG GAAAAAACAA GAGAGCTGGC 720
AGAAGGGACG CGGGCGATGC TAAAGAAATG AAAAGAACAG AACCCGAACT AAATCTAACT 780
CCCAAGAAGC ATCTAGTTAA CTAGCTATGT GAAAACAATA TAATTAGCAC GCAAAGATAC 840
TTCCGAGTCC CAACTATCTA CTCTATCTAT CTATCCAAAA AGTACAAGGA GTGGCGCTCG 900
CCCCTAACCT AATGCACTAA ACAGCAGAGT AGTCCTATGT GTTGCAAAAT GTATGTCACG 960
TGACCTTCTT ACCTGTCCGC TTCGTCCAAG CCTCGTAAAC AACGTAAACT GAGAATGATA 1020
TATGAATAAC AGACGGATAA CGTGCACACA GAAACGAGCA ACAACAAAAT ACACAGTTAG 1080
ACAGGGTTTT AAATACGGAA CGCAATAAAT ACGGAAACAA GCGACAAAAG CAGAGAAAGA 1140
GAAAAAGGCA AGGGAGAGAA ATCAAGGCAC TACTAGCGAG TGGTCTGGCC CGCACTTTTA 1200
TGACGGGTGG TCTTGACGTA ACCAGGGAGG AATGACTGAC AGCTGAATGG ACCAATGAAA 1260
GGAACCT 1267