EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-27053 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:42822122-42824526 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF14MA0740.1chr4:42824022-42824036GGGGGGGCGTGGCT-6.35
KLF16MA0741.1chr4:42823524-42823535GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr4:42823670-42823681GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr4:42823816-42823827GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr4:42824024-42824035GGGGGCGTGGC-6.62
NR4A1MA1112.2chr4:42823927-42823937GTGACCTTTA-6.02
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr4:42823104-42823115CTTGAGTGGTT-6.32
SP1MA0079.4chr4:42823523-42823538TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr4:42823669-42823684TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr4:42823815-42823830TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr4:42824023-42824038GGGGGGCGTGGCTTG-7.85
SP3MA0746.2chr4:42823523-42823536TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr4:42823669-42823682TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr4:42823815-42823828TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr4:42824023-42824036GGGGGGCGTGGCT-6.74
SP4MA0685.1chr4:42823521-42823538TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr4:42823667-42823684TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr4:42823813-42823830TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr4:42824021-42824038TGGGGGGGCGTGGCTTG-7.45
SP8MA0747.1chr4:42823523-42823535TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr4:42823669-42823681TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr4:42823815-42823827TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr4:42824023-42824035GGGGGGCGTGGC-6.44
Enhancer Sequence
TTGTACATTT CCTAAAGGAA ATGTGAATGG GGTTTGCGTG GCAAATCGAT GGGGTACAAA 60
ATGGTACTAA ACTGGGCAAT AGCACTGGAA AGGTAAGAAA TGGTGGTTGC TAAGATGTTG 120
CTAGGCGGTT GCTAGGGTGT TCTGAGTGGT TGCTAGGTGG TTGCTAGGGT GTTCTGAGTG 180
GTTGCTAAGT GGTTGCTAAG GTGTTGCTAG GCGGTTGCTA GGGTGTTCTG AGTGGTTGCT 240
AGGTGGTTGC TAAGGTGTTG CTAGGTGGTT GCTAAGGTGT CCTAAGTTGT TGATAGGTGG 300
TTGCTAAGGT GTTGCTAGGC GGTTGCTAGG GTGTCCTGAG TGGTTGCTAG GTGGTTGCTA 360
AGGTGTTGCT AGGCGGTTGC TAGGGTGTCC TGAGTGGTTG CTAGGTGGTT GCTAAGGTGT 420
TGCTAGGCAG TTGCTAGGGT GTCCTGAGTG GTTGCTAAGT GGTTGCTAAG GTGTTGCTAG 480
GCGGTTGCTA GGGTGTTCTG AGTGGTTGCT AGGTGGTTGC TAAGGTGTTG CTAGGTGGTT 540
GCTAAGGTGT CCTAAGTGGT TGCTAGGTGG TTGCTAAGGT GTTGCTAGGC GGTTGCTAAG 600
GTGTCCTAAG TGGTTGCTAG GTGGTTGCTA AGGTGTTGCT AGGTGGTTGC TAGGGTGTCC 660
TGAGTGGTTG CTAGGTGGTT GCTAAGGTGT TGCTAGGTGG TTGCTAGGGT ATTCTAATTG 720
GTTGCTAAGG CGTTGCTAGG CGGTTGCTAG GGTGTCCTAA GTGGTTGCTA GGTGGTTGCT 780
AAGGTGTTGC TAGGCGGTTG CTAGGGTGTC CTGAGTGGTT GCTAGGTCGT TGCTAAGGCG 840
TTGCTAGGTG GTTGCTAGGG TATTCTAAGT GGTTGCTAAG GCGTTGCTAG GCGGTTGCTA 900
GGGTGTCCTG ATTGGTCGCT AGGCCCTTAC TAAGGCGCTA CTAGGCGGTT GCTAGGTGGT 960
TGCTAGGTGG TTGCTAGGGT AACTTGAGTG GTTGCTAGGC AGTTGCTAGG GTACCCGGGG 1020
TGGTTACTAG GCAAGCCTCA TATACTTGCC TGATGAAATA ATTATACTTA GTAAGCATTT 1080
CTAGCAAGTT ACAGTACTTG GCTAGTCAAT ATTAGCATGT AGCTAGTCAC TGCTAGCATG 1140
TGTAGCATAC AGGAAGTTCC GTTTGCTAGC ATGAGTCAAA CGAGCCAATC CCCAAGTCTC 1200
TACGATGTTC CGATGCTGAG ATATAGCTGT TGATGAATGG TTGCTAGGGT ACTCTGTTTT 1260
GTTGCTATGG GCGAGGTTAC AGAGTGAACT TGAATGTGGT TGGCTGTCCA AGTCAAATGA 1320
GCCAACCCCC AAGTCAATAG GACACTGCTA AGCAAAGATA TGCATGTAGG CCTATTTTAA 1380
TGGAAGTCTA TGGGACCAAT TTGGGGGCGT GGCTTGTGAG CTTCATTATC ATATCGAGAT 1440
GCTCATTGGT TGTCTGAGTC AGATGAGCCA TCCCCCAAGT CAATAGGACA CTGCTAAGCA 1500
AAGATATACA TGTAGGCCAG TTATAATGGC AGTCTATGGG ACCAGTTTGG GGGCGTGGCT 1560
TGTGAGCTTC ATTACCATAT TGAGATGCTC ATTGGTTGTC TGGGTCCAAT GGGCCAACCC 1620
CTAAGCCTAT ATGACACTGC AATGCAAAGA TATGCATCTA GCCCAATTAT AATAGAAGTC 1680
TATGGGATCA ATTTGGGGGC GTGGCTTGTG AGCTTCATTA TCATATAGTG ATGCTGATTG 1740
GTTGCCTGAG TCAAATGAGC CCACCCCCAT GTCTCTATGA CACTCCTATG TAATGTTATA 1800
GATGTGTGAC CTTTATAATG GAAGTCAATG GGATGTGCAA TGGGACATCC CACCCCATGT 1860
TAAGTCAATG GGGCAGTTAT TAAGGGTCTT TAAATGGTTT GGGGGGGCGT GGCTTGTGAG 1920
CTTCAAAATC ATATTGAGAT GCTGATTGGT TGCCTCAGTC AAGTTAGCCA ACCCCCAAGT 1980
CTGTATGACA CTGCTATGTA ATGTGATTGA CATGTGAGTC AAGAAATGAA TGGGAGTCAA 2040
TGGGCCATGT AAAGTCAATG GGGACCCCTT TGGGACGTCC TAGCACCCCA GGGGTACAAC 2100
TTATACCCCT TTTCGGGGTA TGTTCTCATA CAGGCTGCAA CCCCCTACAG ATGTTGCGAG 2160
TCCCATATTT CTACGAATTT CACACTTGGC GCTATGACGC TTTAAAGGTC GTCCCATTTC 2220
GCGGCGCGTT TAGTGCTCTT CTAGAAAAAT GAATGGGAGT CAATGGGGCC AATGTAAGTC 2280
AATGGGAGCA CTTTGGGACG TCCTAGAGCC CCAGGGGTGC AACTTATACC CCCTTGCGAG 2340
GTATGTTCTC ACTTAGGCTG CAACCCCCTA CAGATGTGGT GAATCCCATA TTTCTATGAA 2400
ATTC 2404