EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-27810 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:53152072-53153229 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MEF2CMA0497.1chr4:53153039-53153054TGCTATTTTTGGCAA-7.13
NR2C2MA0504.1chr4:53152864-53152879CAAGTTCAGAGGTCA+6.1
RXRGMA0856.1chr4:53152865-53152879AAGTTCAGAGGTCA+6.07
Enhancer Sequence
TAGAGGTCAA TAACCTAAAA TTGGTACAGT AATGTGATAT GAATCTGGGT TTGCTGATAG 60
ATTGGAACAT TGTCTACAAG ATTCCAGTGA GATATTCAAC GCACCCTCAA AGACTGCTAT 120
GATATAGCGC CACCAATTGT GCCAAGAGTG CAATAGGACA ACTGTTTTTG TCGTGTTGTA 180
TTGCGATTTA TGGCAAGTTT AGAGATCAAT AACCAGAAAA TTTTACAGTA ATGTGGTATG 240
AATCTAGGTT TGCTGATAGA TTGGAACATT GTCTACAAGA CCTCAGTGAG ACATTCAACG 300
CACCCTTAAA GACTGCTGAG ATATAGCGCC ACCAATTGTG CAAAGAGTGA AATGGTACAT 360
CGCTGTTTTT GCCTTGCTGT ATTGCGATTT TTGGCAAGTT TAGAGGTCAA GAACCTAAAA 420
TTGGTACAGT AATGTGGTAT GAATCTGGGT TTGCTGATAG ATTGGAACAT TGTCTACAAG 480
ACCTCAGTGA GATATTCAAC GCACCCTCAA AGACTGCTGA GGTATAGCGC CACCAATTGT 540
GCAAAGAGTG CAATGGTACA GCTGTTTTTG CCTTGCTGTA TTGCGATTTT TGGCAAGTTT 600
AGAGGTCAAG AACCTAAAAT TGGTACAGTA ATGTGGTATG AATCTGGGTT TGCTGATAGA 660
TTGGAACATT GTCTACAAGA CCTCAGTGAG ATATTCAACG CACCCTCAAA GACTGCTGAG 720
GTATAGCGCC ACCAGTTGTG CAAAGAGTGC AATGGTACAG CTGTTTTTGC CTTGCTGTAT 780
TGCGATTTTT TGCAAGTTCA GAGGTCAATA ACCTAAAATT GGTACAGTAA TGTGGTATGA 840
ATCTGGGTTT GCTGATAGAT TGGAACATTG TCTACAAGAC CTCAGTGAGA TATTCAACGC 900
ACCCTCAAAG ACTGCTGAGG TATAGCGCCA CTAATTGTGT CAAGAGTGCA ATGGTACTTA 960
GCTGTATTGC TATTTTTGGC AAGTTCAGAG GTCCATAACC TAAAATTGGT AGAGTAAATT 1020
GGTATGAATC TGGGTTTGCT GAAGGATTGG AACATTGTCT ACAAGACCCC AGTGAGATAT 1080
TCAACGCACC CTCTAAGACT GCTGAGATAT AGCGCCACCA ATTGTGCCAA GAGTGCATTG 1140
GAACAAAACT GTTCTGC 1157