EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-27942 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:55265225-55266882 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:55265291-55265312CTCTGCTTTCACTTTCGATTT+8.54
IRF2MA0051.1chr4:55265290-55265308GCTCTGCTTTCACTTTCG-7.26
IRF3MA1418.1chr4:55265294-55265315TGCTTTCACTTTCGATTTCCT-6.51
IRF7MA0772.1chr4:55265295-55265309GCTTTCACTTTCGA-6.27
IRF9MA0653.1chr4:55265295-55265310GCTTTCACTTTCGAT-6.15
LMX1BMA0703.2chr4:55265966-55265977TTAATTAAAAT-6.62
POU4F2MA0683.1chr4:55265692-55265708GTGCATAATAAATTAG+7.57
POU4F3MA0791.1chr4:55265692-55265708GTGCATAATAAATTAG+6.41
RUNX1MA0002.2chr4:55266770-55266781TTCTGTGGTTT+6.32
SOX10MA0442.2chr4:55266387-55266398AAAACAAAGCA+6.02
Enhancer Sequence
AGGAAGAAAT GATGGGGACA GTTAATGCAG TTTAAGAATT ATCCGCACTC TTCCGGTTAA 60
CGGAAGCTCT GCTTTCACTT TCGATTTCCT GACTCTGTTT AAAGTTTATT TTGTGCTGAA 120
TGGTGTGATA TTATCGAGTC AACCTGATAC AGAATTGCAC AAACACTTTC AAGAGATAAA 180
AATAACCCAT TATATTGTTG AAATGACCGT GTTCCCAGAC AGCACACATA CGTTGGGCCG 240
ACGTCGGCCG AAGGTCAACA CGTCGGCCCC TTTAATTCTA ACATCGGTAT ATGGTCGGCC 300
AAACATACGC ATGATCGTTC GGTCGTGTGT TCTATTGTTC CAGCTCAACA AACGTCGGCT 360
CTGCGTCGGT TAACGACCAG AGGCCGACGA AGCACTTCAT AAGCACTTGA TCTCTCATGC 420
CCATGAAAGA ATCCGGCAAC ATATTTGGTT TACAAGTAAG TTTTTGCGTG CATAATAAAT 480
TAGACAAACG CGACATGCAT CATGTGAACT GCGTCGGTCG GTCCAGCTTT AAATAGCCTA 540
CATTAATGCA GTAAAACTGA CCAAAATGCC TACAATACAT GATTTCAATT CATTAAAATA 600
TAAAAAGTTT TATTGTTATG CTTTAATAAT GAAAAAGTTG TTTTTTTCTG GTGTTAACTG 660
CTGTTTGCTT TTTTTTATTG TGGCTTTTTC TAATACATTT TTCCCAGTGT AAAAATCAAG 720
TATGTTCTGC ATTTCGGCTG TTTAATTAAA ATAAACACCT TTTTACAGAG TGACATCTTT 780
GTTTTATATA TACTTGCATT TATATTTATT GGTTATTTAT TTTTGACAGT GAATGCACAA 840
ATAAAGTGTT TGTTTTGTAA CAGTTTAGTA GGCTATAAAG CTCGTCTTAA AGATAATAGC 900
GTATATAAAA CTGCTAAATA CATTTTAAAT TCAAGATATA AAATACAAGG TTATTATTTA 960
AATTGTCTAT GGAGTGATCA TGTTTATAAA TGTAATACTG CAAGACTTTA ATGTGCGCGC 1020
GCGCGTCTTG CTTCCAACAC TGGAGCGGAG AGGATGTTGC TATGGGAAAC GAAGCTACAA 1080
CACGACACGA CACCACCTAA AAGACACAAC ACGACTTCTC TCAGGCTGCC GTTTTGACTG 1140
TTTTCAGGTA AGTTTAGTCC CTAAAACAAA GCAAATACTA CATAAAACTG TTCCTCACAC 1200
ATTTATTATT GGCAATTGAT GAATATTCTG TTGAATATTA TGTTATATAA GAGTGGTAAG 1260
TCTTCGTAAA AGTCCGTTAG CATATTAGCA CTGGTAACGT TAGCGTCGGG GTAATATTAC 1320
GTTAACTTAC TTAATGTTAG CTCTTGTTAA ACTTGTTTGT TAAAGTTTTG GCTTTTATTT 1380
ATTCTTTATG TGTAGATGAG AGGTTTTGTC AATGTTTTAT TGAATGCACT CGATATGTAG 1440
TCTAAAATAC GCATTGTAAC GTTACTGTAA AGGACCGTGA ATCAAAAGTT CAATCGTGTT 1500
TTGATATTTC ATGGTATCTT AAACTAAATG TTAAGTAAAA AAGTGTTCTG TGGTTTCAGG 1560
AGTGAGAGAA TAACCCCCTG CTACAGAAAA TATAACTCAA GATTCCTAAA TTTCTGAAGG 1620
GAGCTGATCA CAGAGATACA GGAAAGACAG GTAACTT 1657