EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-27060 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:42856100-42857593 
TF binding sites/motifs
Number: 28             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF14MA0740.1chr4:42857357-42857371GGGGGGGCGTGGCT-6.35
KLF16MA0741.1chr4:42856713-42856724GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr4:42856859-42856870GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr4:42857005-42857016GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr4:42857151-42857162GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr4:42857359-42857370GGGGGCGTGGC-6.62
NR4A1MA1112.2chr4:42857262-42857272GTGACCTTTA-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr4:42857345-42857358TTTAAGTGGTTTG-6.24
SP1MA0079.4chr4:42856712-42856727TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr4:42856858-42856873TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr4:42857004-42857019TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr4:42857150-42857165TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr4:42857358-42857373GGGGGGCGTGGCTTG-7.85
SP3MA0746.2chr4:42856712-42856725TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr4:42856858-42856871TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr4:42857004-42857017TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr4:42857150-42857163TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr4:42857358-42857371GGGGGGCGTGGCT-6.74
SP4MA0685.1chr4:42856710-42856727TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr4:42856856-42856873TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr4:42857002-42857019TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr4:42857148-42857165TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr4:42857356-42857373TGGGGGGGCGTGGCTTG-7.45
SP8MA0747.1chr4:42856712-42856724TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr4:42856858-42856870TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr4:42857004-42857016TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr4:42857150-42857162TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr4:42857358-42857370GGGGGGCGTGGC-6.44
Enhancer Sequence
CTAAGGTGTT GCTAGGCGGT TGCTAAGGTG TCCTGAGTGG TTGCTAAGGT GTTGCTAGGT 60
GGTTGCTAGG GTATTCTGAG TGGTTGCTAA GGCGTTGCTA GGCGGTTGCT AGGGTGTCCT 120
GAGTGGTCGC TAGGCCCTTA CTAAGGCGTT ACTAGGCGGT TGCTAGGTGG TTGCTAGGCG 180
GTTGCTAGGG TAATTTGGGT GGTTGCTAGG CAGTTGCTAG GGTACCCTGG GTGGTTACTA 240
GGCAAGCCTC ACATACATGC CTGATGAAAT ATTTATACTT AGTAAGCATT TCTAGCAAGT 300
TACAGTACAT GGCTAGTCAA TATTAGCATG TAGCTAGTCA CTGCTAGCAT GTGTAGCATA 360
TAGGAAGTTC CGTTTGCTAG CATGAGTCAA ACGAGCCAAT CCCCAAGTCT CTACGATGTT 420
CCGATGCCGA GATATAGCTG TTGATGAACG GTTGCTAGGG TACTCTGTTT TGTTGCTATG 480
GGCGAGGTTA CAGAGTGAAC TTGAATGTGG TTGGCTGTCC AAGTCAAATG AGCCAACCCC 540
CAAGTCAATA GGACACTGCT AAGCAAAGAT ATGCATGTAG AGCAGTTATA ATGGCAGTCT 600
ATGGGACCAG TTTGGGGGCG TGGCTTGTGA GATTCATTAT CATATTGAAA TGCTCATTGG 660
TTGTCTGAGT CAGATGAGCC ATCCCCCAAG TCAATAGGAC ACTGCTAAGC AAAGATATGC 720
ATGTAGAGCA GTTATAATGG CAGTCTATGG GACCAGTTTG GGGGCGTGGC TTGTGAGATT 780
CATTATCATA TTGAGATACT GATTGGTTGT CTGAGTCAGA TGAGCCATCC CCCAAGCCAA 840
TAGGACACTG CTAAGCAAAG ATATGCATGT AGAGCAGTTA TAATGGCAGT CTATGGGACC 900
AGTTTGGGGG CGTGGCTTGT GAGATTCATT ATCATATTGA GATGCTGATT GGTTGTCTGA 960
GTCAGATGAG CCATCCCCCA AGCCAATAGG ACACTGCTAA GCAAAGATAT GCATGTAGGG 1020
CAGTTATAAT GGCAGTCTAT GGGACCAGTT TGGGGGCGTG GCTTGTGAGA TTCATTATCA 1080
TATTGCGATG CTGATTGGTT GTCTGAGTCA GATGAGCCCA CCCCCATGTC TCTATGACAC 1140
TCCTATGTAA TGTTATAGAT GTGTGACCTT TATAATGGAA GTCAATGGGA TCTGCATTGG 1200
GACATCCCAC CCCATGTTAA GTCAATGGGG CACTTATTAA GGGTCTTTAA GTGGTTTGGG 1260
GGGGCGTGGC TTGTGAGCTT CAAAATCATA ATGAGATGCT GATTGGTTGC CTGAGTCAAA 1320
TGAGCCCACC CCCAAGTCAG TATGACACTG CTATGTACTG TGATTGACAT ATGACATTTA 1380
TAATGGGAGT CAATGTAATG AATGGGAGTC AATGGGGCCA ATGTAAGTCA ATGGGACCAC 1440
TTTGGGACGT CCTAGCCCCC CAGGGGTACA ACTTATACCC CCCTGCGTGG TAT 1493