EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26895 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:40116575-40117575 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr4:40117112-40117127GATTAATCATTGACT+6.33
HNF1BMA0153.2chr4:40117113-40117126ATTAATCATTGAC-6.36
Lhx3MA0135.1chr4:40117434-40117447TAATAATTAATTA-6.18
Enhancer Sequence
TTAGTCTTTT GCCCACTTGT GTGCATTGAA GATCACTGTG TGATGTTTTA AATCAAAGTG 60
TGCACGTGTG AATCTGTGGT TCATTTTGGG CCCAGTACCT AGCCTGCCCG ACTGTGGTAA 120
GCCCCAGCTC CTCTGGTTGA ATGAAGATTT ATCTTTTTTT TTGTAATTGC CTCCACTAGT 180
GCCTTTTTAA AAAGAGTGCA TGTGCCTGTC TTTTAATATT TGTGGTCCAA AGATAATTGA 240
ATTGTAATAA AAGAAACCCT ATTTTTCTAT ATCCACGTCT CATTGTCTTT GCCAGAGGTA 300
TGAACCTGTA TTTTATGTTC CAGCAAATGT ACTGGGTGGC TTAGTAGAGC TCTAATTGCA 360
ATAGTTTGTG TTAATTTGGC TTTAGTGTGC CAGTTATTGT ATTGGTCTTG CGACCAACAA 420
AAAGCCTTAT CCCCTCTGCG TGCCATAAAC CAAAAAATTC CCTTTGAACT AAAAATTTTT 480
ATTTGAGAAA CTTTTAAAGT ATTTTGAAGC AGTAAACATG TCAGGCAAGA TTATTCTGAT 540
TAATCATTGA CTTCTGCTTT CTTCATTAGT TACAAAAGCA CAGATTTCTT TACGATTTAA 600
AACGGCATCT ATGAATATTT TCTGCTGGAG ATAATGTTGT CCTGAAAAAC TTAAAACATA 660
AAAACCCTAC ACTCTAATGT TTGCATATCA TCAGCATGCT GTAATCCATT TCATAAGCAG 720
CAAAAGTCAT TTTTAGACTA GTTTGTTGGC CAGTTGTAGT CAGTGCAATG CTAAACGTTA 780
TTGTTCCACT ATAATTTGTT TTTGTCTCAC GTCGTCCCAC AACAACATCA TATAGTTTAG 840
AATACTGTAC AATGTTTTAT AATAATTAAT TACTTTAGTG TCCATTTCAT TCAGCATATT 900
TTAAATTAGG GGCAACGACA TTTTCTGACA TACTTTAAAC CAGGGTTTGT ACAGGTGTCA 960
CCAAGTTAAA TTTAAGACTT TTAAAGACCT TTTTAAGACT 1000