EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26720 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:35916440-35917762 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD9MA0913.2chr4:35917688-35917698GTTTTATTGC-6.02
RFX1MA0509.2chr4:35916775-35916791CGTTGTCATGGAAACG+7.24
RFX1MA0509.2chr4:35916775-35916791CGTTGTCATGGAAACG-7.25
RFX2MA0600.2chr4:35916775-35916791CGTTGTCATGGAAACG+6.93
RFX2MA0600.2chr4:35916775-35916791CGTTGTCATGGAAACG-7.03
RFX3MA0798.1chr4:35916775-35916791CGTTGTCATGGAAACG+6.74
RFX3MA0798.1chr4:35916775-35916791CGTTGTCATGGAAACG-7.01
RFX4MA0799.1chr4:35916775-35916791CGTTGTCATGGAAACG+6.51
RFX4MA0799.1chr4:35916775-35916791CGTTGTCATGGAAACG-7.14
RFX5MA0510.2chr4:35916775-35916791CGTTGTCATGGAAACG+6.23
RFX5MA0510.2chr4:35916775-35916791CGTTGTCATGGAAACG-6.44
Enhancer Sequence
CTAACCGATG GCCCACCCGG TGATGTTTTT AATGTTGTTG GCTGTTCTGT ACCTGATATA 60
AGTACTTTTG TTTAACACTT TTTACATTTT AAACAAATGA GGCACTAAAT AAAAATATAG 120
TTATTAATAA AAGCAAAGTT TAGTAAATAA AACTACAAGA GGTTTTAAAT ATAACAGGTT 180
ATTATTAAAA CAAAACAAAA TTAAGTTTAA AAATCAAGAT TTAATATTAA ATGTCATTAT 240
TTAATATGTT TATGAGTTGT TTAAATGTTT ATGTAAATGC TGCGTGACTT TAAAGTGTCC 300
ATTACCGAGC CCCATTCAAG CACTGCAGCA GAGAGCGTTG TCATGGAAAC GGAGCAACGA 360
CACGACACCT GACCGTCAAC AGCACTTTTC TCATGCGGCA GTTTTCACTA ATTTCAGGTA 420
AGTTTAGTCG CTAAAATCAA GCAAATGTTA CATATAACTG TTTCTGACAC TTACTGGTAA 480
TTGACATATT TCTGTTGAAC ATGTTTTTTA TAGAGACTGT TGTGTCTTTG GAAAAAGTCC 540
GTTAGAGTCT TAGCAGAGGT AACGTTAGCA TTAGGCTAAG TTAGACTGCG GTCAAGCCAG 600
CCGCGGTTCG GAAAAACACA GTCAAGCCAG CCGCGCTTTA TATTTTGGTG CGCGCGTATT 660
ATTATCATTA CGGTAATGTC AGCAGCCACA CAGAGAGCGC TCCACAGAGC ACCCATTTCG 720
CCCAGAACAG AGAGATGACA ACGAAATTTA AGTTTATCCC CCTTTCCTCC CACGTATGCT 780
TTATTAAACA ATTTATTAGC TTTTTTGACT GTTGTTATTT TAAGAAATTG GTTTCTGGGC 840
TTACCTTTAA TTTCCTCAAG TCTATCTTTT TGCTTCAAAT GATTTTATAG CAGATCAAAC 900
GGACAGAATA AATATACGAT TTCTAAATAC ACAGAATGCG TTTCTACTTC TCCTAGCCAA 960
CTACAGTACA TTGCAAATAA AGTTGAATGC AGTTTTATAC ATCGTGCCTA ACCTCAGAAA 1020
GTGAAAACAA TCATAAAGTA GTCCAACATA GCATTGTTTA AGTTACAAAT ATATGTTGGT 1080
TTTATTTAAA GGGTATTTAA AAATGTATGC TTCTTTCAGT ATATGGGATA TGGGGCATTA 1140
TTACACTTTA GATGACTGTA AAGACCTTAT TATTTGTTAT AAGTAGAATA GAACAACAAT 1200
AAGATCGATG CAGGAAGTCA AATACTAAGC ATACATCATA TGAAGCCTGT TTTATTGCAG 1260
CATTTTGGAG AAATGTACCA TTAACACACT TTAAAGTGCT ATAAAGAAAT AAGTAGAAAA 1320
AA 1322