EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-27131 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:43837815-43840129 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BATF3MA0835.1chr4:43838190-43838204TGATGTCGTCATCA-6.67
BATF3MA0835.1chr4:43838190-43838204TGATGTCGTCATCA+6.81
BHLHE22MA0818.1chr4:43837947-43837957AACATATGGT-6.02
BHLHE23MA0817.1chr4:43837946-43837958AAACATATGGTA+6.62
Hmx1MA0896.1chr4:43838248-43838265CTCCATTAATTGCTGGA-6.88
LEF1MA0768.1chr4:43837982-43837997ATGTCTTTGATGTTT-6.12
OLIG3MA0827.1chr4:43837947-43837957AACATATGGT-6.02
TCF7L1MA1421.1chr4:43837985-43837997TCTTTGATGTTT-6.14
TCF7L2MA0523.1chr4:43837983-43837997TGTCTTTGATGTTT-6.71
Tcf7MA0769.1chr4:43837985-43837997TCTTTGATGTTT-6.18
Twist2MA0633.1chr4:43837947-43837957AACATATGGT-6.02
Enhancer Sequence
AGGATGGGAG GCGAGGTGAG ACAAGTCTTT AATTTCTTCA GTGCTTGTTG ACATTGAGGT 60
GTCCATTGAA AAATTCACCC TTTTTTCTTC AATGAGTTCA TGGGCTCTGC AATTTGAGAA 120
AGGTTTGGCA CAAACATATG GTACCACCCT GCCAATCCAA GGAGTTAATG TCTTTGATGT 180
TTTTTTTGGA ACCGGGTAGG ATGTTATCGC TTCTACTTTA ATGGAATCAG CAGGAATGGC 240
CTGGGTGTTC ACCACATGTC AAAGAAATGA TAATTTATGT TGGCAGAATT TACTTTTCTT 300
CAAGTTAATG ATCAGACCAG CTTTGTGTAA CCAGGTGAAG ATCTTTGAAG TGTTGGGTGA 360
CTGAGGGTGA GTATATGATG TCGTCATCAA AATACACAAA ACACATTTTT CCCAGCAACT 420
CTGCTAGGAC AGACTCCATT AATTGCTGGA ATGTTGCTGG GGCATTTTAA AGTTTTTAAA 480
TCCAAAAGTC TTGGATTCAC TTCCAGGCTC CATAGTTACC TGCCAGTATC AACTGTTGAG 540
ATCAATGGTG GAGAAGATGA CAGCACCAGA GAGGGATTCC AGTATCTCTG TGATGTTAGG 600
TAAGGGGTAG GCATCTCTTT CTGTGATAGC GTTCACTTTA CGATAGTCCA CACACAACCT 660
CATACTGCTA TCTTTTTTGG GGACAAGGAC AATGCGTGAG GCCCACGCTA TTTGTGTAGG 720
TTCTGTGAGG CCATTCATTA GCATTTCTTT GACTTGCTCT TTAACAATCT CTTGCTTCTC 780
TGGTTTTAAA CGGTATGGAC GTTGTCTGAT CAGCACAGGG TAGTCAATAT ACAAGCAGTG 840
CTGTAGAACA GTTGTTCTTC CAAGCTGGGA GGTACATACT TGTGGATTCT GCAGAAGTAG 900
ATGATGTAAC TGGCAATTTT CTTCTGGATG CAGGTGAGAT TGATCAACTG ATGCTTTTAT 960
TATTGTCTTG TCATCCCTAT TATCTGGTAA CTGGAATAGA CTTTGTGGTG GGGGATTTGA 1020
GGTGAACAAC AAAAGAGCTT GGCTTGAGTT TTTTCTGTGC ACTTTTTTTT TCTGGTGCAG 1080
GTATGTTTTT TTCTGGAATG CTGGCCTGCC CAGGCTGAAA AGCATACACT TGGTTTCGGG 1140
TTGATGTGCA GGTTTAATTT TCACCAGCCA CATTGATCTG TAGCCCACTG GTAAATATAT 1200
AATCCAATCC TAGGATCACT AAATAAGTGA GAGCTGTGGA AGTGAGGATA GCAAATGGAA 1260
TAGGAAAAAA CATATTGTAA AGAATGACAT TTGTTTTTGC CCGTCCTAAA GGTATGGCGG 1320
TCTCACCATT AGCAAAGTAG AGGAGACCAT GGGGCCATTG ATGAAGAACA TCAAGGGAAG 1380
CAAGTGCTGA CCTCAAATGT TGGTGAAGTA GGGTATAGCT GGCTCCAGTG TCGATTATGG 1440
CTTTTCCAGA CCAAGCTCCA AGGGTGCTTG ATACAATTAG CTGTTGTGGT ATGAACTCAT 1500
GGGTAGGAGG ATGACTTGGT TTTGCTGTAA TTGTGGAGTT GGAGTTGTAA CAGAGATGCT 1560
GTTGTGAGAA GGTGCAGGCC TTTGATGCTG TGTGGGTATA TTTTATCTCC TTCAGCAGTG 1620
GTTCTCAATA TACCAATATA AAATATACCA GGATTTTAAA GCGATGATTT GACTGACATT 1680
AAAAGTGACC AATCACAGTC AACCTTGTCT AGTTTTGCAT TGAACGTAAG GGCAGGACAA 1740
AGGCCTTTCT ATGTTCCAGT GACAGAAAAC AACAACTTAA AAACAAATGC ATTATTGAAA 1800
TAATGCTTTT TGGGTGTTTT TACTATAGAG ATGTCTATGT TATTCACAAG AGTAATTAAG 1860
CCGAGGACAT CCTGCCATTT TGCATTCTCT CCGACGGATT TTACTCGCCT CTAACCTATC 1920
ACTCTTCTGA AGCCTAGTTT AATACAATCT GAGAGCATAC TCACACTATG AACAGTTGCT 1980
TTGAACTAGG CCAAAGCACG CTTGTCCTCC ATTCAGGCCA GGGCACGCTT ACAATATCGA 2040
TGATGCACTG TTCAGTAGAG AAGTGCTCTC GCTCAGCACA GTGGAGACTT CTCTAGTTAT 2100
GTTGTTTTAG TCGTTTGGGA TGCAGTGACA CACAATCAAA TATTTTGCCG AACAGATCCG 2160
CCAATTTTGA CGCTCATAAA CAGTCATAAA GTCCTCGTGC TGCAGGAATT AGGAGGTTTG 2220
CAAAAGGCAC AGCTGTGGTG CATTGAGGAG TTTGCGTCTT TAATAAACTA CAACAGTTTG 2280
CATTCATTGA ACGGTAAGAA TGATTAATAA ATGC 2314