EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-27857 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:53654287-53655331 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr4:53655133-53655149GATTGTTTACATAAAA-6.13
FOXC2MA0846.1chr4:53655134-53655146ATTGTTTACATA-6.52
Nkx3-2MA0122.3chr4:53654652-53654665TTTAAGTGTTTTA-6.33
PBX1MA0070.1chr4:53654507-53654519CAATCAATCAAA+6.18
Enhancer Sequence
GTGAAGGAGC TGAGATGAAA GGCAGTGTTC TCAATTTACT GCTCAATCTA GGTTCCTACT 60
CTCACGTATG GTCAAGACTG AAAGGACAAG ATTTCGGATA CAACCGGACA CATTTTACAA 120
AGCGTTATGA CCCGCTTGTT TGAGTTGCAA CATAAAAGAG AGATGAACCT ACAAAATGGC 180
CTGAATGCTG ATTATTTACT ATAAAATGTA CTTCATAGAA CAATCAATCA AAGCAACCAA 240
CAAATGTCTA TGTATAATAA TGAAGATAAA AACTTAGAAT ATAAATCACA ACAACTCTTT 300
AACTACATGA TATTTTATTT ATTGACATGG ACATCACAAT TACACTAGAC AACCAAATGC 360
ATTTGTTTAA GTGTTTTAGC AAACTTGCTT ATTCTAAACA CCTGTCCAAA GGAGGCTTAA 420
AAATTGACAA AATAAAAATA TAATAAAAAC ATACACAACA TTACAATCAT TTACATAAAA 480
TTACTGCAGG CAAAAGCAAA GGCAACATGA TCCAACCAAC TAACAGTAGA CTATTTGTGC 540
AAACATTGCT GTTTTATTTT TAACCACTTT TTAAAAGCAC TACTAAAAAT ATTAATATTG 600
CTTTCTGATT TTAATCTAAC CAGTAAATCA ATCGACAGTT TAGCTCCCTT TACAGAGAAG 660
ACAGATTGAC CAAACGAGGT CTTACACTTT GGCACTAGAC AGTCACCATT AGCAGTTGCC 720
CGTGTAACTC TTTGGGAGGT TTGATGCCGA TTGATTAGCT CAAAAAACAG GATTGGAACA 780
TGATTATTTA AACATTTAAA ACCAATTTAA GATAACTAAA TTGAATAAAA CTATTAAAAC 840
TAAAAAGATT GTTTACATAA AACTTGACAG TGATGCCATC GCATAGGCTT TAAGTCCATA 900
ATTTTAACTG CTTGTTTATA AATTGAGTCA ATAGGCTTCA ATGTAGTTAA AGAGGCTTGT 960
GACCAAGATG TAATGCTATA CGTCAAGTAG AGAATATCAT TGTGTGCATG TATAAATTTG 1020
CAGTGTGATA TGTTAAAACC TTCT 1044