EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-27579 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:49408021-49410958 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATOH1(var.2)MA1467.1chr4:49410621-49410631GACAGCTGTT+6.02
Dmbx1MA0883.1chr4:49409769-49409786TGGATCGGATTAATTCA-6.44
FOXK2MA1103.1chr4:49410324-49410335ATGTAAACAAA-6.32
FOXP2MA0593.1chr4:49410324-49410335ATGTAAACAAA-6.14
NFYBMA0502.1chr4:49408503-49408518CAAGCAACCAATCAG-6.14
PBX1MA0070.1chr4:49408276-49408288CAATCAATCAAA-6.18
RUNX1MA0002.2chr4:49408937-49408948AAACCACAGAG+6.14
Enhancer Sequence
CAGCAGTTAT GCAGTTCATG TGATTGTCTG TTGTGGTGAA GGAGCTAAGA CTAAAGGCAA 60
TGTTCTCAAT TTACCGCTCA ATCTAGGTTC CTACTCACAC CTATGGTCAT GACTGAAAAG 120
ACAAGATCTC GGACACAACC AGACACATTT TACAAAGTGT TGTGACCCGA TTGTTTGAGT 180
TGCAACATAA AAGAGAGATG AGTCAACAAA ATAGCCTGAA TGCTAACTAT TTATTATAAA 240
ATGCAACTCA TAGAACAATC AATCAAAGCA ACCAACAAAT GTCTAGGGAT AATAATGAAG 300
ATAAAGAACT TAGGATATAA ATCACAACAA CACTTTAGCT ACATGATATA AGCAATGCAA 360
AACAAAACCA TAAGGTTAAA GAATCAATGA GAGGGCAGGT CTTGACATGA GGACTCCTGA 420
GTAGCCACAG CATCTTGGGG TAGCTAGCAC AACAGCTTTT AGTTACCCAT TGATAAGTAA 480
TTCAAGCAAC CAATCAGTAT TTACCACATA CTCCAATCTG GAGTCTTGGG ATCATCACAG 540
TGTATTAATA TTGTAAAACT TAATACATGT CGCTCTGCCT AAAACATACA ATATTCATCA 600
CGATTGTATT CTACTCAAAA AAGTAAATAT AGTAAACTAT GAAGAATTTT GAACCTAAAA 660
GTAAAGAAAC TTTACTAAAA AAAGCTGCTA CACAGGACAA TTGAATGGGC TTTCTAAACT 720
TGAGGCCCTG GTATACTGGA AACTAACCGT CCTGGAGCTC CACCTTCTTT GGTGTGCGGT 780
GTCTTCCCAG TGATTTGCTT CTCATTTAGG GAGTCAGACA GAGAACACCA TCCAAAACAA 840
CACAAGCAAC ATGAATACAA TTGAGAGTGG CGTACAGATG TATCCGCACC TGTACAATCA 900
CATGCAAAGA GATTTTAAAC CACAGAGGTG CTGTTTGCCA GATGTTTACA AAACTTTTCT 960
TTTCCCAGAT GCCATGATTG CGTTTACTGT CACTCAGCCT CATCAAACAT TATTCAGACA 1020
TGAAACATCC TGTGCACATG AGAAAATGTT TAGGTGCATT CATGTCATGT GTGCAACTTT 1080
TTGTCCATGT GTTTCTTAAG CTGTGTCGAA TGAGCGAAAT TCTGTAGACA CTGATCAGAT 1140
CTGTACGGTT TCTCTCCAGT GTAAATAATC TTGTGTTTTC AGATGTGTTA AAGGATTAAA 1200
CCTCGTCACA GTGTGAATCA TCAGGTGCAG TTTCAATTTT GGAGCTGTAA TAAAAGTCTT 1260
TTCAAACTCA AAGCACATAT ACTCTTCCAC ACCAGTGTGG ATCTTAATGT GTTCATTAAG 1320
GTTTGCTGAT CGGTTGAAAC TCTTCCCATA CTGAGTGCAT GTGAATGGTT TCTCTCCAGT 1380
GTGGGTCTTC ATGTGTTTTT TAAGGTCTGA GGAGTTGCTG AAACTCATCC CACACCAAAG 1440
CTGCTGTCAC ACTTGAGTTT TAGCATGCGG AATTCTTTTG CACTTCCTGC TTTGCTACTG 1500
TTCGGACGTC TTTGCCCACT GCTCCGCTCT TCGCACTCTT GCTTTTGTAT CTTATACCCT 1560
AATTTTAACT TGAGCCTATC AGCACAGTGC TCAAACAACA CGGCTTGAAG ATCAGCATCG 1620
ATTCTACAAA CTTTCTGGAA TATAGCTTTA CTAACAAGAA AGGAATTACC GTCTAAACAA 1680
TCCTCCCGCT ACCAGCTATC AGCTGCTTAC ATTCCGGAGA CGGGAAGACA CGGCTGTGAA 1740
AATGCCTCTG GATCGGATTA ATTCAGATTC TCACTGCTGT ACAAACTGCC ACAAACTTCT 1800
ACAAAAGATT GCAGTTCTTG AAACGAAGTT GCTTGCGATC CGACCAGAAC TTCAGCTTCA 1860
TTGTGGATCC TCTCAGCACA CAGCCGGTGA GTCCCATAAA TCTGTTCCTG CTACTGTTTT 1920
GAGCACAGAA AAACAGAAAA GAACTGTTGA AAATGAGCAT TGGCATAAAC AAGGTGCGAG 1980
ACCAAAGGGT ACTCGAGGGG TCAGATCATA CGCTGCCGCA TTAGCGTCTT CTACCCCAAA 2040
TACAGCTCGG ACTCAAATAC AGCTTCAGAA CAGATATGAA GTTTTGAGTA ATATGGGTGA 2100
AGAATCCCCA AATGTAGTCA GACAGAGATC GCATGATTCA GCAACTAATT CTGCATGGAA 2160
CAGAGGCTCA AGGCCGACTA GACAGCGGCA TTCTGCTCCG ATCACACCTG AGATAAGAAC 2220
ACTAGTCGTA GGAGATTCAA TAATCAAGAA TTTCAGGAGC AGATCTACAA TGACATACTG 2280
CTTTCCTCAT GCAACAGTTT CTGATGTAAA CAAAGAGCTT GAGGAAATTC TGAAAAAGCA 2340
CAGTACTGCA AAACGGATTA TCATCCATGT GGGGAAGAAT GATATTCGGA AAGAACAGTC 2400
AGAACTACTC AAGAAAGATT TCTGTGAGCT CTTGGAAACA GCTGAAAGAT TGAAGGTTCA 2460
GCCGTTCATA AGTGGACCAC TCCCTGCAAG AGGGACAAAT ATGTTTTCAC GGCTTCTTGG 2520
TCTAAATGTA TGGCTACAGA AAACATGTAA CAAGAAAGGA CTGAATTTCA TCGACAACTT 2580
CAATCTCTTC TGGAACCAAA GACAGCTGTT TACATCAGAT GGCCTTCATC CAAACAAACT 2640
TGGTGCAAAG GTGCTAAAGG ACAATATATT TTTCTCCCTC CATCATCCAT CAGCTGTGTA 2700
TGCCACTGAA CTGAATTGCA AACACACACC TAGCAAATGT TCGGATGACC ACAGGACTTC 2760
AAATCAGCTC CTGAGTGGAC TTGTGGCTGA CGAATCACCC AAGGACAGTG ATAATGCCAC 2820
GCAGCCAAAA CACCCAATGT TGATAGAGAC ACTATCACTT GTACTCTGCT CAACACAGGC 2880
AGACTGTGAC GCATCAGAAC AGGATTGTAG CGCAGCAGTT CTGAATGAAG CAGCTCC 2937