EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26824 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:38536287-38538401 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr4:38538361-38538373AAAGTAAACAAT+6.44
FOXC2MA0846.1chr4:38536862-38536874TTTGTTTACTTT-6.62
FOXF2MA0030.1chr4:38538359-38538373GAAAAGTAAACAAT+6.29
FOXP2MA0593.1chr4:38536862-38536873TTTGTTTACTT-6.62
Foxd3MA0041.1chr4:38536857-38536869GATTATTTGTTT+6.07
Foxj3MA0851.1chr4:38538359-38538376GAAAAGTAAACAATGTT+6.18
Foxj3MA0851.1chr4:38536859-38536876TTATTTGTTTACTTTAA-6.75
GSX1MA0892.1chr4:38537837-38537847CCTAATTAAA+6.02
PKNOX1MA0782.1chr4:38537283-38537295TGACACCTGCCA-6.02
PKNOX2MA0783.1chr4:38537283-38537295TGACACCTGCCA-6.27
POU2F1MA0785.1chr4:38537716-38537728TATATGCAAATT+6.18
POU5F1MA1115.1chr4:38537717-38537728ATATGCAAATT+6.62
ZNF384MA1125.1chr4:38537043-38537055ACTAAAAAAAAA+6.32
Enhancer Sequence
TACATTTTCA AATGCATCAG GAAAGAAGGA GACAGCAAAT GCAACAGCAG AAAATTGTAG 60
AAAAGTATGT TTAACTTGAC TGTATCTAGA TCATTACTGT TTTCTGTGTA TAACTAAAAA 120
CTCTGTACTC TTTAAAAAGG CAATAGAGGA TCGCCAGATA TAAATATATC TGCACTTGTT 180
TAGTCGGCTG ATGGAGTCAC ATTACAATTC AAATACCCAG ATGGGAGAAT TATGAAGAGG 240
ACATTCAAAG TCACGCAGCC TTTTCAGGTT AATAATCATT TCACTTGTGT ACCCATTTAT 300
TGGAAAAAAA TAATACATTA CAGAGCTTTT ATTTATTTCT TTCACAGGAC TTGGTTGCAT 360
CTGCTGGTCT GGATGAGATG GCAAGTGAGA TTTTCTCTCG CTATCTCCCT TATATAGCAA 420
TTTGGGAGGT ACACTACAGG ACCATGGCAT AGTAGGATGT TCTACATTTT GTGTTGCGAT 480
TGTCCTCTGA TGAAATACAG GTTAAAAAAA GTGTTTTGTT ACATTATGTG ATAATTACAA 540
ATGATAATTA ACAGCGTGAA TCATCGTCTT GATTATTTGT TTACTTTAAA AGTTAACCTA 600
GAAAGCAGCT CTAAAGCATT TTATTCACGT GATTTGAGCC CATTTCATTC TGTGATATCT 660
AGACTTTTGT GTTCTGCCTT TAGTAATTGT ACAATCTGTT AGCTTACTCA CTTTTTGGGA 720
CTATTCCTTT ACACTGGCCT TAACTCAAAA GCAAACACTA AAAAAAAACT TTTTTTTTAA 780
GTAACAGATC TTTACCATTA AAGTTTACAT TTCTGTCAGA TTTGTTTGTA GTGCTGTCTG 840
TCTTATTGTT ATGATTTATA TATTACATTC TGTCTTATAT ATAAATTAAA CAGACAAGTT 900
AAGATTGGGA TTTCAAATAT TTGTATGAAA CTTACTTATA ATAAATGCTA TCATTTCAGG 960
AAATTCTAAA CAAAACTGCC ATGTTATCAA ATGGACTGAC ACCTGCCATG TCTCCCACAC 1020
ACACCTCCAT TTCCAACCTT GACCTTTCCA TTTCTCCCCC TCACCCTTCT ATATCACTCC 1080
CACATCTCTC CCTCTCCCCC CACAGCCCTC CATGTCCCCT CCACACCCCT CTAATTCCTT 1140
CTTTGCAGGT CACCATGGTT AACAATGGAA GAACAAAGAT TTCAAGCATC ACCCTCCTTT 1200
TAACATGTCA AGTCTGCCAT TCTAACCCGA TCAGCCTGAC ATAATGATCT CCAGCCTTGT 1260
GCTCGTCAAC ATTCTCACCT GAGTTAACAA GACAATTACT GAAATGATCT CAGCAGGTCC 1320
TTTAATGACA GCAATGAAAT GCCGTGGAAA GTTTTTTTTC AGGATTAAGT TCATTTTCAT 1380
GGCAAAGGAG TATGCAATTC ATCTGATCAC TCTTCATAAT GTTCTGGAGT ATATGCAAAT 1440
TGCTATTATA AAAACTTAAG CAGCAACTTT TCCAATTTCC AGTATTTATG TAATTCTCAC 1500
AACTTTTGGC CACGACTAAA TACAGGGTAA CGGTGCAGTT AGGCTTTAAC CCTAATTAAA 1560
CACACCTGAT CAAACTAAAT CTAAAGGTTG AAGAAGGGCT GGAACTAAAT TCTGCTGGGC 1620
TGCGGCCCTC CAGGAGTTTG ACACCCCTGG TGCATAGCAT ATTTTAAAGC AACTGCCTAC 1680
ATTTATCACA ATCATGCACA TATCGTTAAA TAAAAACAAT AAAATATACA AACTTCATCC 1740
AAAGCAAAAA AATTATAATA AATAATCTGA TCCTAATGTC GTGCCAAACC TGCAGTAATA 1800
ATAAAAAACA CAACAAGTAA CCTGATTTAT ACTACGTATT TATTTAGGAA AGCATTTATA 1860
CTATACTGTT AATGCCACTT TTACTTACTT CATTTGAATT TTTCCTGACA AATTCATTGA 1920
GTCTATGTAA AAATGTATGT ACGTGCTGTT TAAGATATAT AATTTAAGTA ACACATTTTT 1980
ACTAGTTATT TAGCAAAATA CTAATATTCA GATTAAAGTG CAATTTAAAA GCTTAACTAT 2040
AGGCTAAAAT AGGCAAATTA GATTAATTAT ATGAAAAGTA AACAATGTTA TAAGAATTAT 2100
TGTGAAAATT TCTT 2114