EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-27482 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:48041755-48042768 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArntlMA0603.1chr4:48041871-48041881GGTCACGTGC+6.02
FOXE1MA1487.1chr4:48042175-48042190GTTGTTTGTTTTGCC-6.13
Foxa2MA0047.2chr4:48041859-48041871TGTTTACATTGT+6.04
Enhancer Sequence
GCGCTGAGAT GAAGCATGCG CGTTGCTTAT GTGTGAGCGC ACGGTAAGGT GTTTATCTAT 60
CGTGTGCTCA TGTCTTGCGT CTTTTGTCAA AGCACGTGGC TCGGTGTTTA CATTGTGGTC 120
ACGTGCTTTT GTCGTGTGCT TCAGTGTTGT GTTATGTGAG CGCATGGCTT GTATTGTCTC 180
TCTGTGTCAT GCGCTCTCCC GTCTATTGTC TAGTCCCACC CTCCTTGTCA ACCCATTATT 240
AGTTAATTGT GTTCACCTGT GTGTCAATTT ACTTTTTGCT TTATAATCCC CCTCATGTTT 300
TCAGTCCTTT GTGAGTTCGT CGTCGAAAGT TTCCTGTCCT GTTGTGTCTA GCACTGTCTT 360
GTCCAGCCAG TCAAGTTTGT TTGTTCATTT ATTTGTTTTA TTAGAGTTTT TCCCCCTCGG 420
GTTGTTTGTT TTGCCTTTTT GTTTTCATTT TATAATTAAT AAAAACCCAT TATTGCTGCA 480
CCTGAGTCCT CGCTCCTTTT CCCCTCACCG ACCGTGACAG TACGAACTCA CCAAAACAGA 540
GGACTCAGCA GAAAATGGGT ATCTTCCTTT TCCCATCTCC CACTTCTCGT CCCTCTGCAT 600
GCCAGCAGAA GGAGCGTTTA GGCAGACTCC TTTCACTCCA TCAAGGGGTA TCTACAGTGA 660
AGGAGTTTGC ATACCAGTTC ATCTACGCTG CAGAGGGGCT TGAATCTACA AACACTGCAC 720
TGAAGGAGGC GTTCAACGCT GGACTCAACA GCCCCCTTCA GGCCTGGGAG ATGGGAATGC 780
TGGGGATTTT AACATTCTGG CAGTTTGTGA GTTATGTCTA CCACAGCCAG GGAAATGGTG 840
GCCTGCCTCC ACTTGGTCCA CCGCCCCTCC CACTTACAGA TTGCCAAATC CCCAGTCCTC 900
CGATGACCCA CCAACGGAGA CGGAGGAGGA AGAACGGGTC AGCCTCACCT GTCGCCCACC 960
CAGAGGTGAC TGAACCTGCT GCAGCCCTTT CAGTTACCAT CCTGGCTGCA GCA 1013