EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26932 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:40830951-40832356 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF14MA0740.1chr4:40831167-40831181TAGGGGGCGTGGTT-6.23
KLF16MA0741.1chr4:40831169-40831180GGGGGCGTGGT-6.14
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr4:40832334-40832345CTTGAGTGCTT-6.02
SOX10MA0442.2chr4:40831982-40831993AAAACAAAGCA+6.02
SP1MA0079.4chr4:40831168-40831183AGGGGGCGTGGTTTG-7.12
SP3MA0746.2chr4:40831168-40831181AGGGGGCGTGGTT-6.09
SP4MA0685.1chr4:40831166-40831183GTAGGGGGCGTGGTTTG-6.95
SP8MA0747.1chr4:40831168-40831180AGGGGGCGTGGT-6.52
Enhancer Sequence
GCACTATTTT TATTCATTAA ACACAGCTTT TTATATAAGC TGTAGATTGT TTGTACTACG 60
TTTTATTTCA TACACGCACT TTGTTAACCT TTCGTATTTT AGGTCTTTTA TTAAAAAATA 120
GTTTGTGCTC GCTGCCATTG TGATAAAGCT GGAGCTGCTG GACCAATGAA ATCGAGCCAC 180
GGACGTGAGT CACAGCAGCG GGGTGGGGTT TTCGCGTAGG GGGCGTGGTT TGCGCTGAAC 240
TGGTTTGGGA AAAAAAATCA CGCATGCCAC ACAGTGCAGA CGCTCATACT ACTGAAAAGG 300
AAGTTACCTG ACTGAGAAAG GTATAAATAG AAATCGGAGC CTGCTCCAAA CGACCTGGTC 360
AGCCCCAAGT GGGCTGTAAA AACCTCCTGG AGTTTTCATT CATTTAATGT CTGGTACAAG 420
ACACTGCGTC CAACCAGTTA TGTTTGAATG TCAAACCTAC CCCAATCCTT AAACCAACCT 480
CACAGTTTCC TGCTGTGTTT TATCAACCTC CCAACCTACC CCAACTCTTA ACCCAACCTC 540
ACAGTAACAA ACCTCCATGT GGGTTTCATT GATTCAATGT CTCGTACATG GCACAGAATA 600
CAACCTATCG CAGTTTATTA AAATCACACC TACCCCAGCC CTAGGCCCAA CCACACGGTA 660
ACCTGCTGTG TTTTATTCAA TTTTACTCCT ACCCCAACCC TAAACACAAC CTCAGAGTAA 720
GCAGTTTATA TATATTTTTT ATTTTTATGA ATGTCTACTA CAGCTACATC AATCGCAAAC 780
CCAGCCTACG TGCGGTATAA GTGCCTACCA CTTAGAGGTC ATCCAGCCAA CTTGCAGTGT 840
AATCTCCTCC ACTTGTAGGT CTCTGAGCTG CAGCAACACC TAAGGGCTCT GACACACAGA 900
CACAAAAGAA ACCATTGCTT TTAACCTACT CTTGGAGAGG AGAGAGTCTC CGACCCTGGA 960
TCTCAGGTCT TCTATGGAGG GACTGTCAGG AACCCTGTAA GAGCATCCCA TCCACACAAC 1020
CTCTTGCCAT AAAAACAAAG CAGAATGTGT GGTGAAGGAA CTCCGGGTTG ACAGAGCCTT 1080
GTCCTTGCTT CAAGCAAAGT GCTAACAAGG TGCTGAACAG AGTGACGGTG GCACAAAGGT 1140
TAGCGCTTAT GACTACGGAT CGGAAGATTC TCGGTTTACG GAAACCAAGA AACTGTGTAT 1200
GAGAGAGTGC GTAAGTGTAT GAGTGGCACT TGTGCAAGCG GAGCAGGGAC GTGCCAGCGA 1260
TCAGAATGAA CTGGAGTTTG TGCCAAGACT GGGTTTCAAG TGTGGCAGTT CCCATATGGT 1320
CTAGCGGTTA GGATTCCTGG TTTTCACCCA GGCGGCCCGG GTTCGACTCC CGGTATGGGA 1380
AGGCTTGAGT GCTTTTGCTT CTGTC 1405