EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-27644 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:50605749-50607719 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr4:50607149-50607161AAACAAACATTT-6.27
IRF1MA0050.2chr4:50605936-50605957AAACAAAAAGCGAAAGTACGT-6.91
SPI1MA0080.4chr4:50605940-50605954AAAAAGCGAAAGTA+6.13
Enhancer Sequence
TTTCTGTAAA GACAGTCAAC ATTGTTTAGT TGGTCTCCAC CCATAGGACG GCAAAAAGGA 60
AATGGGTGAG AGAATAAAGG AAGAGATGGA GAGTCGAAGA GAAATTGACT GAACTGTTCC 120
AGCGCGGGGA AATGAGTAGA GAAACTGGGT CGAGACGAGC AGTGTAAACC TAACGATTGG 180
CTGTAAGAAA CAAAAAGCGA AAGTACGTAT TGAAGTAACA GAGCTAAGAC CGCTGTCTTG 240
TTACTGAAGT GCTCATGATG TCTGTGATCG AGTGCATCAC TAAAGACTTC AGTGCAGTGT 300
ACTTAAGGTC AACTTACCGA TTTATCTCGC TGCCATGGAA TCTCACCTTC ATCCCGCAGT 360
CGACAGTGTC AAAGATGCAA ACTGGTAAGG TCCTCACGTG AAACTTAAAA TTTTGTTTAA 420
TATTGCTCTT ATCCTAAATA CTATTACCTA AAACCTACCT ATACTGGTAA ATAAGCATTT 480
AAGTGTCGGA GTCTAGCTGT TCTGAGCGTA ATTCAACTTG AATCAGGATG AATTTAGGAA 540
GCAACCGTAG GGAAGCAAAA TCCGCTACTA GCCTCCATGC TAATGCTAAC CCTGAAGTGC 600
AAGCTGCATC TAAAAGAAAC GGCTCTGGCG AATGATCACA GTGCAGTCCT TAAAGCTATT 660
GATGCACTAA AAGGTCTGGA GTCTGTGTTG GGTGGATACT CCGACTCTCT GCCTAGTCTC 720
GACACACACA ATTTAGTTTT AGGAGGCAAT TTGATTATTT TTTGACATTG CCATCAACTG 780
CATTAAGGAA CTCAGATGGT TTGCAAGGAA TTTTTAGAGA GGGACACGAA CATAAGCTCC 840
TGCTATATGT GGATGATCTT CTTTTTCTGT TAAATACAGG TACATGTATT CCAAAAGCTC 900
TTACAATAAT TTCAGAATTT GGAAATGTTT CTGGATAAAA GTAAATCTTG CAAAGAGTCT 960
CCTTTTCCCT ATCAATGATA GAGCACAGCA AATGCCCTTC CAATCCTTTC CATTTTCAGT 1020
AAGTGCTGAT AAACTTGTAT ATCTGGGTGC GAGTATGACA CACAGGACAA AGGATTTGTT 1080
CAATAATTAT GTTAAAACAA CATTAGACAA AGTCAAACGA GACATGACGT GGTGGTCAAT 1140
CCTTCCTTTA CCTTTGGCTG GGAAGATCAA TTCTATCAAA CTTATAATAC TACCAAGATT 1200
TCTGTTTCTA TTTCAGACTA AGCCTGTTTG TATTGCCAAG ATTATAGATT TAGCAGTCCA 1260
ATTCTGGTCT AGGAAGAGAG TCAACTGTGT TAAAGACCTG TTTAAAGATG GCATATTTAT 1320
CTCATTCAAC AGTTAAGAAC AGACATTGAG ATTCACCAGT CTAATTCTTT TAGGTACTTT 1380
CAGATCCGTA GTTTCGTTAA AAACAAACAT TTCTCTCCTT CACTGAACCA ACCAGAAGAA 1440
TGCTGGATAG ATGAATTGGT AAATATGGAC CCATATAAAA GAGGTATGAT GCCCATGTTA 1500
TATGAAGTGA TCCTAAGAAC TGCCTCCACT TCCCCAAATC GTATAAATAA AAAATGGGAG 1560
GACGAACTGG GACTAGAAAT ATCAGATACA GCCTGGCAAT ATGCCATAGA ACTGGTACAC 1620
TCAACTTCTG TATGTGATTC AGATTCATCT TGCCCCAGAT GTGGTTTGGA ACCAGCAGAT 1680
CAGAGTCATC TGTTCTGGGG ATGCCCTAGA TTACATAGAT TTTGGACCTA TATTTTTAGA 1740
TAATTTTCAT CTATATGTAA TAAAGATATG GATCCTAATC CTTTGACCTC AATTGTTAGT 1800
ACAGTGCCAG AAGAAATGTA CCTGTCAGCA AATCACATAA AAAACATTGC CTTTTCTTCT 1860
TTATTGGCCA GACGCCTGAT TCTTCTCAGT TGGAAAAAAC CCCCCCCGCC ATTCCACAAA 1920
CATTGGATAT TACAAGTGTT ATCACATCTT AAACTCGAGC ACCTGAAGTA 1970