EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-27969 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:55641562-55642574 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr4:55641943-55641960TGAACTAATTAATTAGG+6.16
FOXP1MA0481.2chr4:55642335-55642347TACTGTTTACAT-6.11
Lhx3MA0135.1chr4:55641945-55641958AACTAATTAATTA-6.22
mix-aMA0621.1chr4:55641949-55641960AATTAATTAGG+6.32
mix-aMA0621.1chr4:55641946-55641957ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
TACACAGGGA TGGATGAATA TGTGTCTATT AAGATAAATA TGTAAAGTTC CATTATTTGT 60
CTGTCTGTTA AGCAGCACTT TAACTACTTT TGTGGTTTAT GTGCTGCTTT CCTAAGGTTA 120
CATTAGGCTA AATTCTTATC ACAGAATGAG AAATAAAATG TACAAAATGA GAATACTATG 180
AAAATGCTTT TACTACATCT TATATAACGG GTTAAGTTTT TACTGTCATC TGTTTGCGTT 240
GCTTAGCAAC GCTAGTAAAC AAAGGAAAGA CGGCGTGCAT GTAAATATCT ACGTGCGATC 300
CGCTAGGCCA CGGATTCTCA ATCCTGTTCT TGGAGATCCA CCTTCCTGCA GATTTCAGTT 360
GGTACCCATA TCAAACACAC CTGAACTAAT TAATTAGGAC CTGCACACCA CTTGATAATT 420
ACAGGCAGAT GTGTTTGATA TGGGTACCAA CTGAAATCTG CAGGAAGGTA GATCTCCAGG 480
AACAGGATTG AGCACCCCTG CGCTAGGCCA AAGGCCTTTA TGTATGGCGC CCTCTGGTTT 540
CCCGTATGAA TGAAATGGGC ATGAAGCTCT AAGTTCATCG CCTCAGTATG GGTAAAAATG 600
GTAAAATATC AAGTAAAGAC ATGAGAATCC ATCAATATTT CATCAAATCT GGAGACTAAC 660
AGAAAAAATG CATACTTTTG GGATAAAAGT CAAGAGTTTA TTTAGTGACA AACGACTGCA 720
TTTCTTTATA AAGCATATAA CGTTAAGGGG TCAAACGTTA CAAACTGAAT TAATACTGTT 780
TACATGGCAA AATAACGAAC AGGAGGTATA AAATGCGAGT AAATTAGACT GAGGACAAAA 840
TTCGTCACAC ACCATCCGGT ATAGTTCCCT CACAAGACTA ATTTAATAGT AATGCTTAAT 900
AACGATTTAT TCGTTTCTCA AAAACAATTA GTTCATAATA TATCTGTCTG AATATAGCCA 960
ATTTAAGCAC TCGTACGCAT TTTTTTTAAC ATTTAATTGA AAATTTACCT CA 1012