EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-28008 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:56186283-56186902 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUXAMA0884.1chr4:56186456-56186469TTGATTAGATCAG-6.5
IRF1MA0050.2chr4:56186681-56186702TGAGTGAAAGAGAAAGCGGAT-6.34
PBX3MA1114.1chr4:56186338-56186355GTCACTGTCACTCACTC-6.08
Enhancer Sequence
CAGCTGCGTC TTATTGCTCC TCCTCCATAT GAGTGCCCTG TTCAAGTGCG CATCAGTCAC 60
TGTCACTCAC TCAGACACAT GTGGGACACC GCTCTGTTTC TTAAGACTCC TGGATGACAG 120
ACATCTAGAA AAAAAAATGT CTGGACACCT GATTAGGGCT GGGCGATGTG GATTTGATTA 180
GATCAGGTTA GGTTAGATTA GATAAGCTAC ATTATTGGGG AAAGATAATC TAGTGAAGTG 240
ATCAAGTAAA TGTAGGCCCA GTCACGACCA TTCCCTTTAG ATTGTAGATG AATTCATAAG 300
CAAACAAACC TGCAGACATG TGAAGGAGAG ATCGGGCCTT TTGCTCATGA GTATAATCTG 360
AGGTTTAGAC CCGCTCACAC GCTTTGGAGA GGAATGTATG AGTGAAAGAG AAAGCGGATG 420
GCCAATCATG AGCTGCGGCC TCAACACATT ACACACATAT TAGTTTGAGC ACTGGCTAGA 480
AAGTATCTAT AGGCTGTATC ATATTTGCTT GTCCACAGTT TTAGTAGTTA CAGTTTATTA 540
CAATGGCTAT GACAGTTTTT TCAATACATT TAACAAGTTT GCTAAAAGTT TTGCTAAACG 600
CAGCAACACA CCTAAAACA 619