EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-27001 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:41934764-41936239 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr4:41935064-41935075ATTGATACATT-6.62
DMRTA2MA1478.1chr4:41935063-41935075TATTGATACATT+6.02
DMRTC2MA1479.1chr4:41935063-41935075TATTGATACATT+6.52
Foxo1MA0480.1chr4:41934853-41934864TGTAAACAGCA-6.14
PHOX2AMA0713.1chr4:41935595-41935606TAATCTAATTA+6.32
POU1F1MA0784.1chr4:41936046-41936060TTCATTTGCATAAT-6.99
POU2F1MA0785.1chr4:41936048-41936060CATTTGCATAAT-6.62
POU2F2MA0507.1chr4:41936046-41936059TTCATTTGCATAA+6.67
POU3F1MA0786.1chr4:41936047-41936059TCATTTGCATAA-6.52
POU3F2MA0787.1chr4:41936047-41936059TCATTTGCATAA-6.52
POU3F3MA0788.1chr4:41936047-41936060TCATTTGCATAAT-6.22
PROP1MA0715.1chr4:41935595-41935606TAATCTAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr4:41935595-41935606TAATCTAATTA+6.32
Pou2f3MA0627.1chr4:41936045-41936061ATTCATTTGCATAATG-6.01
ZNF384MA1125.1chr4:41935221-41935233TTTTTTTTTAAT-6.74
Enhancer Sequence
TACACACATT TCTGTTAACT TATTCAAACA ATAGACCTTC ATTACTGTGA GTAAAATAGT 60
ACTACGTTGT ATAAAGGGTT AAATAATATT GTAAACAGCA GGGTCATAAT TTAGCATTGG 120
ATGAAAATCC TGAAACTTTA TTCAATCAGT TTATATTTCT GTAAAAGTTT TAAACACAAA 180
CCTTTCTCCA GTTGAATTCC AGCGCAGGAG CGGCGCAGCC TTATGACGTC ACACACCACG 240
CCAAAATAAA AGTCTTTTTT GTTTAGATTT TTTTGCCACT TACTGTTGCA GTCATGACTT 300
ATTGATACAT TTCTCCCTCG TTTTCCACTT TCTACTATAT CTGCTCTCTC TCTCTCTCTC 360
TATCACACAC ACACACAACG AGAGAGGCAC AGATAAACAG TATTTGAAGT TGATCAAAAC 420
CTTTAATCTA AACTTTTTAA AGACAATTTT GAAAAACTTT TTTTTTAATC CACTTTATGA 480
TGACTTGCAG GTCTAAAACA CATTACTATT AATATCCAAA TGTCATCCTT GTAATTATGA 540
CATCTACTTT CCTATTTCTA CAACTTCATA GGCTATATTT AGGGTTTTAG TGCAGTCTAG 600
GCACTCAGGC ATTGTCTGCC ACCTGAACTT TGCTCATCTT CAGAACACAA ATGAAGACAC 660
TTTAGATGAA ATCTGAGAGT CCCGAGATGC TTAAAGTCCA GAAAAGTAAC CAAAAATAAG 720
TGGTTCAATT GTAATGGAGC CCCATCCTTT AAATGTCCAT ATAATGAAGC TCATTGACTG 780
TTTGAAATAA AACTACAGTC CTGAGTATTT GTACATTTAT GTGAAGATCT GTAATCTAAT 840
TATTTACCTT AATCTGAAAA AATAAAACAA TGTTATTAAG GTGTTTAACT TGAGTTGCTT 900
CCAACATTTC CTTCACTCCT CCAGTACAAT GAACAATGTA AAGATTCATT AGCAAATTTA 960
CTTTAATTTG AATAGAAGTA AAGTTGGTTT TATATTCAGA TATTCAGACA TTCTCCTTAA 1020
TAATATCGTT TCAGAAAAGT ATTCATTGCA AATACTAAAT AGGGAAATCA TATTAGCAGC 1080
AAATGACTAT CAAAGGACAG CATTGTTCAC AGTTAAATAA ACAGTGTTAA TGCTGTTTTC 1140
AAGTCATACT GCATGCAAAT TCCGATCGAA TATTTAAAGT AACATGGTAA ACAATATAGA 1200
GACTTCTAAA TGAACGAATG TGTGAATATA AAACCAACTT TACCTCTATT AATTTGAAGG 1260
ACAATAAGTG TTTATGTTCC CATTCATTTG CATAATGATA AAAGCTAATT GACAATAGAA 1320
TTAGGTGGCT CAATAGTTTG CAGTATTAGT GAAAACAGAA GTTGAATACT TGAAAACTTT 1380
TACAACCCTT TTATATAAAA CCTTTAATAT TTCTTGGCCG TGACCTCAAT TCCGGTTTTT 1440
AGAAATTAAC TTTTAAATGT AAATTTATAC ATCTA 1475